More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2300 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_2300  PfkB  100 
 
 		 326 aa  668    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.171843 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6055  PfkB domain protein  34.18 
 
 		 312 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0130249  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  31.78 
 
 		 314 aa  133  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  32.24 
 
 		 307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1888  PfkB  33.55 
 
 		 323 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.389987  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5850  ribokinase  36.19 
 
 		 321 aa  125  9e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0735551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0671  PfkB domain protein  27.89 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  29.17 
 
 		 308 aa  124  3e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  29.03 
 
 		 304 aa  123  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  27.67 
 
 		 310 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  31.61 
 
 		 307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  33.33 
 
 		 403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  28.99 
 
 		 398 aa  119  7e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  26.43 
 
 		 310 aa  119  7e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  30.65 
 
 		 309 aa  119  9e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  30.65 
 
 		 309 aa  119  9e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  30.65 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  30.65 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  30.65 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  30.65 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  30.65 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  30.65 
 
 		 314 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  29.87 
 
 		 305 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  30.57 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  29.35 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  29.74 
 
 		 403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  30.32 
 
 		 309 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2205  PfkB  32.31 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.503057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  29.15 
 
 		 317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  30.04 
 
 		 320 aa  114  3e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1976  putative ribokinase  31.38 
 
 		 305 aa  112  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.191043  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  31.31 
 
 		 307 aa  112  8.000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  29.94 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  28.71 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  29.94 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  27.92 
 
 		 340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  26.98 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  27.36 
 
 		 310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  29.62 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  28.39 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  30.03 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  28.94 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  28.8 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  29.41 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  30.23 
 
 		 305 aa  109  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  29.51 
 
 		 305 aa  109  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  28.48 
 
 		 309 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  28.48 
 
 		 309 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  28.48 
 
 		 309 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2121  PfkB  28.53 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.987568  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  28.48 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  28.43 
 
 		 305 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3570  PfkB  31.46 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  27.85 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  28.25 
 
 		 305 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  26.97 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  29.81 
 
 		 424 aa  107  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0083  ribokinase-like domain-containing protein  33.7 
 
 		 324 aa  107  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0187  PfkB domain protein  31.73 
 
 		 327 aa  106  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  31.94 
 
 		 299 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  27.74 
 
 		 304 aa  105  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  27.74 
 
 		 304 aa  105  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  28.48 
 
 		 305 aa  105  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  27.85 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  28.25 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0465  ribokinase  27.96 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0939  ribokinase  26.35 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000942042  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3505  PfkB  26.21 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0053  PfkB domain protein  28.9 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  29 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  28.21 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  32.22 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  27.45 
 
 		 305 aa  103  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  27.67 
 
 		 302 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  27.67 
 
 		 302 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  29.51 
 
 		 309 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  24.04 
 
 		 308 aa  102  7e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  26.6 
 
 		 308 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  28.9 
 
 		 302 aa  102  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  26.52 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  26.89 
 
 		 297 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  26.3 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0696  ribokinase  28.94 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  26.67 
 
 		 301 aa  99.4  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  28.85 
 
 		 315 aa  99.4  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1841  PfkB  28.28 
 
 		 297 aa  99.4  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0519375  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  29.47 
 
 		 302 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  28.06 
 
 		 303 aa  99  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3648  ribokinase  26.37 
 
 		 303 aa  99  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16351  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1094  ribokinase-like domain-containing protein  30.32 
 
 		 296 aa  98.6  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.495819  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  28.34 
 
 		 311 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  27.94 
 
 		 303 aa  98.6  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  28.34 
 
 		 311 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  30.32 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  26.73 
 
 		 304 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  28.03 
 
 		 311 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0069  PfkB domain protein  28.1 
 
 		 299 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1084  PfkB family DNA-binding protein/kinase  27.69 
 
 		 404 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  28.17 
 
 		 310 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7361  ribokinase  26.32 
 
 		 308 aa  97.4  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>