More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2139 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2139  GMP synthase subunit B  100 
 
 		 305 aa  615  1e-175  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0069  GMP synthase subunit B  78.69 
 
 		 305 aa  501  1e-141  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1900  GMP synthase subunit B  77.05 
 
 		 305 aa  490  1e-137  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2527  GMP synthase subunit B  74.75 
 
 		 305 aa  474  1e-133  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1178  GMP synthase subunit B  71.8 
 
 		 305 aa  434  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0058  GMP synthase subunit B  68.85 
 
 		 304 aa  431  1e-120  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0226  GMP synthase subunit B  65.13 
 
 		 302 aa  409  1e-113  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.612389  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1394  GMP synthase subunit B  64.05 
 
 		 305 aa  386  1e-106  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.216363 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0761  GMP synthase, large subunit  64.05 
 
 		 305 aa  383  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2593  GMP synthase subunit B  63.07 
 
 		 305 aa  383  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0426  GMP synthase subunit B  62.75 
 
 		 305 aa  369  1e-101  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628115  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2718  GMP synthase, large subunit  62.42 
 
 		 305 aa  365  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0142  GMP synthase subunit B  56.51 
 
 		 310 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal  0.0356304 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1761  GMP synthase subunit B  55.56 
 
 		 310 aa  332  5e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247758  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0702  GMP synthase subunit B  55.24 
 
 		 310 aa  331  1e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28782  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0027  GMP synthase subunit B  54.81 
 
 		 310 aa  328  8e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0586295  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0173  GMP synthase subunit B  51.92 
 
 		 310 aa  318  7e-86  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.768744  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  54.6 
 
 		 511 aa  317  2e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00361  GMP synthase  52.32 
 
 		 528 aa  314  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0486  GMP synthase, large subunit  53.16 
 
 		 312 aa  313  2.9999999999999996e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00361  GMP synthase  52.01 
 
 		 528 aa  311  6.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.819005  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0037  GMP synthase  51.39 
 
 		 528 aa  310  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1001  GMP synthase  53.04 
 
 		 501 aa  302  5.000000000000001e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1105  GMP synthase  53.04 
 
 		 501 aa  302  5.000000000000001e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  51.43 
 
 		 560 aa  301  1e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  51.75 
 
 		 511 aa  301  1e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  51.11 
 
 		 533 aa  299  3e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  52.72 
 
 		 510 aa  299  3e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00361  GMP synthase  49.69 
 
 		 528 aa  298  6e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.859384  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4445  GMP synthase, large subunit  50.94 
 
 		 520 aa  297  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637839  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  50.79 
 
 		 560 aa  297  1e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  52.09 
 
 		 510 aa  296  3e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  51.91 
 
 		 512 aa  295  9e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0959  GMP synthase, large subunit  53.16 
 
 		 531 aa  295  9e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0046  GMP synthase  48.88 
 
 		 507 aa  294  1e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.214128  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  51.13 
 
 		 508 aa  294  1e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  51.13 
 
 		 513 aa  294  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00351  GMP synthase  49.23 
 
 		 528 aa  293  2e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  52.24 
 
 		 516 aa  293  2e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1363  GMP synthase  49.23 
 
 		 528 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  51.28 
 
 		 509 aa  292  4e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  50.15 
 
 		 575 aa  292  6e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0460  GMP synthase, large subunit  51.44 
 
 		 517 aa  292  6e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.797387  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1718  GMP synthase  48.72 
 
 		 523 aa  291  1e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0887175  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  50.64 
 
 		 517 aa  291  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1543  GMP synthase, large subunit  49.52 
 
 		 507 aa  291  1e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00371  GMP synthase  49.23 
 
 		 548 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.280363  normal  0.275334 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  48.92 
 
 		 537 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  50.64 
 
 		 516 aa  290  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00451  GMP synthase  49.23 
 
 		 528 aa  290  3e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  51.91 
 
 		 511 aa  290  3e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  50.64 
 
 		 516 aa  290  3e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  52.08 
 
 		 510 aa  289  4e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0046  GMP synthase  49.23 
 
 		 528 aa  289  4e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  50.32 
 
 		 516 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0042  GMP synthase  49.23 
 
 		 528 aa  288  7e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0629  GMP synthase large subunit  48.9 
 
 		 517 aa  288  7e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.522683 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  47.99 
 
 		 542 aa  288  9e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  47.99 
 
 		 542 aa  288  9e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  50.64 
 
 		 513 aa  287  1e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  47.37 
 
 		 575 aa  287  1e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0626  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing), C-terminal domain protein  49.07 
 
 		 520 aa  288  1e-76  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  47.37 
 
 		 542 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  49.69 
 
 		 512 aa  287  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2132  GMP synthase  50.48 
 
 		 512 aa  287  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  51.44 
 
 		 512 aa  286  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  48.73 
 
 		 511 aa  287  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16470  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  48.61 
 
 		 539 aa  286  2.9999999999999996e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.68109  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1228  GMP synthase, large subunit  50.32 
 
 		 513 aa  286  4e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4006  GMP synthase, large subunit  47.52 
 
 		 526 aa  285  5e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.371451 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0598  GMP synthase  49.52 
 
 		 505 aa  285  8e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0702  GMP synthase  48.14 
 
 		 520 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  49.52 
 
 		 510 aa  285  1.0000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  48.88 
 
 		 517 aa  284  1.0000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  50.48 
 
 		 514 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  49.84 
 
 		 512 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0422  GMP synthase  48.9 
 
 		 516 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  49.84 
 
 		 510 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  50.48 
 
 		 514 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  48.9 
 
 		 527 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0645  GMP synthase, large subunit  47.59 
 
 		 507 aa  283  2.0000000000000002e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000665212  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0264  GMP synthase  47.94 
 
 		 507 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  49.52 
 
 		 512 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  49.21 
 
 		 512 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  49.52 
 
 		 512 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  49.52 
 
 		 512 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  49.52 
 
 		 515 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  49.52 
 
 		 515 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1793  GMP synthase  48.6 
 
 		 515 aa  281  7.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  49.52 
 
 		 515 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  49.52 
 
 		 515 aa  281  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  48.9 
 
 		 518 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1494  GMP synthase  48.1 
 
 		 524 aa  281  1e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2184  GMP synthase, large subunit  47.96 
 
 		 507 aa  281  1e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.255738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1430  GMP synthase  48.1 
 
 		 524 aa  281  1e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  52.88 
 
 		 510 aa  281  1e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08800  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  46.85 
 
 		 533 aa  281  1e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  49.21 
 
 		 512 aa  280  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  48.9 
 
 		 518 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1245  GMP synthase  48.48 
 
 		 539 aa  280  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>