60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3688 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009504  BOV_A0910  putative oxidoreductase  71 
 
 		 438 aa  654    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3688  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  100 
 
 		 439 aa  881    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1387  homoserine dehydrogenase NAD-binding  72.94 
 
 		 438 aa  664    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4118  SAF domain-containing protein  80.05 
 
 		 439 aa  717    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.015504  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0970  oxidoreductase, putative  71.46 
 
 		 438 aa  658    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21014  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1106  putative oxidoreductase, NAD-binding  64.76 
 
 		 441 aa  595  1e-169  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.489404  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2231  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  68.76 
 
 		 443 aa  583  1.0000000000000001e-165  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.469833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3777  SAF domain protein  41.07 
 
 		 430 aa  322  7e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000406038  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1504  dihydrodipicolinate reductase  33.02 
 
 		 430 aa  264  2e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000626794  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2145  SAF domain protein  37.12 
 
 		 453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.342497  hitchhiker  0.000671283 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5191  SAF domain protein  36.74 
 
 		 437 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1114  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.81 
 
 		 437 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.783576  normal  0.181538 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0025  NAD(P)-dependent oxidoreductase  36.61 
 
 		 449 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1654  SAF domain-containing protein  36.61 
 
 		 449 aa  233  5e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3127  SAF domain-containing protein  34.8 
 
 		 437 aa  232  1e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0203233  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2179  SAF domain-containing protein  35.68 
 
 		 449 aa  229  7e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1559  SAF domain-containing protein  36.77 
 
 		 447 aa  226  6e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.712401  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2314  SAF domain-containing protein  32.88 
 
 		 446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3096  SAF domain-containing protein  37 
 
 		 455 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.283143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1545  SAF domain protein  33.26 
 
 		 446 aa  219  8.999999999999998e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4541  SAF domain-containing protein  36.11 
 
 		 441 aa  216  8e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10759  normal  0.775728 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0296  SAF domain protein  34.68 
 
 		 451 aa  215  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4089  dihydrodipicolinate reductase  35.97 
 
 		 435 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3473  oxidoreductase domain protein  33.18 
 
 		 453 aa  213  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0794903  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1713  oxidoreductase-like  32.22 
 
 		 452 aa  213  7e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138694  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0572  SAF domain protein  33.49 
 
 		 429 aa  211  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00218349  normal  0.0588156 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3191  SAF domain protein  35.38 
 
 		 428 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00124464  hitchhiker  0.000220219 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1201  hypothetical protein  35.53 
 
 		 434 aa  207  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6900  SAF domain protein  32.58 
 
 		 452 aa  206  9e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3724  SAF domain protein  33.41 
 
 		 454 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0563  SAF domain-containing protein  32.51 
 
 		 452 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0585583  normal  0.350969 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3605  oxidoreductase domain-containing protein  32.63 
 
 		 450 aa  197  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2547  SAF domain-containing protein  32.29 
 
 		 452 aa  196  7e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4870  SAF domain-containing protein  31.76 
 
 		 453 aa  195  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0758673  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3249  hypothetical protein  30.82 
 
 		 445 aa  192  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1550  SAF domain-containing protein  29.44 
 
 		 446 aa  192  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000710074  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2037  homoserine dehydrogenase  33.64 
 
 		 418 aa  186  5e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0066  homoserine dehydrogenase  32.57 
 
 		 418 aa  185  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1208  homoserine dehydrogenase  34.69 
 
 		 424 aa  179  7e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0880  SAF domain-containing protein  28.89 
 
 		 458 aa  176  9e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2334  homoserine dehydrogenase, NAD-binding protein  30.47 
 
 		 456 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal  0.115253 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1155  oxidoreductase domain protein  27 
 
 		 396 aa  113  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2407  homoserine dehydrogenase NAD-binding  26.55 
 
 		 377 aa  113  6e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3388  SAF domain-containing protein  26.33 
 
 		 467 aa  103  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3141  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  27.76 
 
 		 455 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3729  SAF domain protein  26.57 
 
 		 440 aa  87  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  33.9 
 
 		 437 aa  51.6  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  33.61 
 
 		 435 aa  52.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  33.9 
 
 		 437 aa  51.6  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  27.78 
 
 		 436 aa  47  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  28.81 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1286  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  28.32 
 
 		 461 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  29.66 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  31.5 
 
 		 443 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3206  homoserine dehydrogenase  31.36 
 
 		 453 aa  43.9  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2559  homoserine dehydrogenase  31.36 
 
 		 453 aa  43.9  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  30 
 
 		 443 aa  43.9  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  28.47 
 
 		 448 aa  43.9  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1005  homoserine dehydrogenase  31.43 
 
 		 439 aa  43.5  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  29.92 
 
 		 443 aa  43.1  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>