More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1013 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1013  YHS domain protein  100 
 
 		 282 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2554  heavy metal translocating P-type ATPase  75.89 
 
 		 786 aa  385  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00876306 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0177  heavy metal translocating P-type ATPase  62.3 
 
 		 755 aa  297  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.963495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  61.24 
 
 		 823 aa  296  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1098  copper-translocating P-type ATPase  60.47 
 
 		 806 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0763477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1836  heavy metal translocating P-type ATPase  54.12 
 
 		 794 aa  287  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  52.36 
 
 		 795 aa  287  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4130  copper-translocating P-type ATPase  60.24 
 
 		 799 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  57.36 
 
 		 787 aa  280  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7880  heavy metal translocating P-type ATPase  54.58 
 
 		 788 aa  279  4e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862817  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2307  copper-translocating P-type ATPase  54.95 
 
 		 783 aa  277  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  53.41 
 
 		 801 aa  268  5.9999999999999995e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  54.01 
 
 		 818 aa  265  5e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2429  copper-translocating P-type ATPase  53.68 
 
 		 773 aa  263  3e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1000  heavy metal translocating P-type ATPase  58.82 
 
 		 809 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.111426 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4834  heavy metal translocating P-type ATPase  52.29 
 
 		 796 aa  259  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.311359  normal  0.100077 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3091  copper-translocating P-type ATPase  55.98 
 
 		 868 aa  259  4e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344658  normal  0.403922 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2544  heavy metal translocating P-type ATPase  52.96 
 
 		 787 aa  259  4e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.874956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3434  heavy metal translocating P-type ATPase  51.74 
 
 		 833 aa  255  7e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3871  heavy metal translocating P-type ATPase  55.12 
 
 		 908 aa  254  9e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  52.73 
 
 		 804 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0911  heavy metal translocating P-type ATPase  48.51 
 
 		 831 aa  252  6e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4911  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 		 793 aa  249  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  54.47 
 
 		 1020 aa  246  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2142  heavy metal translocating P-type ATPase  55.12 
 
 		 781 aa  246  3e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000033244  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1480  heavy metal translocating P-type ATPase  54.12 
 
 		 811 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1856  heavy metal translocating P-type ATPase  51.78 
 
 		 973 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.121057  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3818  heavy metal translocating P-type ATPase  54.47 
 
 		 895 aa  242  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1072  heavy metal translocating P-type ATPase  51.56 
 
 		 755 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9859  copper-translocating P-type ATPase  61.11 
 
 		 737 aa  233  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0180  copper-translocating P-type ATPase  47.72 
 
 		 801 aa  233  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2453  heavy metal translocating P-type ATPase  54.05 
 
 		 765 aa  232  6e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0206  copper-transporting P-type ATPase  52.61 
 
 		 821 aa  226  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  48.29 
 
 		 846 aa  225  5.0000000000000005e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0131  copper-translocating P-type ATPase  51.87 
 
 		 786 aa  223  4e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0671969  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1258  heavy metal translocating P-type ATPase  46.32 
 
 		 778 aa  223  4e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3533  heavy metal translocating P-type ATPase  45.88 
 
 		 786 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4609  heavy metal translocating P-type ATPase  45.88 
 
 		 786 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4547  heavy metal translocating P-type ATPase  45.59 
 
 		 798 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1178  heavy metal translocating P-type ATPase  47.01 
 
 		 796 aa  212  5.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0418  heavy metal translocating P-type ATPase  42.18 
 
 		 816 aa  211  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4302  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 815 aa  210  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2153  heavy metal translocating P-type ATPase  55.15 
 
 		 724 aa  209  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00626662  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  44.6 
 
 		 841 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903237  normal  0.0729123 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0264  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 815 aa  209  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3420  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 815 aa  209  4e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1469  heavy metal translocating P-type ATPase  46.01 
 
 		 777 aa  208  8e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0385  heavy metal translocating P-type ATPase  56.48 
 
 		 729 aa  206  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.530219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0283  copper-translocating P-type ATPase  40.2 
 
 		 807 aa  205  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572876  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0324  copper-translocating P-type ATPase  41.12 
 
 		 842 aa  205  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2230  copper-translocating P-type ATPase  41.12 
 
 		 842 aa  205  7e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3038  copper-translocating P-type ATPase  41.12 
 
 		 842 aa  205  7e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2054  copper-translocating P-type ATPase  41.12 
 
 		 842 aa  205  7e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860111  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0506  copper-translocating P-type ATPase  41.12 
 
 		 807 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1533  heavy metal translocating P-type ATPase  55.94 
 
 		 724 aa  203  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1397  hypothetical protein  52.02 
 
 		 735 aa  202  4e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0446  heavy metal translocating P-type ATPase  44.18 
 
 		 826 aa  202  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7156  heavy metal translocating P-type ATPase  45.72 
 
 		 841 aa  201  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.802165 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3972  heavy metal translocating P-type ATPase  44.8 
 
 		 782 aa  198  9e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16922  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2267  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  45.2 
 
 		 772 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.270801  normal  0.567344 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0311  copper-translocating P-type ATPase  40.79 
 
 		 842 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3504  heavy metal translocating P-type ATPase  49.16 
 
 		 743 aa  197  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2356  hypothetical protein  51.52 
 
 		 736 aa  195  8.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2110  heavy metal translocating P-type ATPase  42.91 
 
 		 776 aa  194  1e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1596  hypothetical protein  50.51 
 
 		 735 aa  193  3e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3368  copper-translocating P-type ATPase  42.69 
 
 		 768 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1712  cation transporting P-type ATPase  43.3 
 
 		 767 aa  189  5.999999999999999e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000183407  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4100  heavy metal translocating P-type ATPase  44.88 
 
 		 785 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0322653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5360  heavy metal translocating P-type ATPase  42.57 
 
 		 797 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.647165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1777  heavy metal translocating P-type ATPase  45.53 
 
 		 814 aa  185  6e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0428003 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6119  copper efflux ATPase CopF  45.16 
 
 		 805 aa  185  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.161419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1587  copper/silver efflux P-type ATPase  44.68 
 
 		 814 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.602341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2599  heavy metal translocating P-type ATPase  46.64 
 
 		 836 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.283973 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0713  heavy metal translocating P-type ATPase  47.6 
 
 		 872 aa  183  3e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185288 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0031  copper-translocating P-type ATPase  44.26 
 
 		 838 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0030  copper-translocating P-type ATPase  44.26 
 
 		 791 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000836932 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0029  copper-translocating P-type ATPase  44.26 
 
 		 795 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.747408  normal  0.269109 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2229  copper-translocating P-type ATPase  41.67 
 
 		 787 aa  182  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.76869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1144  heavy metal translocating P-type ATPase  50.77 
 
 		 851 aa  179  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0307276  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0986  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 810 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1849  heavy metal translocating P-type ATPase  41.82 
 
 		 762 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191422  hitchhiker  0.000000000440646 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2345  heavy metal translocating P-type ATPase  51.28 
 
 		 831 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.541257 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1804  heavy metal translocating P-type ATPase  42.52 
 
 		 806 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.75515 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  37.74 
 
 		 846 aa  177  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563688  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2710  heavy metal translocating P-type ATPase  46.23 
 
 		 835 aa  175  7e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.3034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1742  heavy metal translocating P-type ATPase  38.97 
 
 		 826 aa  174  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5378  heavy metal translocating P-type ATPase  50.25 
 
 		 761 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.269135 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2604  heavy metal translocating P-type ATPase  47.96 
 
 		 735 aa  171  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.335287 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2191  heavy metal translocating P-type ATPase  47.45 
 
 		 780 aa  169  7e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0148  heavy metal translocating P-type ATPase  47.78 
 
 		 730 aa  167  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2020  heavy metal translocating P-type ATPase  38.64 
 
 		 809 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1645  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  45.5 
 
 		 744 aa  163  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.321264 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3603  heavy metal translocating P-type ATPase  44.39 
 
 		 781 aa  162  6e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.385449 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3941  heavy metal translocating P-type ATPase  44.39 
 
 		 781 aa  162  6e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4394  heavy metal translocating P-type ATPase  52.26 
 
 		 715 aa  161  9e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0708  heavy metal translocating P-type ATPase  46.53 
 
 		 736 aa  159  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0087  heavy metal translocating P-type ATPase  37.36 
 
 		 792 aa  158  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.908745  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2964  copper-translocating P-type ATPase  41.07 
 
 		 753 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11723  heavy-metal transporting P-type ATPase  42.64 
 
 		 835 aa  155  5.0000000000000005e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0439709  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  48.02 
 
 		 746 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>