180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3846 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3846  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 274 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.12659  normal  0.0198075 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2549  UspA domain-containing protein  72.22 
 
 		 271 aa  375  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12065  hypothetical protein  46.24 
 
 		 279 aa  187  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1382  UspA domain-containing protein  39.29 
 
 		 280 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.670048  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4127  hypothetical protein  45 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4202  UspA domain-containing protein  45 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.500093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4358  UspA domain-containing protein  45 
 
 		 261 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.182676 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12643  hypothetical protein  39.31 
 
 		 272 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13155  hypothetical protein  42.08 
 
 		 268 aa  145  5e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.955423 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4995  UspA domain-containing protein  35.87 
 
 		 288 aa  122  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1387  UspA domain-containing protein  33.85 
 
 		 266 aa  122  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.316543  normal  0.887098 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1115  UspA domain-containing protein  32.94 
 
 		 279 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1087  hypothetical protein  32.05 
 
 		 279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.679298  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1105  hypothetical protein  37.5 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1104  UspA domain-containing protein  32.05 
 
 		 279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213631  normal  0.525734 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1122  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.370766 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1134  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0540569  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4991  UspA domain-containing protein  34.6 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  30.63 
 
 		 289 aa  87.8  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  26.1 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4996  UspA domain-containing protein  31.99 
 
 		 246 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  25.85 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  25.85 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  28.72 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  30.63 
 
 		 294 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  30.63 
 
 		 294 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  33.92 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  29.41 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  29.41 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  29.41 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  30.83 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  28.03 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  28.98 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  34.65 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  30.03 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  28.62 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  28.62 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  34.81 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  28.33 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  28.62 
 
 		 292 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  28.62 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  31.13 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  30.69 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  28.72 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1381  UspA domain-containing protein  32.45 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.936765  normal  0.587027 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  27.61 
 
 		 277 aa  68.9  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  33.7 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0660  UspA domain protein  30.14 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  28.21 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  28.37 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  26.96 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1997  UspA domain-containing protein  28.52 
 
 		 386 aa  67  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.297843  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  26.83 
 
 		 288 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  29.5 
 
 		 282 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  29.82 
 
 		 296 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 		 294 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  31.91 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  29.08 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  26.74 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  26.06 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  28.08 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  26.06 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  28.11 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  28.11 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  25.7 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  28.46 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  27.61 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3441  UspA domain-containing protein  30.18 
 
 		 271 aa  62  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118762  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1935  UspA domain protein  32.85 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3004  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  25.41 
 
 		 294 aa  62  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  29.26 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  27.23 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  27.95 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  27.95 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  27.95 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  27.95 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  29.2 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  26.3 
 
 		 323 aa  57  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  24.64 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  28.68 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4828  hypothetical protein  25.09 
 
 		 292 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  26.3 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  27.36 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1402  UspA domain-containing protein  25.99 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  29.44 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  30.07 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  33.51 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  36.84 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4999  UspA domain-containing protein  32.69 
 
 		 296 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3647  UspA domain protein  32.87 
 
 		 183 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000125254  normal  0.0586956 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  26.62 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  23.62 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  33.58 
 
 		 277 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  27.05 
 
 		 287 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0317  UspA domain-containing protein  26.42 
 
 		 298 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22890  universal stress protein UspA-like protein  26.64 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 289 aa  53.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  26.83 
 
 		 290 aa  52.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>