More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2205 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1785  translation elongation factor aEF-2  47.89 
 
 
736 aa  694    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0976726  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1090  elongation factor EF-2  44.52 
 
 
740 aa  659    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0970791  hitchhiker  0.00132795 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0366  translation elongation factor aEF-2  60.41 
 
 
728 aa  870    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0209  elongation factor EF-2  58.1 
 
 
727 aa  853    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0152  elongation factor EF-2  60.19 
 
 
729 aa  883    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3686  elongation factor EF-2  69.45 
 
 
730 aa  1031    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.913887  normal  0.280674 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0279  elongation factor EF-2  82.47 
 
 
730 aa  1221    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0211327  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0938  elongation factor EF-2  44.07 
 
 
740 aa  645    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2874  elongation factor EF-2  60.74 
 
 
729 aa  877    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2205  elongation factor EF-2  100 
 
 
730 aa  1493    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.909125  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0783  elongation factor EF-2  57.58 
 
 
727 aa  835    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0072  translation elongation factor aEF-2  60.71 
 
 
734 aa  911    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000119399  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2828  elongation factor EF-2  78.39 
 
 
731 aa  1198    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.255319 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0679  elongation factor EF-2  57.55 
 
 
727 aa  854    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1171  elongation factor EF-2  69.73 
 
 
730 aa  1070    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.368378  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0504  elongation factor EF-2  59.78 
 
 
729 aa  863    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.505462  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0084  elongation factor EF-2  47.48 
 
 
736 aa  686    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000102607 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0614  elongation factor EF-2  59.2 
 
 
727 aa  867    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1304  elongation factor EF-2  58.65 
 
 
727 aa  860    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0263  elongation factor EF-2  82.6 
 
 
731 aa  1248    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1613  elongation factor EF-2  77.29 
 
 
732 aa  1129    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.502666 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0820  elongation factor EF-2  69.82 
 
 
730 aa  1041    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2139  elongation factor EF-2  44.38 
 
 
740 aa  644    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0213  elongation factor EF-2  44.52 
 
 
740 aa  647    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.551385 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0613  elongation factor EF-2  46.37 
 
 
734 aa  687    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.472828  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1957  elongation factor EF-2  43.7 
 
 
740 aa  643    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  7.15133e-18 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2168  translation elongation factor aEF-2  59.86 
 
 
728 aa  886    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0748  elongation factor EF-2  44.41 
 
 
730 aa  632  1e-180  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.259195 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66828  Elongation factor  32.3 
 
 
842 aa  408  1.0000000000000001e-112  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35766  predicted protein  37.24 
 
 
828 aa  312  2e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.412602  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  32.25 
 
 
697 aa  290  8e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_52010  predicted protein  35.12 
 
 
848 aa  290  9e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0299674  hitchhiker  0.00863878 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06330  elongation factor 2 (Eurofung)  34.62 
 
 
844 aa  287  4e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174897  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1314  elongation factor G  29.58 
 
 
702 aa  287  4e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00915512  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  31.14 
 
 
695 aa  286  7e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  31.47 
 
 
691 aa  286  1.0000000000000001e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  31.01 
 
 
697 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  31.03 
 
 
692 aa  285  2.0000000000000002e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  31.68 
 
 
692 aa  283  7.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  30.78 
 
 
706 aa  280  6e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  32.93 
 
 
691 aa  280  9e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0960  translation elongation factor G  30.19 
 
 
705 aa  279  1e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000224995  decreased coverage  0.000000000000793105 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  31.12 
 
 
691 aa  279  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  31.12 
 
 
691 aa  279  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  30.26 
 
 
692 aa  278  3e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  29.44 
 
 
689 aa  277  5e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0084  translation elongation factor G  28.73 
 
 
692 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  30.77 
 
 
691 aa  276  1.0000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0357  translation elongation factor G  30.19 
 
 
692 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000142734  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  29.97 
 
 
692 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2081  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  30.23 
 
 
700 aa  275  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  30.96 
 
 
692 aa  274  5.000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  31.08 
 
 
692 aa  273  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0418  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  31.41 
 
 
706 aa  273  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000594856  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1871  elongation factor G  31.25 
 
 
696 aa  273  1e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00956938  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4549  elongation factor G  30.24 
 
 
704 aa  271  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000485563  normal  0.0800773 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  30.62 
 
 
692 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  30.04 
 
 
692 aa  271  4e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0321  elongation factor G  29.95 
 
 
691 aa  270  5e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0832332  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0395  translation elongation factor G  31.63 
 
 
695 aa  271  5e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.408849  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0986  elongation factor G  29.69 
 
 
701 aa  270  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.798274  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1004  elongation factor G  29.69 
 
 
701 aa  270  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.994777  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1014  elongation factor G  29.69 
 
 
701 aa  270  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.203543 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3923  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  30.22 
 
 
703 aa  270  7e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3438  translation elongation factor G  29.64 
 
 
697 aa  270  7e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.0000152425  hitchhiker  0.000196406 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  30.04 
 
 
692 aa  270  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  29.91 
 
 
692 aa  270  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2021  elongation factor G  29.78 
 
 
691 aa  270  8.999999999999999e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0612  elongation factor G  29.4 
 
 
688 aa  269  1e-70  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0876048  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4324  translation elongation factor G  30.46 
 
 
703 aa  269  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  29.91 
 
 
692 aa  269  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  29.91 
 
 
692 aa  269  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  30.73 
 
 
691 aa  269  1e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  29.91 
 
 
692 aa  269  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  29.12 
 
 
691 aa  269  1e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000161111  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  29.77 
 
 
692 aa  269  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  29.91 
 
 
692 aa  269  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  29.77 
 
 
692 aa  269  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  31.22 
 
 
694 aa  268  2e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  31.09 
 
 
694 aa  268  2.9999999999999995e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  30.16 
 
 
692 aa  267  4e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1281  elongation factor G  29.86 
 
 
700 aa  268  4e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.490817  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1182  translation elongation factor G  29.62 
 
 
699 aa  267  5e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.566824  normal  0.0924393 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  30.35 
 
 
691 aa  266  7e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3536  elongation factor G  30.66 
 
 
704 aa  266  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352954  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03191  elongation factor EF-2  30.66 
 
 
704 aa  266  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000806084  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0373  translation elongation factor G  30.66 
 
 
704 aa  266  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000927424  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4649  elongation factor G  30.66 
 
 
704 aa  266  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000344499  normal  0.01673 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03142  hypothetical protein  30.66 
 
 
704 aa  266  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000869539  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3621  elongation factor G  30.66 
 
 
704 aa  266  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000194361  hitchhiker  0.000724432 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3714  elongation factor G  30.66 
 
 
704 aa  266  1e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000497299  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2693  elongation factor G  30.34 
 
 
704 aa  266  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170425 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0373  elongation factor G  30.66 
 
 
704 aa  266  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000419107  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17121  elongation factor G  30.22 
 
 
691 aa  266  1e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.668762  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3809  elongation factor G  30.66 
 
 
704 aa  266  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225417  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17001  elongation factor G  30.22 
 
 
691 aa  265  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0494  elongation factor G  30.97 
 
 
699 aa  265  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00353597  hitchhiker  0.0000000139334 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0324  elongation factor G  30.97 
 
 
699 aa  265  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  29.51 
 
 
692 aa  265  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0289  elongation factor G  29.52 
 
 
698 aa  265  2e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000225468  unclonable  2.3107599999999997e-27 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>