118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3493 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3493  transcription factor WhiB  100 
 
 		 122 aa  248  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.158486  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13219  transcriptional regulatory protein whib-like whiB7  66.22 
 
 		 92 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.448854 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1809  transcription factor WhiB  67.12 
 
 		 91 aa  106  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1410  transcription factor WhiB  60.24 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842377  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1428  transcription factor WhiB  60.24 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.52297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1464  transcription factor WhiB  60.24 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4659  transcription factor WhiB  73.77 
 
 		 97 aa  100  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.161775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27540  Transcription factor WhiB-like protein  61.11 
 
 		 134 aa  100  9e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11410  Transcription factor WhiB-like protein  65.75 
 
 		 97 aa  98.2  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.909585  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3044  transcription factor WhiB  70.49 
 
 		 99 aa  96.7  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.539558  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1770  transcription factor WhiB  55.7 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07550  Transcription factor WhiB-like protein  60.87 
 
 		 130 aa  96.7  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.873436 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0929  transcription factor WhiB  62.86 
 
 		 139 aa  95.9  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1587  transcription factor WhiB  69.35 
 
 		 88 aa  95.5  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00114903  normal  0.301074 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3737  transcription factor WhiB  65.57 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0174753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4118  transcription factor WhiB  63.93 
 
 		 120 aa  92.8  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4384  transcription factor WhiB  62.9 
 
 		 135 aa  92.8  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3790  transcription factor WhiB  61.9 
 
 		 96 aa  87  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.449427  normal  0.631294 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1517  transcription factor WhiB  61.67 
 
 		 107 aa  86.7  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.522616  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2963  transcription factor WhiB  62.3 
 
 		 87 aa  84.7  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.21124  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7795  transcription factor WhiB  54.1 
 
 		 113 aa  84  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.360781 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4230  transcription factor WhiB  64.06 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0788  transcription factor WhiB  59.02 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0936  transcription factor WhiB  54.41 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000309133  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0717  transcription factor WhiB  55.74 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19130  Transcription factor WhiB  53.62 
 
 		 96 aa  80.1  0.000000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.1144 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1181  transcription factor WhiB  56.67 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128357 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3526  transcription factor WhiB  49.32 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000325295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8356  hypothetical protein  58.33 
 
 		 89 aa  77  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.438015  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3740  transcription factor WhiB  53.97 
 
 		 83 aa  75.9  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0269077  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0532  putative DNA-binding protein  52.38 
 
 		 93 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3804  transcription factor WhiB  53.23 
 
 		 92 aa  72.8  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.758516  normal  0.020426 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0566  transcription factor WhiB  42.62 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.656098  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1766  transcription factor WhiB  49.12 
 
 		 80 aa  51.2  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6686  hypothetical protein  45.76 
 
 		 104 aa  50.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.429738  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0328  transcription factor WhiB  44.9 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1721  transcription factor WhiB  38.36 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0428  transcription factor WhiB  38.1 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.229171 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5364  transcription factor WhiB  44.07 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2151  transcription factor WhiB  28.57 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.133785  normal  0.062775 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2291  transcription factor WhiB  28.57 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1883  putative regulatory protein  44.64 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264414  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0457  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2241  transcription factor WhiB  46.43 
 
 		 104 aa  47  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.105854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2326  transcription factor WhiB  41.07 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12870  Transcription factor WhiB  38.57 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2347  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00874285  hitchhiker  0.00000418594 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1162  transcription factor WhiB  40.35 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1179  transcription factor WhiB  40.35 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1189  transcription factor WhiB  40.35 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27842  normal  0.105428 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2525  transcription factor WhiB  35.29 
 
 		 106 aa  45.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000638956  hitchhiker  0.00038585 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2515  WhiB family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4914  transcription factor WhiB  40.35 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5494  transcription factor WhiB  40.74 
 
 		 90 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0552744  normal  0.028254 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2403  transcription factor WhiB  40.74 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.715181  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0746  transcription factor WhiB  38.78 
 
 		 210 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0327  transcription factor WhiB  61.29 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1506  transcription factor WhiB  38.6 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5308  transcription factor WhiB  38.1 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538653  normal  0.906858 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3765  transcription factor WhiB  38.78 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2003  transcription factor WhiB  44.9 
 
 		 115 aa  44.3  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13450  transcriptional regulatory protein whib-like whiB3  37.5 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000048092  hitchhiker  0.00462059 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20790  transcription factor WhiB  38.78 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.116368  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0901  transcription factor WhiB  39.73 
 
 		 98 aa  44.3  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2805  transcription factor WhiB  44.64 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188246  normal  0.210828 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1816  transcription factor WhiB  38.33 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1232  hypothetical protein  45.1 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353561 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5864  transcription factor WhiB  36.73 
 
 		 213 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507295  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1009  transcription factor WhiB  40.98 
 
 		 160 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7609  transcription factor WhiB  30.59 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1382  transcription factor WhiB  38.78 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0751  transcription factor WhiB  38.78 
 
 		 85 aa  43.9  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.393905  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4172  transcription factor WhiB  38.78 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.632092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0266  transcription factor WhiB  38.18 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4070  transcription factor WhiB  38.78 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233037  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1192  transcription factor WhiB  37.04 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0679165  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0560  transcription factor WhiB  32.88 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.824957 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0761  hypothetical protein  40.82 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000133988  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8911  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2729  transcription factor WhiB  34.55 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000363198  hitchhiker  0.00289108 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3301  transcription factor WhiB  36.73 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.70725  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13289  transcriptional regulatory protein whib-like whiB2  36.73 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0737  transcription factor WhiB  39.74 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239855  normal  0.120056 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1184  transcription factor WhiB  36.73 
 
 		 108 aa  42  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1263  transcription factor WhiB  37.04 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000566735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3478  transcription factor WhiB  41.38 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.712912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08190  transcription factor WhiB  37.04 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1861  transcription factor WhiB  38.78 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.254853  hitchhiker  0.00875656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0461  transcription factor WhiB  44.9 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.459049 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0947  transcription factor WhiB  34.69 
 
 		 85 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4353  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 106 aa  41.6  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4662  transcriptional regulatory protein WhiB-like WhiB2  36.73 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.160816 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4795  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 106 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0837605 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4303  transcription factor WhiB  36.73 
 
 		 112 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.956694  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36240  transcription factor WhiB  40.74 
 
 		 98 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.917187 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07590  Transcription factor WhiB  46.94 
 
 		 99 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.882581  normal  0.470516 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0196  transcription factor WhiB  44.9 
 
 		 102 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.838219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1794  transcription factor WhiB  48.39 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000467073  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4922  transcription factor WhiB  44.9 
 
 		 157 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09060  transcription factor WhiB  36.73 
 
 		 111 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.039305  normal  0.196781 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>