More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0888 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0888  peptidase M24  100 
 
 
397 aa  805    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0261392  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1630  peptidase M24  63.36 
 
 
395 aa  542  1e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.339878 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0541  peptidase M24  62.88 
 
 
397 aa  541  1e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0770334  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0649  Xaa-Pro aminopeptidase  61.93 
 
 
397 aa  537  1e-151  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2614  Xaa-Pro aminopeptidase  62.63 
 
 
397 aa  520  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0612  hypothetical protein  59.19 
 
 
397 aa  509  1e-143  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2216  peptidase M24  58.08 
 
 
397 aa  502  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2163  peptidase M24  57.83 
 
 
397 aa  503  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000118517  normal  0.0215342 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1223  peptidase M24  60.2 
 
 
398 aa  504  1e-141  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0353  peptidase M24  59.85 
 
 
399 aa  499  1e-140  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245255  normal  0.337095 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0162  peptidase M24  57.87 
 
 
399 aa  470  1.0000000000000001e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0565  peptidase M24  47.04 
 
 
397 aa  394  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.245213  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3039  peptidase M24  40.4 
 
 
419 aa  260  4e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0333665 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1734  peptidase M24  38.9 
 
 
407 aa  257  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00987909  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1989  peptidase M24  37.13 
 
 
407 aa  255  9e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.758645  normal  0.208351 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1305  M24 family peptidase  37.59 
 
 
414 aa  247  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.67819  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1008  peptidase M24  34.78 
 
 
408 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.998563  normal  0.0392371 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2186  peptidase M24  34.82 
 
 
396 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0133424  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2005  peptidase M24  34.39 
 
 
400 aa  200  3e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3318  peptidase M24  33.68 
 
 
397 aa  197  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.971608  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3617  peptidase M24  34.9 
 
 
387 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.335337  hitchhiker  0.00408279 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1905  peptidase M24  31.23 
 
 
397 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0678501 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2855  peptidase M24  35.12 
 
 
394 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1321  peptidase M24  34.35 
 
 
398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1765  creatinase  29.35 
 
 
397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2690  peptidase M24  32.39 
 
 
397 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000610449  normal  0.0752644 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1105  xaa-pro dipeptidase  31.77 
 
 
397 aa  181  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.071673  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1380  creatinase  31.33 
 
 
396 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0434846  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1720  peptidase M24  32.88 
 
 
389 aa  180  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000408429  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1377  peptidase M24  33.15 
 
 
388 aa  179  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.209377 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1135  peptidase M24  32.41 
 
 
398 aa  178  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0425552  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1575  creatinase  31.06 
 
 
396 aa  177  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0445015  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1345  peptidase M24  32.88 
 
 
389 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2836  peptidase M24  32.35 
 
 
388 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000117604  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1962  Xaa-Pro aminopeptidase  33.91 
 
 
405 aa  170  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1399  creatinase  29.2 
 
 
402 aa  170  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1813  peptidase M24  32.73 
 
 
385 aa  166  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000026363  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0984  peptidase M24  32.25 
 
 
390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1651  peptidase M24  31.41 
 
 
396 aa  158  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2518  peptidase M24  31.52 
 
 
390 aa  158  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2562  peptidase M24  31.33 
 
 
396 aa  152  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6562099999999997e-21 
 
 
-
 
NC_002950  PG0889  M24 family peptidase  28.39 
 
 
398 aa  146  6e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0452  peptidase M24  28.07 
 
 
361 aa  99  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  27.6 
 
 
365 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  27.6 
 
 
365 aa  94  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  27.6 
 
 
365 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  27.27 
 
 
365 aa  92.8  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl379  Xaa-Pro-dipeptidase  24.67 
 
 
357 aa  92  1e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116957  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  27.27 
 
 
365 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  27.27 
 
 
365 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  27.27 
 
 
365 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  27.27 
 
 
365 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  24.67 
 
 
353 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  27.27 
 
 
365 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  24.67 
 
 
353 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  25.67 
 
 
359 aa  91.7  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  25.4 
 
 
359 aa  90.9  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  27.27 
 
 
365 aa  90.9  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf338  Xaa-Pro aminopeptidase  26.42 
 
 
346 aa  90.5  5e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0464176  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  23.8 
 
 
360 aa  89.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  27.41 
 
 
371 aa  89  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0341  Xaa-Pro peptidase  23.92 
 
 
358 aa  89  1e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0636047  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  25.46 
 
 
351 aa  87.4  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  29.57 
 
 
348 aa  87.4  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  27.68 
 
 
347 aa  87.4  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  25 
 
 
357 aa  87  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  23.6 
 
 
354 aa  86.7  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  26.08 
 
 
359 aa  85.9  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2656  peptidase M24  26.72 
 
 
356 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000248617 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0547  peptidase M24  26.83 
 
 
356 aa  85.1  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.600524  normal  0.382783 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1560  peptidase M24  27 
 
 
356 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  25.34 
 
 
351 aa  84.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  25.34 
 
 
351 aa  84.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1224  peptidase M24  23.78 
 
 
355 aa  84.7  0.000000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  27.15 
 
 
348 aa  84  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0248  peptidase M24  28.63 
 
 
366 aa  84  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  24.14 
 
 
364 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  24.44 
 
 
365 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1652  peptidase M24  26.26 
 
 
363 aa  82.4  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.329498  hitchhiker  0.00124152 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  27.92 
 
 
376 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  29.89 
 
 
376 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  25.96 
 
 
369 aa  80.5  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  28.43 
 
 
367 aa  79.7  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  25.58 
 
 
356 aa  80.1  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0435  proline dipeptidase  26.85 
 
 
368 aa  79.7  0.00000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000870779  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1282  peptidase M24  27.15 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  21.89 
 
 
353 aa  79.7  0.00000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1724  peptidase M24  23.16 
 
 
354 aa  79  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0292375 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2021  xaa-pro dipeptidase  27.66 
 
 
355 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.812333  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  26.03 
 
 
378 aa  79.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0543  Mername-AA019 peptidase  27.12 
 
 
365 aa  79  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0982  peptidase M24  28.87 
 
 
357 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000249313  normal  0.0334908 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  27.95 
 
 
384 aa  79  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1321  peptidase M24  27.27 
 
 
356 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1610  peptidase M24  25.59 
 
 
354 aa  79  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.75509 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2086  peptidase M24  26.73 
 
 
323 aa  77.8  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.165828 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  29.63 
 
 
380 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  29.63 
 
 
380 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0848  peptidase M24  25.25 
 
 
359 aa  77  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00339348  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21880  Xaa-Pro aminopeptidase  31.18 
 
 
382 aa  77  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122866  normal  0.121364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>