More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2804 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2804  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 276 aa  558  1e-158  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.22333 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0661  extracellular solute-binding protein family 3  62.59 
 
 		 279 aa  347  9e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000289878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3149  extracellular solute-binding protein  53.73 
 
 		 281 aa  291  8e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7637  extracellular solute-binding protein, family 3  38.19 
 
 		 290 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9353  amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein, putative  35.46 
 
 		 286 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.663488 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  35.89 
 
 		 281 aa  119  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3557  extracellular solute-binding protein family 3  34.48 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.838933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2775  extracellular solute-binding protein family 3  34.45 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3098  extracellular solute-binding protein family 3  33.05 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38840  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  30.53 
 
 		 272 aa  106  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.621896 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3010  extracellular solute-binding protein  32.11 
 
 		 294 aa  102  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2098  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.63 
 
 		 250 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.230871  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.12 
 
 		 253 aa  99.8  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.63 
 
 		 250 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4284  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.71 
 
 		 250 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1126  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.63 
 
 		 250 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1406  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.63 
 
 		 250 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584446  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4082  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.71 
 
 		 250 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314608  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0329  extracellular solute-binding protein family 3  31.65 
 
 		 282 aa  99.8  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0757  extracellular solute-binding protein  31.09 
 
 		 291 aa  99.4  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.953109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6884  extracellular solute-binding protein family 3  31.6 
 
 		 285 aa  99  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1487  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.63 
 
 		 250 aa  99  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3158  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.63 
 
 		 250 aa  99  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0137955  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.63 
 
 		 250 aa  99  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.71 
 
 		 250 aa  99  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2962  extracellular solute-binding protein  33.75 
 
 		 287 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  33.5 
 
 		 265 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3441  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.24 
 
 		 250 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.3 
 
 		 248 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.3 
 
 		 248 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.3 
 
 		 248 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.3 
 
 		 248 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.3 
 
 		 248 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1918  extracellular solute-binding protein family 3  32.99 
 
 		 248 aa  95.9  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2855  extracellular solute-binding protein  34.12 
 
 		 249 aa  95.5  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00778  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.3 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2831  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  34.3 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0546212  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0875  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  34.98 
 
 		 287 aa  95.1  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00496425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  33.33 
 
 		 265 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2832  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.3 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.220182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0880  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.3 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000245333  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0835  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.3 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000431676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.3 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00795  hypothetical protein  34.3 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  34.27 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.3 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4575  extracellular solute-binding protein  30.09 
 
 		 297 aa  94  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1600  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.98 
 
 		 247 aa  93.6  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1773  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.98 
 
 		 247 aa  93.6  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000148695  normal  0.114873 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.6 
 
 		 247 aa  93.6  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  33.8 
 
 		 264 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  33.8 
 
 		 264 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  30.45 
 
 		 264 aa  93.6  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  33.64 
 
 		 275 aa  93.2  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2537  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.82 
 
 		 248 aa  92.8  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1658  extracellular solute-binding protein  34.16 
 
 		 243 aa  92.8  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000026827  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  30.08 
 
 		 264 aa  92.8  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3756  extracellular solute-binding protein family 3  34.15 
 
 		 265 aa  92.4  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.720347  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4079  extracellular solute-binding protein family 3  34.27 
 
 		 265 aa  92.4  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.711512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3102  extracellular solute-binding protein  34.27 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  31.58 
 
 		 266 aa  91.3  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  30.5 
 
 		 254 aa  91.3  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11360  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  31.6 
 
 		 290 aa  91.7  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.144563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  33.33 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  31.1 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3517  extracellular solute-binding protein family 3  33.17 
 
 		 273 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  31.1 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  31.1 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1298  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.02 
 
 		 247 aa  90.5  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0168  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 		 247 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1479  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.37 
 
 		 247 aa  89.7  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  31.86 
 
 		 284 aa  89.4  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3045  extracellular solute-binding protein  28.64 
 
 		 252 aa  89  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.29813  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 		 277 aa  88.6  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  32.51 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  32.59 
 
 		 250 aa  88.2  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  33.86 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  33 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1706  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.11 
 
 		 252 aa  87.8  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.114527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  33.18 
 
 		 275 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  34.09 
 
 		 257 aa  87.8  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6986  extracellular solute-binding protein family 3  28.81 
 
 		 271 aa  87  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  30.62 
 
 		 266 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  30.62 
 
 		 266 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  29.67 
 
 		 266 aa  87  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  29.67 
 
 		 266 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  30.62 
 
 		 266 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  29.67 
 
 		 266 aa  86.7  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  29.67 
 
 		 266 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1156  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31 
 
 		 248 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  29.67 
 
 		 266 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  29.67 
 
 		 285 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  30.62 
 
 		 266 aa  86.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2764  extracellular solute-binding protein  30.84 
 
 		 275 aa  85.9  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  29.67 
 
 		 285 aa  85.9  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0800  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.36 
 
 		 256 aa  85.9  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38805  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  30.62 
 
 		 266 aa  85.9  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.88 
 
 		 248 aa  85.5  8e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3699  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.73 
 
 		 248 aa  85.5  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0756284  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  32.38 
 
 		 501 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>