42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2004 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2004  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 141 aa  286  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1685  cupin 2 domain-containing protein  96.45 
 
 		 141 aa  256  6e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1804  cupin 2 domain-containing protein  80.3 
 
 		 148 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1177  Cupin 2 conserved barrel domain protein  79.55 
 
 		 152 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1566  cupin 2 domain-containing protein  72.14 
 
 		 141 aa  210  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.826475  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4362  Cupin 2 conserved barrel domain protein  69.5 
 
 		 153 aa  201  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.951777 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1874  Cupin 2 conserved barrel domain protein  62.41 
 
 		 142 aa  174  5e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.935294 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0577  cupin 2 domain-containing protein  60 
 
 		 139 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0587  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60 
 
 		 139 aa  150  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.90971 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0551  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.2 
 
 		 139 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.807584 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2974  cupin 2 domain-containing protein  44.36 
 
 		 152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.19982  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5012  hypothetical protein  50 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120588  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4417  cupin:cupin region  37.84 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  41.94 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17550  putative transcriptional regulator with cupin domain  41.79 
 
 		 200 aa  47.4  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  36.51 
 
 		 129 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1864  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.9 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  41.94 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4456  hypothetical protein  38.1 
 
 		 129 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0285903  normal  0.0443513 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  29.87 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.7 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1468  cupin 2 domain-containing protein  35.56 
 
 		 190 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1011  hypothetical protein  36.36 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0220  hypothetical protein  32.26 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.07 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0837  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.7 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  30.95 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.7 
 
 		 163 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.78 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  37.33 
 
 		 171 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0817  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.49 
 
 		 257 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 197 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.78 
 
 		 332 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.52 
 
 		 172 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  35.94 
 
 		 163 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1474  hypothetical protein  35.06 
 
 		 154 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208655  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4715  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5234  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 172 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0933989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.13 
 
 		 171 aa  40  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  28.12 
 
 		 108 aa  40  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>