More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0481 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0481  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
254 aa  524  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0368  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.08 
 
 
248 aa  237  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.585448  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3339  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.77 
 
 
253 aa  231  9e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0689517 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6891  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.36 
 
 
256 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6912  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.97 
 
 
285 aa  212  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131437  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2934  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.55 
 
 
255 aa  210  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0292  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.4 
 
 
290 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0631  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.86 
 
 
333 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1370  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.61 
 
 
331 aa  132  7.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6511  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.57 
 
 
262 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.305352  normal  0.309603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0354  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.06 
 
 
263 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000842665 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.49 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.49 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574629 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.87 
 
 
267 aa  119  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1014  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.108431 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2960  enoyl-CoA hydratase  30.54 
 
 
275 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0393  enoyl-CoA hydratase  30.67 
 
 
295 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.350305  normal  0.0100997 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2823  enoyl-CoA hydratase  30.54 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.40925 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2162  enoyl-CoA hydratase  32.63 
 
 
273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4233  enoyl-CoA hydratase  31.06 
 
 
295 aa  109  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.375859 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0198  enoyl-CoA hydratase  30.93 
 
 
286 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0484  enoyl-CoA hydratase  30.47 
 
 
295 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.056437 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2297  enoyl-CoA hydratase  30.43 
 
 
275 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201677  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2911  enoyl-CoA hydratase  30.43 
 
 
275 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210869  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6254  enoyl-CoA hydratase  29.41 
 
 
275 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.438926 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0420  enoyl-CoA hydratase  30.67 
 
 
275 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.411652  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2926  enoyl-CoA hydratase  29.41 
 
 
275 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal  0.995806 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1700  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.4 
 
 
268 aa  106  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.672867  hitchhiker  0.0000387176 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0439  enoyl-CoA hydratase  31.38 
 
 
275 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0603  enoyl-CoA hydratase  31.38 
 
 
326 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.383469  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0076  enoyl-CoA hydratase  30.25 
 
 
275 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.426099  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3213  enoyl-CoA hydratase  30.25 
 
 
275 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1350  enoyl-CoA hydratase  30.25 
 
 
275 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0835186  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0244  enoyl-CoA hydratase  30.25 
 
 
275 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0110  enoyl-CoA hydratase  30.61 
 
 
277 aa  102  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4486  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.69 
 
 
258 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5704  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4780  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.69 
 
 
258 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4399  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.69 
 
 
258 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.03 
 
 
264 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3006  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.74 
 
 
269 aa  98.2  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0080  enoyl-CoA hydratase  28.69 
 
 
275 aa  98.2  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  32.72 
 
 
268 aa  97.4  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0159  enoyl-CoA hydratase  29.9 
 
 
272 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  31.36 
 
 
262 aa  97.4  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0304  enoyl-CoA hydratase  30.93 
 
 
272 aa  96.7  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  30.91 
 
 
262 aa  96.3  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0363  enoyl-CoA hydratase  29.9 
 
 
249 aa  96.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0166  enoyl-CoA hydratase  29.38 
 
 
272 aa  95.9  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6835  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.66 
 
 
264 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103255  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  30.91 
 
 
267 aa  94  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2705  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.02 
 
 
262 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0515  enoyl-CoA hydratase  29.37 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658249  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1063  enoyl-CoA hydratase  31.63 
 
 
266 aa  93.2  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1822  enoyl-CoA hydratase  31.05 
 
 
269 aa  92  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0818763  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12694  enoyl-CoA hydratase  32.41 
 
 
276 aa  92  8e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311561  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4150  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.49 
 
 
269 aa  92  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.135617  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4553  enoyl-CoA hydratase  32.35 
 
 
261 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0511055  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0321  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  25.93 
 
 
279 aa  88.2  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.303532  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 
266 aa  87.8  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3643  enoyl-CoA hydratase  34.75 
 
 
265 aa  87.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.82 
 
 
270 aa  86.7  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7280  enoyl-CoA hydratase  27.71 
 
 
281 aa  86.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.83721  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5283  enoyl-CoA hydratase  29.02 
 
 
267 aa  85.5  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1991  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.82 
 
 
264 aa  85.1  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.19767  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.73 
 
 
268 aa  85.1  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3993  enoyl-CoA hydratase  38.33 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169816  normal  0.366348 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2750  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.23 
 
 
268 aa  84  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  32.21 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1417  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
258 aa  82.8  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.05 
 
 
256 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  30.96 
 
 
263 aa  83.2  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.62 
 
 
266 aa  82  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  29.44 
 
 
266 aa  82  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.69 
 
 
268 aa  81.3  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.38 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  30.7 
 
 
266 aa  81.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0151  enoyl-CoA hydratase  30.33 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  30.92 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.22 
 
 
259 aa  80.1  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2195  short chain enoyl-CoA hydratase  27.94 
 
 
257 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000647858  hitchhiker  0.00875803 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  28.84 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1840  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15718  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2877  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30 
 
 
273 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0257108  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3804  enoyl-CoA hydratase  27.8 
 
 
255 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726553  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1587  enoyl-CoA hydratase  31.9 
 
 
257 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  28.17 
 
 
263 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3592  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.95 
 
 
262 aa  78.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.205744 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.51 
 
 
287 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.538415 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  28.29 
 
 
263 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2793  carnitinyl-CoA dehydratase  34.13 
 
 
262 aa  78.2  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1563  enoyl-CoA hydratase  31.9 
 
 
257 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.38 
 
 
255 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3892  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.8 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594401  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  32.24 
 
 
265 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.53 
 
 
260 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3818  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.8 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4185  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.75 
 
 
267 aa  77.4  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 
263 aa  77  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.54 
 
 
264 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal  0.988887 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  30.96 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>