27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2525 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2525  transcription factor WhiB  100 
 
 		 106 aa  214  4e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000638956  hitchhiker  0.00038585 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2729  transcription factor WhiB  82.08 
 
 		 106 aa  182  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000363198  hitchhiker  0.00289108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4384  transcription factor WhiB  37.04 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1517  transcription factor WhiB  38.33 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.522616  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7795  transcription factor WhiB  36.67 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.360781 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19130  Transcription factor WhiB  35.71 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.1144 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4118  transcription factor WhiB  36.36 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07550  Transcription factor WhiB-like protein  36.36 
 
 		 130 aa  44.7  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.873436 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3493  transcription factor WhiB  36.36 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.158486  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3044  transcription factor WhiB  32.91 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.539558  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3737  transcription factor WhiB  31.34 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0174753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0239  transcription factor WhiB  37.68 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3478  transcription factor WhiB  34.67 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.712912  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3695  transcription factor WhiB  38.57 
 
 		 85 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0717  transcription factor WhiB  40.35 
 
 		 129 aa  41.6  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1181  transcription factor WhiB  36.36 
 
 		 126 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128357 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4659  transcription factor WhiB  36.36 
 
 		 97 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.161775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0560  transcription factor WhiB  41.38 
 
 		 83 aa  42  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.824957 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1883  putative regulatory protein  37.1 
 
 		 99 aa  41.2  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264414  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0328  transcription factor WhiB  35.29 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13219  transcriptional regulatory protein whib-like whiB7  34.55 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.448854 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27540  Transcription factor WhiB-like protein  34.25 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1809  transcription factor WhiB  36.36 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3449  hypothetical protein  37.93 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2908  transcription factor WhiB  37.93 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.224959  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2805  transcription factor WhiB  33.75 
 
 		 99 aa  40.4  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188246  normal  0.210828 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8306  transcription factor WhiB  36.92 
 
 		 84 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161409  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>