More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0102 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0102  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 382 aa  738    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2963  major facilitator superfamily MFS_1  76.86 
 
 		 380 aa  533  1e-150  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1610  major facilitator transporter  39.62 
 
 		 388 aa  227  3e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2594  major facilitator transporter  36.22 
 
 		 395 aa  227  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0645  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 382 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080187  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2437  major facilitator superfamily MFS_1  32.71 
 
 		 396 aa  136  8e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1794  Xaa-Pro dipeptidase  29.09 
 
 		 389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 410 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0817  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0994  major facilitator transporter  32.76 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.198268  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 		 408 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2924  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 388 aa  110  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.755065  normal  0.842149 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5829  major facilitator transporter  28.73 
 
 		 422 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50804  normal  0.878008 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0724  XRE family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 406 aa  107  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0248517  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0670  ProP protein  27.75 
 
 		 386 aa  107  4e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4326  major facilitator superfamily MFS_1  27.02 
 
 		 393 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  26.99 
 
 		 401 aa  107  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3837  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3329  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 410 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.707628 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4112  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 397 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0806371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1116  major facilitator superfamily MFS_1  25.92 
 
 		 410 aa  102  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.298595 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1603  major facilitator superfamily MFS_1  27.52 
 
 		 399 aa  102  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0711095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 		 408 aa  100  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0656  fosmidomycin resistance protein  26.4 
 
 		 403 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.231636  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0649  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 403 aa  100  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2630  fosmidomycin resistance protein  25.91 
 
 		 420 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2819  major facilitator superfamily MFS_1  29.49 
 
 		 389 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401462  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2366  antibiotic MFS transporter, putative  27.18 
 
 		 420 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1166  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 421 aa  100  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6092  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 		 400 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6505  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 		 400 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0720  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 403 aa  99.8  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588429 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2458  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 410 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  28.15 
 
 		 431 aa  99  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2852  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 371 aa  97.8  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0477779  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1478  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 		 402 aa  97.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1115  major facilitator transporter  24.48 
 
 		 415 aa  96.7  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0744  fosmidomycin resistance protein  25.59 
 
 		 416 aa  96.7  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944019  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0419  fosmidomycin resistance protein  25.59 
 
 		 416 aa  96.7  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.423949  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0930  fosmidomycin resistance protein  25.59 
 
 		 416 aa  96.3  8e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1849  fosmidomycin resistance protein  25.59 
 
 		 417 aa  96.3  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1463  fosmidomycin resistance protein  25.59 
 
 		 416 aa  96.3  8e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1672  fosmidomycin resistance protein  25.59 
 
 		 417 aa  96.3  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1694  fosmidomycin resistance protein  25.59 
 
 		 417 aa  96.3  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511968  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2676  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 396 aa  95.9  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.149282  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1308  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 420 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120753  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 402 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2632  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 403 aa  95.1  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224364  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0474  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 398 aa  94  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1519  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 404 aa  93.6  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.496216 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2972  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 422 aa  93.6  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6429  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 403 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0023  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 409 aa  92.8  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3577  hypothetical protein  24.65 
 
 		 421 aa  92.8  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.972735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4025  major facilitator superfamily fosmidomycin resistant protein  24.59 
 
 		 401 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.164373  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4797  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 		 421 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.292232  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3913  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 421 aa  90.1  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1260  fosmidomycin resistance protein  25.93 
 
 		 404 aa  89.7  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0237353  hitchhiker  0.0000222003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3923  major facilitator superfamily MFS_1  24.34 
 
 		 418 aa  89.7  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3033  fosmidomycin resistance protein  25.93 
 
 		 404 aa  89.4  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00068897  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1681  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 402 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1871  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 413 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.565485  hitchhiker  0.00660368 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1226  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 391 aa  88.6  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.184807  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1146  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 406 aa  87.8  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155488  unclonable  0.000000029988 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0541  fosmidomycin resistance protein  26.35 
 
 		 406 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.404971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0546  fosmidomycin resistance protein  26.35 
 
 		 406 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.268965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0539  fosmidomycin resistance protein  26.35 
 
 		 406 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0556  fosmidomycin resistance protein  26.35 
 
 		 406 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.809506 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0600  fosmidomycin resistance protein  26.35 
 
 		 406 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3640  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 		 410 aa  86.7  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4717  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 		 410 aa  86.7  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521537 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2007  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 423 aa  86.7  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.28785 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0571  fosmidomycin resistance protein  26.19 
 
 		 406 aa  86.7  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.652835  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3131  major facilitator superfamily MFS_1  26.19 
 
 		 406 aa  86.7  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0523  fosmidomycin resistance protein  26.19 
 
 		 406 aa  86.7  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3137  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 406 aa  86.7  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.546423  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0556  fosmidomycin resistance protein  26.19 
 
 		 406 aa  86.7  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1340  major facilitator superfamily multidrug (fosmidomycin) efflux transporter  24.47 
 
 		 420 aa  86.3  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3799  fosmidomycin resistance protein  26.81 
 
 		 402 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.319996  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2084  major facilitator superfamily MFS_1  25.61 
 
 		 395 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.942608 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1587  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 412 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00430  predicted fosmidomycin efflux system  26.19 
 
 		 406 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00435  hypothetical protein  26.19 
 
 		 406 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0412  putative fosmidomycin resistance antibiotic resistance transmembrane protein  28.18 
 
 		 411 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  normal  0.519743 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0518  fosmidomycin resistance protein  25.89 
 
 		 406 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2794  major facilitator superfamily MFS_1  24.77 
 
 		 419 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572754  normal  0.513078 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3527  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4835  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 403 aa  85.1  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1844  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1422  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1043  major facilitator transporter  29.54 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605275 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0962  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1444  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1437  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 402 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1320  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296335  hitchhiker  0.000000456317 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1170  major facilitator superfamily MFS_1  29.54 
 
 		 415 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.147511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1977  fosmidomycin resistance protein, putative  26.57 
 
 		 403 aa  82.4  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85297  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0367  permease  24.5 
 
 		 412 aa  82.4  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.32941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1645  major facilitator superfamily MFS_1  26.57 
 
 		 403 aa  82.4  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.849012  hitchhiker  0.000565509 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1690  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 403 aa  82  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>