More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3292 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014213  Mesil_3292  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  581  1.0000000000000001e-165  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518243 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3726  inner-membrane translocator  64.78 
 
 		 300 aa  322  5e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0694361  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2934  inner-membrane translocator  42.23 
 
 		 297 aa  237  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.84432  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.1 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.1 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0771  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.1 
 
 		 298 aa  229  4e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.171374  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4485  inner-membrane translocator  45.15 
 
 		 295 aa  227  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.19585  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1066  inner-membrane translocator  40.92 
 
 		 297 aa  223  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00641991  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0611  inner-membrane translocator  41.33 
 
 		 300 aa  222  7e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0400  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  39.73 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  40.07 
 
 		 292 aa  219  3e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0266  inner-membrane translocator  40.85 
 
 		 304 aa  217  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0861  inner-membrane translocator  42.41 
 
 		 287 aa  218  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.59 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0612  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 297 aa  216  4e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  36.27 
 
 		 300 aa  216  5e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0933  inner-membrane translocator  41.53 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000263386  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  39.13 
 
 		 292 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0399  branched chain amino acid ABC transporter permease  42.62 
 
 		 294 aa  209  4e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.615306  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  39.19 
 
 		 293 aa  207  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1581  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.57 
 
 		 289 aa  207  2e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000593948  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2501  inner-membrane translocator  41.25 
 
 		 302 aa  205  7e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.123023 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.04 
 
 		 293 aa  205  8e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2239  inner-membrane translocator  39.87 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  36.61 
 
 		 291 aa  203  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3072  inner-membrane translocator  38.44 
 
 		 300 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0461  inner-membrane translocator  35.35 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3328  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166964  normal  0.584188 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  39.46 
 
 		 293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1387  inner-membrane translocator  38.38 
 
 		 294 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0636  inner-membrane translocator  40.86 
 
 		 297 aa  199  5e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000266086  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1675  inner-membrane translocator  39.73 
 
 		 299 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.644536  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2397  inner-membrane translocator  36.81 
 
 		 300 aa  197  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00620383 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  39.6 
 
 		 308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3515  ABC transporter membrane spanning protein  38.11 
 
 		 300 aa  196  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.84 
 
 		 291 aa  194  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5342  inner-membrane translocator  37.93 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0863974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1112  inner-membrane translocator  36.81 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1609  inner-membrane translocator  39.39 
 
 		 299 aa  190  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171183  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  37.58 
 
 		 308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0105  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  37.54 
 
 		 308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  37.05 
 
 		 308 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4058  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  37.22 
 
 		 308 aa  189  5e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5323  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter (permease protein)  36.08 
 
 		 305 aa  189  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.446123 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  37.05 
 
 		 308 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  37.05 
 
 		 319 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  37.05 
 
 		 319 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1470  inner-membrane translocator  40.27 
 
 		 303 aa  189  5e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000609121  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0229  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  38.22 
 
 		 308 aa  189  7e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.689889 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0099  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  37.85 
 
 		 308 aa  189  7e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0521  inner-membrane translocator  36.66 
 
 		 304 aa  188  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.72 
 
 		 319 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1725  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.48 
 
 		 302 aa  187  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  36.72 
 
 		 308 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2031  inner-membrane translocator  37.06 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3871  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  36.59 
 
 		 308 aa  188  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.911793  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1791  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.81 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2115  inner-membrane translocator  38.02 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.592251  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1779  inner-membrane translocator  36.13 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601101  normal  0.644499 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0245  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  36.91 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3667  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  36.91 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.344938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3973  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  36.91 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3104  inner-membrane translocator  37.85 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.60376 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  39.86 
 
 		 290 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  36.91 
 
 		 308 aa  186  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3681  inner-membrane translocator  35.81 
 
 		 305 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.911027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  36.19 
 
 		 308 aa  186  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  36.39 
 
 		 308 aa  185  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.39 
 
 		 308 aa  185  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.39 
 
 		 308 aa  185  7e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  36.79 
 
 		 294 aa  185  8e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1622  inner-membrane translocator  36.25 
 
 		 304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.937087 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1165  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.893809 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1140  inner-membrane translocator  38.02 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125696  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1174  inner-membrane translocator  38.02 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.258715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4277  inner-membrane translocator  38.02 
 
 		 307 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.9657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1157  inner-membrane translocator  38.02 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.197851  normal  0.0247648 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0534  inner-membrane translocator  40.83 
 
 		 290 aa  183  3e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000179103 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1247  inner-membrane translocator  37.38 
 
 		 307 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  37.03 
 
 		 302 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  38.31 
 
 		 319 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3846  inner-membrane translocator  38.66 
 
 		 307 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  37.7 
 
 		 316 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0563  inner-membrane translocator  35.67 
 
 		 306 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0182389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.42 
 
 		 316 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  36.86 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5829  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.38 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903514  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0797  inner-membrane translocator  37.06 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.320354 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.74 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4378  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  36.54 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.42 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4109  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.34 
 
 		 307 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.180327  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2318  inner-membrane translocator  37.13 
 
 		 308 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  36.89 
 
 		 311 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  36.42 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  36.22 
 
 		 338 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3336  inner-membrane translocator  36.42 
 
 		 307 aa  180  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2522  inner-membrane translocator  37.06 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3364  inner-membrane translocator  35.6 
 
 		 309 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.320486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>