More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1219 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1219  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 315 aa  647    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.421615  normal  0.326405 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1721  HhH-GPD family protein  60 
 
 		 294 aa  341  9e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2170  HhH-GPD family protein  57.61 
 
 		 297 aa  311  1e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.837161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1120  hypothetical protein  56.98 
 
 		 292 aa  310  2e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.613239  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1613  A/G-specific adenine glycosylase, putative  51.53 
 
 		 285 aa  276  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1654  HhH-GPD  51.85 
 
 		 285 aa  270  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000331061  normal  0.759743 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0985  HhH-GPD family protein  48.64 
 
 		 298 aa  261  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000391323  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3218  HhH-GPD  52.09 
 
 		 288 aa  261  2e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3486  HhH-GPD family protein  46.18 
 
 		 299 aa  248  8e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08580  A/G-specific DNA glycosylase  42.31 
 
 		 315 aa  230  2e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.210115 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1271  HhH-GPD family protein  47.31 
 
 		 291 aa  229  4e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12880  A/G-specific DNA glycosylase  45.74 
 
 		 284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0147608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0121  HhH-GPD family protein  43.01 
 
 		 333 aa  209  5e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000756832  normal  0.180452 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1520  HhH-GPD family protein  40.08 
 
 		 298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1393  HhH-GPD family protein  41.54 
 
 		 278 aa  170  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  37.04 
 
 		 318 aa  168  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1488  HhH-GPD family protein  38.67 
 
 		 278 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1137  HhH-GPD  37.88 
 
 		 281 aa  166  5e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  34.68 
 
 		 317 aa  160  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1020  HhH-GPD family protein  36.76 
 
 		 278 aa  156  5.0000000000000005e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.425237  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0971  HhH-GPD  36.09 
 
 		 285 aa  152  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1296  HhH-GPD family protein  41.04 
 
 		 222 aa  145  9e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.882026 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  35.81 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  35.27 
 
 		 368 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01570  A/G-specific adenine glycosylase  33.77 
 
 		 313 aa  142  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  35.27 
 
 		 368 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  35.27 
 
 		 368 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  34.5 
 
 		 368 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  34.5 
 
 		 368 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  34.5 
 
 		 368 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  34.5 
 
 		 368 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  34.5 
 
 		 368 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  34.5 
 
 		 368 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  34.5 
 
 		 368 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  34.88 
 
 		 370 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  36.71 
 
 		 363 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0283  A/G-specific adenine glycosylase  42.11 
 
 		 382 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  42.16 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  33.72 
 
 		 368 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  33.72 
 
 		 368 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0256  A/G-specific adenine glycosylase  41.58 
 
 		 382 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0401  A/G-specific adenine glycosylase protein  40 
 
 		 362 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.57 
 
 		 345 aa  135  8e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0221  HhH-GPD family protein  36.2 
 
 		 335 aa  135  8e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230318  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3176  A/G-specific adenine glycosylase  45.52 
 
 		 354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  38.16 
 
 		 352 aa  134  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1054  A/G-specific adenine glycosylase  39.2 
 
 		 370 aa  133  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  35.55 
 
 		 309 aa  133  5e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1715  A/G-specific adenine glycosylase  36.11 
 
 		 374 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000646411  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  45.14 
 
 		 369 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5427  A/G-specific adenine glycosylase  41.18 
 
 		 356 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  39.79 
 
 		 353 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  39.13 
 
 		 352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  45.14 
 
 		 375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  39.13 
 
 		 352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3604  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.71 
 
 		 363 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211751  hitchhiker  0.00640648 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  37.7 
 
 		 355 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0010  A/G-specific adenine glycosylase  39.46 
 
 		 317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  37.7 
 
 		 355 aa  129  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0804  A/G-specific DNA glycosylase  39.33 
 
 		 324 aa  129  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.591097 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1861  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.46 
 
 		 342 aa  129  7.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000833556  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13060  A/G-specific DNA glycosylase  32.86 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0610842  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.36 
 
 		 361 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  33.33 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1378  A/G-specific adenine glycosylase  33.62 
 
 		 407 aa  126  4.0000000000000003e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0309494 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.8 
 
 		 348 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1621  A/G-specific adenine glycosylase  37.1 
 
 		 381 aa  125  8.000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.865832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  37.84 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0443  A/G-specific adenine glycosylase  39.68 
 
 		 359 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1916  A/G-specific adenine glycosylase  37.89 
 
 		 381 aa  124  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0320  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.9 
 
 		 355 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0253407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0078  A/G-specific adenine glycosylase  36.27 
 
 		 383 aa  124  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.99857  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2002  HhH-GPD family protein  31.17 
 
 		 330 aa  124  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0546697  normal  0.289046 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1654  A/G-specific adenine glycosylase  38 
 
 		 344 aa  124  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342935  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2201  HhH-GPD family protein  33.2 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0857  A/G-specific adenine glycosylase  34.93 
 
 		 353 aa  123  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  38.25 
 
 		 382 aa  123  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1730  A/G-specific adenine glycosylase  34.76 
 
 		 383 aa  123  4e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.309429  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  37.17 
 
 		 355 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208141 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3686  A/G-specific adenine glycosylase  35.39 
 
 		 355 aa  123  5e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.899508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.5 
 
 		 368 aa  122  6e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  40.54 
 
 		 354 aa  122  6e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  36.13 
 
 		 381 aa  122  7e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0270  HhH-GPD family protein  40.34 
 
 		 353 aa  122  8e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  36.9 
 
 		 396 aa  122  8e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0348  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  47.22 
 
 		 393 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.36 
 
 		 355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  43.06 
 
 		 355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3235  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.94 
 
 		 368 aa  120  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  36.96 
 
 		 365 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  42.45 
 
 		 360 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0311  A/G-specific adenine glycosylase  35.6 
 
 		 355 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354771  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2939  HhH-GPD family protein  34.26 
 
 		 306 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  36.41 
 
 		 365 aa  119  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0434  A/G-specific adenine glycosylase  36.41 
 
 		 365 aa  119  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.07824e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  36.41 
 
 		 365 aa  119  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0830  A/G-specific adenine glycosylase  38.61 
 
 		 357 aa  119  6e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19342  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4799  A/G-specific adenine glycosylase  36.41 
 
 		 365 aa  119  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000370724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  36.41 
 
 		 365 aa  119  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000761286  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  36.41 
 
 		 365 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>