276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3468 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3468  multimeric flavodoxin WrbA family protein  100 
 
 		 183 aa  379  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  decreased coverage  0.000563166 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  34.81 
 
 		 179 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18210  NADPH-dependent FMN reductase  35.2 
 
 		 177 aa  111  5e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  33.7 
 
 		 179 aa  108  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  32.6 
 
 		 179 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2849  NADPH-dependent FMN reductase  36.99 
 
 		 192 aa  105  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  43.86 
 
 		 173 aa  105  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0275  NADPH-dependent FMN reductase  32.07 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3141  iron-sulfur flavoprotein  42.15 
 
 		 178 aa  102  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.087899  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18130  NADPH-dependent FMN reductase  33.51 
 
 		 172 aa  99.8  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.340395  normal  0.960689 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1320  NADPH-dependent FMN reductase  32.6 
 
 		 179 aa  97.1  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654727  normal  0.0975932 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  43.14 
 
 		 206 aa  92  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  45.92 
 
 		 193 aa  91.7  6e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  45.92 
 
 		 194 aa  91.3  7e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  45.92 
 
 		 193 aa  90.9  9e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  27.78 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  44.9 
 
 		 193 aa  89  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1552  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.42 
 
 		 178 aa  88.2  7e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1988  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.91 
 
 		 321 aa  85.9  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0292793  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0893  NADPH-dependent FMN reductase  31.87 
 
 		 200 aa  85.1  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3622  NADPH-dependent FMN reductase  30.77 
 
 		 191 aa  85.1  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0159  NADPH-dependent FMN reductase  37.29 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  32.26 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  28.92 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  31.18 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  39.22 
 
 		 194 aa  81.3  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  38.24 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  31.18 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1072  NADPH-dependent FMN reductase  33.96 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  27.15 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0077  NADPH-dependent FMN reductase  34 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0133  NADPH-dependent FMN reductase  36.24 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000492716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  38.78 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0772  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  28.95 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.806618  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1188  NADPH-dependent FMN reductase  30.18 
 
 		 180 aa  77.4  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.646638 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1285  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.497649  normal  0.389555 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  35.64 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  37.76 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  29.45 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0120  hypothetical protein  31.33 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  40.4 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0748  iron-sulfur flavoprotein  31.33 
 
 		 195 aa  74.7  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.203042 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0333  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 		 222 aa  74.3  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.977725  normal  0.107763 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0130  NADPH-dependent FMN reductase  30.53 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  37.76 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0309  NADPH-dependent FMN reductase  37.37 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  26.63 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  35.64 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2979  NADPH-dependent FMN reductase  37.62 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.670971 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  29.53 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  26.85 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0080  NADPH-dependent FMN reductase  33.96 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  33.67 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2629  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.91 
 
 		 344 aa  71.2  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  36 
 
 		 223 aa  71.2  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  34.65 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  33.98 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1392  NADPH-dependent FMN reductase  28.42 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0166  NADPH-dependent FMN reductase  35.85 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  32.04 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  38.78 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0672  NADPH-dependent FMN reductase  33.01 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.594291 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0308  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.471384 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  37 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0125  NADPH-dependent FMN reductase  31.13 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1266  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.24 
 
 		 562 aa  69.3  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  33.66 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  33.67 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  32.65 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1636  NADPH-dependent FMN reductase  35.9 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2738  NADPH-dependent FMN reductase  33.62 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  34.69 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  35.64 
 
 		 194 aa  67.8  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2521  NADPH-dependent FMN reductase  31.54 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1492  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37 
 
 		 540 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1638  NADPH-dependent FMN reductase  31.87 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0739804  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  35.64 
 
 		 198 aa  67  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0357  hypothetical protein  32.41 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0303  NADPH-dependent FMN reductase  29.25 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  33.94 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0441  iron-sulfur flavoprotein  36.54 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2612  iron-sulfur flavoprotein  33 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  35.35 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  36.73 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2733  NADPH-dependent FMN reductase  34.48 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  36.63 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  39.39 
 
 		 220 aa  64.7  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  25.55 
 
 		 184 aa  64.3  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  37.62 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1046  hypothetical protein  34.95 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.882215 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0468  NADPH-dependent FMN reductase  32.11 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0704146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1543  NADPH-dependent FMN reductase  34.31 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0882991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1677  EIF-4a family ATP-dependent RNA helicase  34.31 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.42151  hitchhiker  0.000000240044 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  36.73 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1130  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>