66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2180 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2180  AAA ATPase  100 
 
 		 777 aa  1583    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.520189  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0246  hypothetical protein  32.99 
 
 		 1577 aa  179  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5417  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1698 aa  89.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.265481  normal  0.989313 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2315  hypothetical protein  26.33 
 
 		 1743 aa  84.3  0.000000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0466  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1692 aa  79  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.189828  normal  0.0732856 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  23.06 
 
 		 557 aa  70.1  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  24.21 
 
 		 531 aa  67.4  0.0000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  24.43 
 
 		 564 aa  67.4  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  19.89 
 
 		 508 aa  65.5  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6728  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.07 
 
 		 657 aa  64.3  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2518  hypothetical protein  23.35 
 
 		 1830 aa  62  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.577468  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  24.02 
 
 		 492 aa  62  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  23.3 
 
 		 629 aa  59.7  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1491  hypothetical protein  22.97 
 
 		 1810 aa  58.2  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.45 
 
 		 630 aa  57.8  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.97 
 
 		 629 aa  57.4  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  23.15 
 
 		 520 aa  57  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  22.32 
 
 		 559 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0025  hypothetical protein  25.55 
 
 		 500 aa  54.7  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1131  AAA ATPase  22.87 
 
 		 600 aa  53.9  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1849  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  22.86 
 
 		 511 aa  52.8  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.892343  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  22.92 
 
 		 500 aa  51.6  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1088  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  22.56 
 
 		 1633 aa  51.6  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  23.41 
 
 		 493 aa  51.2  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  23.73 
 
 		 496 aa  50.4  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1259  protein of unknown function DUF87  24.71 
 
 		 540 aa  50.4  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2211  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  35.45 
 
 		 618 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3176  conjugation protein  30.82 
 
 		 1085 aa  49.3  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2544  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  22.46 
 
 		 526 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  24.51 
 
 		 497 aa  48.9  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0444  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  35.94 
 
 		 524 aa  48.5  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0693836  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1395  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  35.45 
 
 		 616 aa  48.9  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0290868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  24.23 
 
 		 497 aa  48.1  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06795  hypothetical protein  25.3 
 
 		 516 aa  48.1  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.207511  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  27.22 
 
 		 557 aa  48.1  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1913  ATPase-like protein  29.17 
 
 		 578 aa  47.8  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0219994  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0751  protein of unknown function DUF87  24.13 
 
 		 499 aa  47.8  0.0009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.14388  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  24.79 
 
 		 497 aa  47.4  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0053  hypothetical protein  23.26 
 
 		 547 aa  47  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.594463 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1337  hypothetical protein  24.6 
 
 		 445 aa  47.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  25.9 
 
 		 616 aa  47  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1825  ATPase-like protein  28.23 
 
 		 1065 aa  47  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.071271 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  24.02 
 
 		 496 aa  47.4  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  22.25 
 
 		 546 aa  46.2  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1716  ATPase-like protein  28.23 
 
 		 1065 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00601254 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1340  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  39.58 
 
 		 515 aa  46.2  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  20.3 
 
 		 523 aa  46.6  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0816  hypothetical protein  21.29 
 
 		 452 aa  46.6  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.723695  normal  0.916322 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2528  AAA ATPase  20.94 
 
 		 621 aa  46.6  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1783  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  22.34 
 
 		 555 aa  46.6  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000734669  normal  0.0773892 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0826  hypothetical protein  22.15 
 
 		 1734 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  24.46 
 
 		 599 aa  45.8  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  25.18 
 
 		 608 aa  45.8  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2581  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.55 
 
 		 2947 aa  45.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  24.24 
 
 		 611 aa  45.4  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2013  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  21.93 
 
 		 533 aa  45.4  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0635  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  29.67 
 
 		 513 aa  45.4  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1467  hypothetical protein  25.66 
 
 		 739 aa  45.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0720  hypothetical protein  26.49 
 
 		 351 aa  44.7  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  23.74 
 
 		 605 aa  44.7  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0343  hypothetical protein  30.97 
 
 		 499 aa  44.3  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0321  hypothetical protein  30.09 
 
 		 499 aa  44.7  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  23.53 
 
 		 544 aa  44.3  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5089  AAA ATPase  22.46 
 
 		 1100 aa  43.9  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0231758  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2768  hypothetical protein  39.58 
 
 		 508 aa  44.3  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4099  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  21.98 
 
 		 530 aa  43.9  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0823505  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>