54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4536 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4536  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 557 aa  1060    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.802227  normal  0.151907 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5049  Saccharopine dehydrogenase  88.81 
 
 		 554 aa  909    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.529688 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4996  Saccharopine dehydrogenase  96.57 
 
 		 554 aa  969    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693151  normal  0.884276 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0108  saccharopine dehydrogenase  47.04 
 
 		 550 aa  333  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.566304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4779  saccharopine dehydrogenase  41.79 
 
 		 553 aa  311  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0669  Saccharopine dehydrogenase  39.76 
 
 		 577 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.986243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0723  Saccharopine dehydrogenase  39.72 
 
 		 574 aa  254  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3620  saccharopine dehydrogenase  39.71 
 
 		 527 aa  246  6e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00695172 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1138  putative transmembrane protein  42.7 
 
 		 375 aa  230  4e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03325  saccharopine dehydrogenase  40.49 
 
 		 457 aa  227  4e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1424  potassium efflux system protein  34.28 
 
 		 371 aa  216  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2343  saccharopine dehydrogenase  31.89 
 
 		 376 aa  209  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1797  hypothetical protein  33.16 
 
 		 375 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0455083  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3682  hypothetical protein  31.86 
 
 		 375 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2221  saccharopine dehydrogenase  31.4 
 
 		 375 aa  155  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04871  hypothetical protein  37.22 
 
 		 176 aa  89.4  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2884  hypothetical protein  34.09 
 
 		 176 aa  78.2  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0007  hypothetical protein  26.63 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.870936  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3157  hypothetical protein  35.39 
 
 		 174 aa  75.9  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1076  hypothetical protein  32.24 
 
 		 181 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.376591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  23.14 
 
 		 384 aa  74.3  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0980  hypothetical protein  32.07 
 
 		 181 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213809  normal  0.0628695 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0007  saccharopine dehydrogenase  26.35 
 
 		 387 aa  72  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  23.94 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_7  hypothetical protein  26.55 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1137  hypothetical protein  30.86 
 
 		 180 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  27.33 
 
 		 376 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2482  hypothetical protein  27.53 
 
 		 172 aa  68.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.470104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3456  hypothetical protein  30.73 
 
 		 174 aa  68.2  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.316596  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  22.03 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  26.76 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  34.53 
 
 		 454 aa  60.1  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  31.16 
 
 		 415 aa  56.6  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2888  Saccharopine dehydrogenase  23.6 
 
 		 403 aa  55.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120454 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2095  saccharopine dehydrogenase-like protein  24.1 
 
 		 399 aa  52.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4206  saccharopine dehydrogenase  26.46 
 
 		 371 aa  52  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  37 
 
 		 398 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54890  hypothetical protein  29.33 
 
 		 634 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000285931  unclonable  1.9973799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0748  saccharopine dehydrogenase  25 
 
 		 400 aa  48.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1679  hypothetical protein  26.53 
 
 		 201 aa  47.4  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1814  hypothetical protein  26.53 
 
 		 201 aa  47.4  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.075678  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0285  saccharopine dehydrogenase  21.22 
 
 		 404 aa  47  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  27.42 
 
 		 360 aa  46.6  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0999  saccharopine dehydrogenase  25.38 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0445398  hitchhiker  0.00533099 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5762  Saccharopine dehydrogenase  31.5 
 
 		 355 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1625  hypothetical protein  26.02 
 
 		 201 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.835546  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1859  hypothetical protein  26.02 
 
 		 201 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13439e-35 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0770  saccharopine dehydrogenase  28.5 
 
 		 335 aa  45.4  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2081  saccharopine dehydrogenase  37.14 
 
 		 371 aa  45.4  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.484567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1935  hypothetical protein  23.59 
 
 		 201 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000839063  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2027  saccharopine dehydrogenase  28.91 
 
 		 351 aa  44.7  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0488088  normal  0.664425 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1886  hypothetical protein  26.37 
 
 		 201 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.002494  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0747  saccharopine dehydrogenase  26 
 
 		 403 aa  43.9  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000418334  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03351  Carboxynorspermidine dehydrogenase  24.91 
 
 		 400 aa  43.9  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00142848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>