More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0734 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0734  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 		 233 aa  466  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0721  glutamine amidotransferase class-I  96.14 
 
 		 230 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.31334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0692  glutamine amidotransferase class-I  93.56 
 
 		 230 aa  431  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal  0.956702 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0696  glutamine amidotransferase class-I  53.25 
 
 		 231 aa  230  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1842  amidotransferase  40.51 
 
 		 244 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1420  amidotransferase  40.08 
 
 		 243 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3868  amidotransferase  40.51 
 
 		 244 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160036 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1451  amidotransferase  40.51 
 
 		 244 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0770  glutamine amidotransferase class I  43.78 
 
 		 231 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1873  amidotransferase  39.83 
 
 		 242 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1741  amidotransferase  39.41 
 
 		 240 aa  160  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3519  glutamine amidotransferase class-I  38.82 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.307649 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2063  hypothetical protein  38.98 
 
 		 242 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0215338  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42010  amidotransferase  38.14 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3566  amidotransferase  38.14 
 
 		 240 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2587  amidotransferase  36.86 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0493752 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1182  glutamine amidotransferase class-I  37.6 
 
 		 243 aa  145  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  35.59 
 
 		 232 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2529  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  35.74 
 
 		 232 aa  135  5e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.777754 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0888  glutamine amidotransferase class-I  41.03 
 
 		 251 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2175  hypothetical protein  34.62 
 
 		 232 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2203  hypothetical protein  34.19 
 
 		 232 aa  131  9e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4674  amidotransferase, putative  34.75 
 
 		 234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.623837 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1837  glutamine amidotransferase, class I  36.32 
 
 		 226 aa  125  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0599314  normal  0.354168 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1126  glutamine amidotransferase, class I  34.19 
 
 		 237 aa  122  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527906  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2020  glutamine amidotransferase class-I  37.07 
 
 		 225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0376  glutamine amidotransferase class-I  37.07 
 
 		 225 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1396  glutamine amidotransferase class-I  34.32 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0299  glutamine amidotransferase class-I  36.93 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2694  amidotransferase  37.1 
 
 		 233 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0865  glutamine amidotransferase class-I  34.62 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2225  putative glutamine amidotransferase class-I  33.93 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  35.54 
 
 		 244 aa  102  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  33.51 
 
 		 239 aa  92.4  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.997537 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00200  conserved hypothetical protein  26.8 
 
 		 252 aa  87  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.45844 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  32.49 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  32.16 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  34.07 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  34 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  38.36 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3722  glutamine amidotransferase class-I  34.26 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.508189 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00680  cytoplasm protein, putative  31.14 
 
 		 357 aa  79.3  0.00000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.822893  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  35.5 
 
 		 250 aa  78.2  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  32.58 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  32.27 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  34.81 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  31.02 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  29.23 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  34.71 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  32.97 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  31.25 
 
 		 246 aa  72  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  28.72 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  36.36 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  31.18 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1509  glutamine amidotransferase class-I  34.19 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34923  predicted protein  30 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.366717  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  30.77 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  34.02 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  29.08 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  29.76 
 
 		 513 aa  67.4  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  34.72 
 
 		 258 aa  67  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  28.4 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2184  GMP synthase, large subunit  29.95 
 
 		 507 aa  66.6  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.255738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  33.16 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  31.12 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  32.67 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0940  GMP synthase  33.86 
 
 		 510 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0513  glutamine amidotransferase class-I  31.48 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0638034  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1937  GMP synthase large subunit  33.58 
 
 		 508 aa  62.8  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000487266 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  33.79 
 
 		 522 aa  63.2  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0865  glutamine amidotransferase class-I  29.69 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0038327  hitchhiker  0.0000262286 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0220  GMP synthase  31.3 
 
 		 522 aa  62.8  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3848  glutamine amidotransferase class-I  32.85 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1364  GMP synthase subunit A  30.34 
 
 		 189 aa  62  0.000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3627  glutamine amidotransferase class-I  31.61 
 
 		 223 aa  62  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0595  GMP synthase, large subunit  32.28 
 
 		 511 aa  61.6  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0015  GMP synthase  30.5 
 
 		 532 aa  60.5  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235317 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0327  GMP synthase  27.36 
 
 		 520 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2622  GMP synthase  30.22 
 
 		 521 aa  60.1  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  31.69 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1096  GMP synthase large subunit  35.88 
 
 		 516 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  30.95 
 
 		 526 aa  60.1  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1184  GMP synthase  32.61 
 
 		 519 aa  60.1  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.550912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2000  GMP synthase  29.29 
 
 		 540 aa  59.7  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.388201 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1573  GMP synthase  25.58 
 
 		 507 aa  59.3  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2441  GMP synthase  27.93 
 
 		 539 aa  59.3  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0629  GMP synthase large subunit  27.11 
 
 		 517 aa  59.3  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.522683 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  28.46 
 
 		 542 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  27.33 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  30.3 
 
 		 537 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0550  GMP synthase  29.17 
 
 		 540 aa  58.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19190  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.83 
 
 		 536 aa  58.2  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0538351 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  30.1 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0948  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component II  25.47 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.233001  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1250  GMP synthase, large subunit  32.82 
 
 		 523 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026459  normal  0.348745 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  31.25 
 
 		 516 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1009  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component II  25.47 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0200639  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3000  glutamine amidotransferase class-I  31.6 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.372191  normal  0.238787 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1245  GMP synthase  28.86 
 
 		 539 aa  57  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0300  GMP synthase  30.41 
 
 		 513 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.176102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>