More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1646 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1646  ABC transporter-related protein  100 
 
 
223 aa  447  1e-125  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1787  ABC transporter related  51.35 
 
 
223 aa  222  4.9999999999999996e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.169214  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1013  ABC transporter related  44.75 
 
 
227 aa  196  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3186  ABC transporter related  42.08 
 
 
232 aa  170  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0133  hypothetical protein  46.24 
 
 
191 aa  155  3e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1927  ABC transporter related  35.86 
 
 
277 aa  108  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0631  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.34 
 
 
294 aa  104  1e-21  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.103866  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1300  ABC transporter related  31.82 
 
 
356 aa  104  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.437284  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1105  ABC transporter related  36.22 
 
 
319 aa  104  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.788183  normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.71 
 
 
403 aa  103  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.800126  normal  0.0150506 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  34.85 
 
 
568 aa  102  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0782  ABC transporter related  34.31 
 
 
356 aa  102  6e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1305  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  32.88 
 
 
353 aa  100  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.4508 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0308  ABC transporter related  32.84 
 
 
360 aa  101  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1697  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  31.19 
 
 
440 aa  101  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000292327  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0715  ABC transporter related  32.84 
 
 
237 aa  100  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl152  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.09 
 
 
406 aa  100  2e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  29.95 
 
 
254 aa  99.8  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0496  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  35.53 
 
 
359 aa  99.8  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0754513  normal  0.366469 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  33.17 
 
 
398 aa  99.8  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1348  ABC transporter related  34.52 
 
 
367 aa  99.8  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  32 
 
 
365 aa  99  5e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1027  ABC transporter related  33.17 
 
 
370 aa  98.2  8e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0361894 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0301  ABC transporter related  31.08 
 
 
386 aa  98.2  8e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  33.5 
 
 
363 aa  98.2  8e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0686  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  30.21 
 
 
364 aa  97.8  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1407  ABC transporter related protein  34.85 
 
 
358 aa  97.1  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.85 
 
 
310 aa  96.7  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1022  ABC transporter related  31.82 
 
 
353 aa  96.3  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1219  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  30.67 
 
 
456 aa  96.7  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.41 
 
 
402 aa  96.3  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  34 
 
 
353 aa  96.3  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2151  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.09 
 
 
279 aa  96.3  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0331117  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0256  ABC transporter-related protein  35.71 
 
 
349 aa  95.9  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  31.34 
 
 
373 aa  95.9  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0137  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.88 
 
 
290 aa  95.9  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  31.9 
 
 
333 aa  95.9  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  33.5 
 
 
342 aa  95.9  5e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0650  ABC transporter related protein  29.58 
 
 
277 aa  95.5  6e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1759  ABC transporter related  31.31 
 
 
353 aa  95.5  6e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0922  ABC transporter related  30.81 
 
 
353 aa  95.1  7e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0317  ABC transporter related  35.35 
 
 
283 aa  95.1  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000872921  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2125  ABC transporter related  39.05 
 
 
272 aa  95.1  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0679248  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1063  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.2 
 
 
284 aa  95.1  8e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0204485  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1159  ABC transporter related  30.21 
 
 
364 aa  94.7  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000201469  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2149  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  31.19 
 
 
453 aa  94.7  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.585974 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.41 
 
 
541 aa  94.7  9e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1181  ABC transporter related  30.21 
 
 
364 aa  94.7  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000170044  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2767  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.05 
 
 
255 aa  94.4  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  31.75 
 
 
370 aa  94.7  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3636  ABC transporter related  30.59 
 
 
286 aa  94.4  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375654  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  30.88 
 
 
367 aa  94.7  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  30.88 
 
 
367 aa  94.7  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0607  ABC transporter related  31.47 
 
 
397 aa  94.4  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0567231 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1074  hypothetical protein  34.16 
 
 
380 aa  94  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  30.2 
 
 
278 aa  94  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  28.91 
 
 
280 aa  94  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00576105  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1555  sulphate transport system permease protein 1  34.11 
 
 
357 aa  93.6  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.824545 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  30.46 
 
 
355 aa  94  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1980  ABC transporter related  28.79 
 
 
355 aa  93.6  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2869  ABC transporter related  31.28 
 
 
361 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0665765 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  31.19 
 
 
356 aa  93.6  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0077  ABC transporter related  33.67 
 
 
347 aa  93.6  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0473465  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0057  tungstate/molybdate transport system ATP-binding protein  30.46 
 
 
312 aa  92.8  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.72588  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2470  ABC transporter related protein  33.63 
 
 
578 aa  93.2  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  30.77 
 
 
355 aa  93.2  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1925  ABC transporter related protein  34.48 
 
 
340 aa  93.2  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3216  ABC transporter related  31.28 
 
 
361 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  32.02 
 
 
384 aa  93.2  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2681  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  32.49 
 
 
344 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.255864  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1152  ABC transporter related  30.46 
 
 
312 aa  93.2  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2939  ABC transporter ATP-binding protein  31.43 
 
 
358 aa  92.8  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.878604  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  30.09 
 
 
280 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.685034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0170  cobalt transporter ATP-binding subunit  30.09 
 
 
280 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000574409  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1701  ABC transporter related  32.86 
 
 
292 aa  92.4  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1905  ABC transporter  35.11 
 
 
232 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.030671  hitchhiker  0.00477686 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  31.19 
 
 
359 aa  92.4  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  28.64 
 
 
356 aa  92.4  5e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2540  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  33.16 
 
 
364 aa  92.4  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.534677 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  30.73 
 
 
278 aa  92.4  5e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0999  ABC transporter related  33.65 
 
 
273 aa  92.4  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0187687  normal  0.71455 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2429  ABC transporter related  32.99 
 
 
276 aa  92  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928129  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  30.19 
 
 
254 aa  92  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  30.49 
 
 
403 aa  92  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.69 
 
 
395 aa  92  6e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0860  ABC transporter related  29.52 
 
 
249 aa  92  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000637207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  29.25 
 
 
300 aa  91.7  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000103896  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  29.25 
 
 
280 aa  92  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000064479  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1454  ABC transporter related  30.05 
 
 
288 aa  92  7e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000218483  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0152  cobalt transporter ATP-binding subunit  29.25 
 
 
280 aa  92  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.00748e-47 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  30.37 
 
 
366 aa  92  7e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0160  cobalt transporter ATP-binding subunit  28.44 
 
 
280 aa  92  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  30.2 
 
 
366 aa  91.7  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6048  ABC transporter-related protein  35.32 
 
 
243 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0164038  normal  0.602445 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  29.25 
 
 
300 aa  91.7  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.27 
 
 
277 aa  91.7  8e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0898  cobalt transporter ATP-binding subunit  30.1 
 
 
286 aa  91.7  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0680  ABC transporter related  30.54 
 
 
309 aa  91.7  8e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24060  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  32.18 
 
 
278 aa  91.7  9e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.569983  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  31.86 
 
 
366 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>