153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2151 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2291  transcription factor WhiB  100 
 
 
121 aa  254  3e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2151  transcription factor WhiB  100 
 
 
121 aa  254  3e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.133785  normal  0.062775 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1192  transcription factor WhiB  47.27 
 
 
181 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0679165  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1263  transcription factor WhiB  47.27 
 
 
177 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000566735 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0751  transcription factor WhiB  44.64 
 
 
85 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.393905  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05270  Transcription factor WhiB  43.64 
 
 
176 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.463527  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0746  transcription factor WhiB  39.66 
 
 
210 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0457  transcription factor WhiB  41.82 
 
 
106 aa  55.5  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0155662  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5864  transcription factor WhiB  38.98 
 
 
213 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507295  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2515  WhiB family transcriptional regulator  35.44 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2403  transcription factor WhiB  40 
 
 
110 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.715181  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1325  transcription factor WhiB  38.36 
 
 
129 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19841  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1770  transcription factor WhiB  32.43 
 
 
102 aa  54.3  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1342  transcription factor WhiB  38.36 
 
 
129 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1361  transcription factor WhiB  38.36 
 
 
129 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.373176  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4070  transcription factor WhiB  41.07 
 
 
87 aa  54.3  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233037  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09060  transcription factor WhiB  41.82 
 
 
111 aa  53.9  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.039305  normal  0.196781 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1184  transcription factor WhiB  36.99 
 
 
108 aa  53.9  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1206  transcription factor WhiB  38.98 
 
 
105 aa  53.9  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.56216 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6331  transcription factor WhiB  41.07 
 
 
102 aa  53.9  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0016166  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3765  transcription factor WhiB  35.06 
 
 
95 aa  53.9  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1165  WhiB family transcriptional regulator  40 
 
 
68 aa  53.5  0.0000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.797116  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31070  transcription factor WhiB  41.07 
 
 
95 aa  53.5  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  0.666972 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08530  transcription factor WhiB  41.82 
 
 
88 aa  53.5  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.590298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1382  transcription factor WhiB  40 
 
 
86 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20790  transcription factor WhiB  40 
 
 
99 aa  53.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.116368  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1411  transcription factor WhiB  41.82 
 
 
84 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3301  transcription factor WhiB  37.5 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.70725  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0586  transcription factor WhiB  32.1 
 
 
90 aa  52.4  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.470912 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0244  transcription factor WhiB  34.33 
 
 
101 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0908523  hitchhiker  0.00374189 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4662  transcriptional regulatory protein WhiB-like WhiB2  37.29 
 
 
96 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.160816 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1861  transcription factor WhiB  39.66 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.254853  hitchhiker  0.00875656 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13289  transcriptional regulatory protein whib-like whiB2  37.5 
 
 
123 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7609  transcription factor WhiB  40 
 
 
103 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2549  transcription factor WhiB  38.98 
 
 
108 aa  51.6  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0947  transcription factor WhiB  37.29 
 
 
85 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0737  transcription factor WhiB  31.33 
 
 
100 aa  51.6  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239855  normal  0.120056 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0761  hypothetical protein  41.82 
 
 
99 aa  51.6  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000133988  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4729  transcription factor WhiB  36.99 
 
 
133 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0996749  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4303  transcription factor WhiB  37.93 
 
 
112 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.956694  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2347  transcription factor WhiB  40 
 
 
108 aa  50.8  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00874285  hitchhiker  0.00000418594 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1734  transcription factor WhiB  36.99 
 
 
133 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.740577 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4172  transcription factor WhiB  37.5 
 
 
92 aa  50.4  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.632092  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1809  transcription factor WhiB  33.33 
 
 
91 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3459  transcription factor WhiB  40.38 
 
 
164 aa  50.1  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3737  transcription factor WhiB  33.33 
 
 
120 aa  50.1  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0174753  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4118  transcription factor WhiB  30.93 
 
 
120 aa  50.4  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13219  transcriptional regulatory protein whib-like whiB7  32.31 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.448854 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0764  hypothetical protein  35.94 
 
 
92 aa  49.7  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0534059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5364  transcription factor WhiB  35.38 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1162  transcription factor WhiB  34.78 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1179  transcription factor WhiB  34.78 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1506  transcription factor WhiB  34.78 
 
 
96 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1189  transcription factor WhiB  34.78 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27842  normal  0.105428 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4914  transcription factor WhiB  34.78 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3850  transcription factor WhiB  38.18 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146989  normal  0.0930032 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0929  transcription factor WhiB  32.26 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04680  Transcription factor WhiB  32.53 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0245221  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1766  transcription factor WhiB  36.36 
 
 
80 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07590  Transcription factor WhiB  34.38 
 
 
99 aa  48.1  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.882581  normal  0.470516 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4184  transcription factor WhiB  33.87 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5161  transcription factor WhiB  33.33 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0936  transcription factor WhiB  34.62 
 
 
109 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000309133  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4659  transcription factor WhiB  31.58 
 
 
97 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.161775  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4081  transcription factor WhiB  32.05 
 
 
85 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1587  transcription factor WhiB  35.71 
 
 
88 aa  47.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00114903  normal  0.301074 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1303  transcription factor WhiB  35.38 
 
 
118 aa  47  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00139709  normal  0.234625 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3804  transcription factor WhiB  36 
 
 
92 aa  47  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.758516  normal  0.020426 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1816  transcription factor WhiB  33.8 
 
 
95 aa  47.4  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4138  transcription factor WhiB  35.38 
 
 
113 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000204741  hitchhiker  0.000082655 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0532  putative DNA-binding protein  38 
 
 
93 aa  46.2  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1410  transcription factor WhiB  29.82 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842377  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1517  transcription factor WhiB  34.62 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.522616  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1428  transcription factor WhiB  29.82 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.52297  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0901  transcription factor WhiB  33.33 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1464  transcription factor WhiB  29.82 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1009  transcription factor WhiB  35.94 
 
 
160 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3478  transcription factor WhiB  32.81 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.712912  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3493  transcription factor WhiB  31.58 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.158486  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2963  transcription factor WhiB  34 
 
 
87 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.21124  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3701  transcription factor WhiB  30.77 
 
 
85 aa  45.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.853386  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13450  transcriptional regulatory protein whib-like whiB3  30.43 
 
 
102 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000048092  hitchhiker  0.00462059 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27540  Transcription factor WhiB-like protein  30.77 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3044  transcription factor WhiB  34.62 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.539558  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1721  transcription factor WhiB  31.94 
 
 
98 aa  45.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3716  transcription factor WhiB  35.8 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2588  transcription factor WhiB  31.34 
 
 
100 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.536845  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11410  Transcription factor WhiB-like protein  31.82 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.909585  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3740  transcription factor WhiB  34 
 
 
83 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0269077  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3521  transcription factor WhiB  33.33 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.922627  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4685  transcription factor WhiB  33.87 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.067273  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3526  transcription factor WhiB  34.55 
 
 
110 aa  44.7  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000325295  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4384  transcription factor WhiB  32.14 
 
 
135 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3695  transcription factor WhiB  32.47 
 
 
85 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2428  transcription factor WhiB  32.26 
 
 
82 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0248612 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6289  transcription factor WhiB  33.87 
 
 
84 aa  45.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0317  transcription factor WhiB  32.14 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7485  transcription factor WhiB  34.85 
 
 
114 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8356  hypothetical protein  32 
 
 
89 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.438015  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3790  transcription factor WhiB  28.07 
 
 
96 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.449427  normal  0.631294 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>