More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3540 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3540  50S ribosomal protein L20  100 
 
 		 129 aa  253  8e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0376723  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2994  50S ribosomal protein L20  93.02 
 
 		 129 aa  237  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170325  normal  0.0515669 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2979  50S ribosomal protein L20  93.02 
 
 		 129 aa  237  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3023  50S ribosomal protein L20  93.02 
 
 		 129 aa  237  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.612405 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3326  50S ribosomal protein L20  93.02 
 
 		 129 aa  237  5e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.356317 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11660  50S ribosomal protein L20  86.05 
 
 		 129 aa  225  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2416  ribosomal protein L20  84.8 
 
 		 126 aa  219  8e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5471  ribosomal protein L20  76.74 
 
 		 129 aa  202  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2383  ribosomal protein L20  79.2 
 
 		 126 aa  199  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1318  ribosomal protein L20  77.34 
 
 		 128 aa  197  5e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231483  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6085  50S ribosomal protein L20  78.23 
 
 		 127 aa  197  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14570  LSU ribosomal protein L20P  76 
 
 		 128 aa  196  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22410  LSU ribosomal protein L20P  78.23 
 
 		 128 aa  195  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25670  LSU ribosomal protein L20P  79.34 
 
 		 125 aa  195  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.826175  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1626  ribosomal protein L20  83.06 
 
 		 128 aa  194  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.75849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5481  ribosomal protein L20  75.97 
 
 		 129 aa  194  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21890  LSU ribosomal protein L20P  76.8 
 
 		 126 aa  194  5.000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.509644  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1105  ribosomal protein L20  79.03 
 
 		 128 aa  193  5.000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0771886  normal  0.917158 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2040  50S ribosomal protein L20  72.87 
 
 		 129 aa  192  9e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0971505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1479  50S ribosomal protein L20  75.2 
 
 		 157 aa  192  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0382376  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2461  50S ribosomal protein L20  73.64 
 
 		 130 aa  190  5e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3054  50S ribosomal protein L20  79.83 
 
 		 121 aa  189  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2846  ribosomal protein L20  81.6 
 
 		 126 aa  189  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0234  50S ribosomal protein L20  73.39 
 
 		 127 aa  186  5.999999999999999e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.163315  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3180  50S ribosomal protein L20  79.46 
 
 		 126 aa  186  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0268094  normal  0.168846 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1482  50S ribosomal protein L20  75.41 
 
 		 153 aa  186  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3069  ribosomal protein L20  72.36 
 
 		 123 aa  182  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0477  ribosomal protein L20  76.61 
 
 		 127 aa  181  3e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3167  ribosomal protein L20  75.97 
 
 		 129 aa  181  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.406841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2141  ribosomal protein L20  74.79 
 
 		 125 aa  180  7e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032438  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2064  50S ribosomal protein L20  74.42 
 
 		 125 aa  179  9.000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0330135  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1267  50S ribosomal protein L20  72.8 
 
 		 124 aa  178  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.369057 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1730  50S ribosomal protein L20  81.25 
 
 		 126 aa  176  8e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00695308  hitchhiker  0.00143351 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3037  ribosomal protein L20  75.44 
 
 		 127 aa  176  8e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.206291  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12270  LSU ribosomal protein L20P  65.65 
 
 		 163 aa  171  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.128357  normal  0.140057 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1877  50S ribosomal protein L20  76.92 
 
 		 130 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.348784 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4142  ribosomal protein L20  72.27 
 
 		 135 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000151582  hitchhiker  0.000263316 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1884  50S ribosomal protein L20  74.17 
 
 		 130 aa  169  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0962334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15180  LSU ribosomal protein L20P  62.39 
 
 		 117 aa  147  5e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00260509  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1381  ribosomal protein L20  62.18 
 
 		 120 aa  147  5e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000161333  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1235  ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 117 aa  147  6e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000439682  normal  0.0943757 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0217  50S ribosomal protein L20  58.82 
 
 		 120 aa  143  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000274969  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0524  ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 119 aa  140  8e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000408752  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2398  ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0041866  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1414  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 117 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000403686  normal  0.489901 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1756  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 121 aa  138  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000228708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05740  LSU ribosomal protein L20P  64.96 
 
 		 117 aa  138  3e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000012199  normal  0.0122872 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1676  ribosomal protein L20  59.13 
 
 		 122 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.021642  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2305  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 117 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00881657  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1313  50S ribosomal protein L20  58.62 
 
 		 117 aa  137  7e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000242462  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1518  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 117 aa  135  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0150794  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1821  LSU ribosomal protein L20P  55.56 
 
 		 117 aa  135  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00014178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0800  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 119 aa  136  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2658  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886061  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  55.56 
 
 		 118 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2625  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 117 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000948958  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4404  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 118 aa  133  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4704  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 118 aa  131  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000111354  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3259  50S ribosomal protein L20  55.56 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000143022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4469  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 118 aa  131  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4304  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 118 aa  131  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.71931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4315  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 118 aa  131  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000569694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4688  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 118 aa  131  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.35886e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4817  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 118 aa  131  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000468944  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4697  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 118 aa  131  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443116  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0556  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 118 aa  131  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000506915  hitchhiker  1.2511e-24 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5320  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05610  ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312556  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4681  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 118 aa  131  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000654651  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1092  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000110509  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1421  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 118 aa  130  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000852478  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0046  ribosomal protein L20  57.14 
 
 		 117 aa  130  5e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0449  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 118 aa  130  6.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370171  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2317  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 118 aa  130  7.999999999999999e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000405852  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2170  ribosomal protein L20  53.33 
 
 		 121 aa  130  9e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00052538  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0939  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748381  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1685  50S ribosomal protein L20  65.62 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2216  ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000311515  normal  0.131567 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  55.93 
 
 		 118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  55.93 
 
 		 118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003713  LSU ribosomal protein L20p  58.12 
 
 		 117 aa  128  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000104464  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  55.93 
 
 		 118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02082  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 117 aa  128  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0710  50S ribosomal protein L20  56.52 
 
 		 117 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000670695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  55.93 
 
 		 118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2227  50S ribosomal protein L20  58.49 
 
 		 117 aa  128  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00200707 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  55.08 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  55.08 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1993  50S ribosomal protein L20  58.49 
 
 		 117 aa  128  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708674  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  55.08 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  55.93 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5553  50S ribosomal protein L20  55.37 
 
 		 125 aa  128  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129523  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  55.17 
 
 		 117 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1223  50S ribosomal protein L20  52.99 
 
 		 117 aa  127  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000332435  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1441  50S ribosomal protein L20  56.78 
 
 		 139 aa  127  5.0000000000000004e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1475  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 119 aa  127  8.000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544649  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  55.08 
 
 		 118 aa  126  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1412  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 119 aa  127  8.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00164339  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  55.08 
 
 		 118 aa  126  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000531022 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>