122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3710 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3710  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 399 aa  825    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4582  glycosyl transferase group 1  56.91 
 
 		 457 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.445074  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3507  glycosyl transferase group 1  44.82 
 
 		 403 aa  263  4e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.89342e-22 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4315  glycosyl transferase group 1  42.16 
 
 		 427 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4346  glycosyl transferase group 1  37.74 
 
 		 413 aa  195  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.795348  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0312  glycosyl transferase, group 1  29.04 
 
 		 380 aa  163  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.018829  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2155  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.824181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4587  glycosyl transferase group 1  27.02 
 
 		 429 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  24.07 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1184  glycosyl transferase, group 1  28.37 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0216  glycosyl transferase, group 1  20.18 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 		 410 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0573  putative glycosyl transferase  26.63 
 
 		 425 aa  54.7  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.478763  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 359 aa  53.1  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 		 440 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.96 
 
 		 409 aa  53.1  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 		 420 aa  52.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 		 420 aa  52.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0578  glycosyl transferase, group 1  32.09 
 
 		 518 aa  51.6  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.941896  normal  0.221198 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  30.68 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1676  glycosyl transferase, group 1  26.88 
 
 		 322 aa  50.8  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 		 768 aa  50.8  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 		 377 aa  50.4  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  29 
 
 		 371 aa  49.7  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1673  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 		 411 aa  49.7  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.272276 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0283  glycosyl transferase group 1  23.68 
 
 		 360 aa  49.7  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 		 426 aa  49.7  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  24.39 
 
 		 369 aa  49.7  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2334  glycosyl transferase, group 1  33.67 
 
 		 376 aa  49.7  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0688579  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  31.93 
 
 		 371 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0454  nitric oxide reductase large subunit  23.33 
 
 		 347 aa  49.3  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0224888  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0522  hypothetical protein  28.75 
 
 		 341 aa  48.9  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  23.03 
 
 		 383 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2329  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 		 419 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0153585 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  33.72 
 
 		 382 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0277  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 373 aa  48.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 		 401 aa  47.8  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 		 378 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0356  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 		 361 aa  47.8  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 		 402 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  34.26 
 
 		 381 aa  47.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1517  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 		 380 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12629  alpha-mannosyltransferase pimA  23.79 
 
 		 378 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1546  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 		 380 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00289117  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1215  imidazoleglycerol phosphate dehydratase  22.47 
 
 		 347 aa  47.8  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  21.59 
 
 		 414 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  26.4 
 
 		 507 aa  47.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  26.19 
 
 		 389 aa  47.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 		 430 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 		 405 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 		 412 aa  47  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 		 387 aa  47  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  22.89 
 
 		 409 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0215  glycosyltransferase  27.13 
 
 		 379 aa  46.6  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  21.93 
 
 		 412 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1739  glycosyl transferase, group 1  32.84 
 
 		 402 aa  46.6  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699985 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1803  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 		 405 aa  46.6  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.143321 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2562  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.88 
 
 		 384 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 		 378 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 		 374 aa  46.2  0.0009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3818  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 		 413 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1461  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 		 362 aa  46.6  0.0009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  26.46 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  21.5 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  29.69 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 		 810 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3261  glycosyl transferase group 1  21.88 
 
 		 394 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.191927  normal  0.145682 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1755  glycosyl transferase group 1  23.41 
 
 		 365 aa  46.2  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02589  Glycosyltransferase  23.84 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.147496  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  23.5 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1248  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  24.9 
 
 		 372 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4182  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  23.26 
 
 		 364 aa  45.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  31.43 
 
 		 442 aa  45.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  20.5 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1182  putative glycosyl transferase  30.43 
 
 		 79 aa  45.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.202119  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  30.91 
 
 		 439 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1893  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 460 aa  45.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  36 
 
 		 389 aa  45.1  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  24.49 
 
 		 372 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2582  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 369 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1385  general glycosylation pathway protein  22.22 
 
 		 346 aa  44.7  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  29.29 
 
 		 346 aa  44.7  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 		 404 aa  45.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  20.8 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2612  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 		 407 aa  44.7  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.198557 
 
 
-
 
NC_002950  PG1682  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.21 
 
 		 420 aa  44.3  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.961392 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  22.81 
 
 		 419 aa  43.9  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 397 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  30.85 
 
 		 381 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  23.44 
 
 		 384 aa  43.5  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  32.53 
 
 		 401 aa  43.5  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4495  glycosyl transferase group 1  23.29 
 
 		 188 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4431  glycosyl transferase group 1  23.29 
 
 		 188 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>