49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0558 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0558  cytidylate kinase  100 
 
 		 182 aa  379  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.818814  normal  0.184695 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0590  cytidylate kinase  60.56 
 
 		 181 aa  218  3e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.592555  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0468  cytidylate kinase  61.99 
 
 		 176 aa  218  5e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2227  cytidylate kinase  58.19 
 
 		 178 aa  216  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0107  cytidylate kinase  59.09 
 
 		 177 aa  203  8e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.233857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0083  cytidylate kinase  46.59 
 
 		 180 aa  168  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0027  cytidylate kinase  50.87 
 
 		 175 aa  166  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000301148  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1813  cytidylate kinase  41.62 
 
 		 192 aa  142  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.147241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1734  cytidylate kinase  39.88 
 
 		 192 aa  140  8e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.165208 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1495  cytidylate kinase  41.18 
 
 		 179 aa  140  9.999999999999999e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1703  cytidylate kinase  46.29 
 
 		 172 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.784294  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2255  cytidylate kinase  39.31 
 
 		 191 aa  132  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0270  cytidylate kinase  36.52 
 
 		 191 aa  124  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1751  cytidylate kinase  36.31 
 
 		 189 aa  124  6e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1945  cytidylate kinase  41.48 
 
 		 203 aa  124  9e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2321  cytidylate kinase  39.88 
 
 		 192 aa  122  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1499  cytidylate kinase  43.4 
 
 		 174 aa  119  3e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0979  cytidylate kinase  41.1 
 
 		 178 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1127  cytidylate kinase  38.99 
 
 		 178 aa  114  8.999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.402231  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1649  cytidylate kinase  39.26 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.73903  normal  0.997406 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0265  cytidylate kinase  39.88 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0626  cytidylate kinase  35.09 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1729  cytidylate kinase  35.76 
 
 		 184 aa  108  5e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000578527 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0118  cytidylate kinase  39.24 
 
 		 180 aa  107  6e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000087822  hitchhiker  0.0000442728 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1254  cytidylate kinase  34.86 
 
 		 204 aa  105  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1109  cytidylate kinase  33.94 
 
 		 184 aa  104  8e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1364  cytidylate kinase  34.55 
 
 		 184 aa  101  6e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.790143  normal  0.0224769 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0399  cytidylate kinase  36.97 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185017  normal  0.222549 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0898  cytidylate kinase  32.94 
 
 		 181 aa  99.4  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.136521  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1087  cytidylate kinase  32.18 
 
 		 187 aa  85.9  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0849  cytidylate kinase  30.98 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3839  cytidylate kinase-like protein  29.67 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.206028  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1866  hypothetical protein  27.75 
 
 		 327 aa  68.9  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.546086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1859  hypothetical protein  27.85 
 
 		 327 aa  65.5  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0405  cytidylate kinase  25.75 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2809  transport-associated protein  25 
 
 		 273 aa  49.3  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00612028  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  24.5 
 
 		 214 aa  48.1  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1325  transport-associated protein  24.47 
 
 		 275 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0768925  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1213  riboflavin biosynthesis protein RibF  22.6 
 
 		 529 aa  45.8  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1979  transport-associated protein  24.59 
 
 		 273 aa  45.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000154767  normal  0.0601452 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1925  transport-associated domain-containing protein  24.7 
 
 		 273 aa  45.1  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237586  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1657  adenylate kinase, conjectural  50 
 
 		 170 aa  44.3  0.0009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.160746  hitchhiker  0.0066831 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2066  adenylate kinase  43.9 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2312  transport-associated  23.64 
 
 		 271 aa  42  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000102264  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0270  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  32.95 
 
 		 211 aa  42  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3359  adenylate kinase  37.5 
 
 		 215 aa  41.6  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.848875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39280  Adenylate kinase  37.5 
 
 		 215 aa  41.2  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1911  transport-associated protein  23.64 
 
 		 271 aa  41.2  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.551319 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3811  hypothetical protein  21.14 
 
 		 238 aa  40.8  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>