More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1569 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1569  short chain dehydrogenase  100 
 
 
280 aa  553  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241614  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5189  short chain dehydrogenase  91.04 
 
 
280 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.673008  normal  0.0207924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4606  short chain dehydrogenase  81.16 
 
 
281 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4694  short chain dehydrogenase  81.16 
 
 
281 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.738169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4989  short chain dehydrogenase  81.16 
 
 
281 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.662802 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13520  short chain dehydrogenase  72.83 
 
 
314 aa  378  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0292785 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4058  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.84 
 
 
274 aa  320  9.999999999999999e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.485645  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.25 
 
 
258 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal  0.023925 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.78 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.165575  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.78 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4347  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.41 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1515  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0303752  normal  0.752518 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
254 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597888  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0264  putative short-chain dehydrogenase  38.93 
 
 
262 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0236  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
255 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815339 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 
274 aa  142  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0224  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  36 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.717009 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 
286 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.06 
 
 
247 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 
255 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.844576  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 
252 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2667  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.43 
 
 
249 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000680764  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4043  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 
254 aa  136  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
258 aa  135  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.951594  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 
257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  34.27 
 
 
249 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 
255 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
258 aa  135  8e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13463  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.27 
 
 
246 aa  135  8e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2692  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
272 aa  135  9e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1438  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.77 
 
 
245 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
267 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.49838  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.47 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
260 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0593655  normal  0.256231 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4446  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 
254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.287432  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 
266 aa  132  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1661  glucose 1-dehydrogenase  35.58 
 
 
268 aa  132  6e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218295  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2200  short chain dehydrogenase  29.76 
 
 
256 aa  132  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
255 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136651  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 
266 aa  132  9e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.58 
 
 
284 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.58 
 
 
284 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.940814 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.48 
 
 
248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0136754  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2225  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.18 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4745  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.67 
 
 
254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146753  normal  0.0678899 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 
252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.19 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 
284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690053  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.89 
 
 
258 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
264 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
262 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1551  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.77 
 
 
282 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489545  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4257  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 
262 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
252 aa  130  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 
262 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.47 
 
 
248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3037  short chain dehydrogenase  31.87 
 
 
254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0519224  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5018  short chain dehydrogenase  31.47 
 
 
254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5079  short chain dehydrogenase  31.87 
 
 
260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.703587  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.46 
 
 
246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5842  short chain dehydrogenase  31.47 
 
 
254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443713  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2513  short chain dehydrogenase  32.54 
 
 
256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3870  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.07 
 
 
259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0245  short chain dehydrogenase  32.54 
 
 
256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.864875  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0944  short chain dehydrogenase  32.54 
 
 
256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5273  short chain dehydrogenase  31.87 
 
 
254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.64 
 
 
290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1428  short chain dehydrogenase  32.54 
 
 
256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1625  short chain dehydrogenase  32.54 
 
 
256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2651  short chain dehydrogenase  32.54 
 
 
256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0281  short chain dehydrogenase  32.54 
 
 
256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701558  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0360  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 
249 aa  129  6e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10784  short chain dehydrogenase  35.43 
 
 
248 aa  129  6e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
252 aa  129  6e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1270  Short-chain dehydrogenase  34.98 
 
 
248 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 
255 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.199732  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
254 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496264  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3705  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 
255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.551214  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.87 
 
 
246 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5719  short chain dehydrogenase  31.87 
 
 
254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6105  short-chain dehydrogenase/reductase  34.22 
 
 
265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 
255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  34.14 
 
 
255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 
255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.150517  normal  0.215397 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1734  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3978  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1918  short chain dehydrogenase  32.4 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.633362  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.46 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.52 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3219  short chain dehydrogenase  31.47 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28746  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2807  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1150  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.13 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
256 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>