More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1178 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1178  GMP synthase subunit B  100 
 
 		 305 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0058  GMP synthase subunit B  78.03 
 
 		 304 aa  484  1e-136  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0226  GMP synthase subunit B  71.1 
 
 		 302 aa  434  1e-121  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.612389  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2139  GMP synthase subunit B  71.8 
 
 		 305 aa  434  1e-120  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0069  GMP synthase subunit B  69.51 
 
 		 305 aa  433  1e-120  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1900  GMP synthase subunit B  67.21 
 
 		 305 aa  421  1e-117  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2527  GMP synthase subunit B  65.9 
 
 		 305 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0761  GMP synthase, large subunit  67.65 
 
 		 305 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1394  GMP synthase subunit B  66.67 
 
 		 305 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.216363 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0426  GMP synthase subunit B  67.32 
 
 		 305 aa  402  1e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628115  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2593  GMP synthase subunit B  65.03 
 
 		 305 aa  397  1e-109  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2718  GMP synthase, large subunit  66.99 
 
 		 305 aa  394  1e-109  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0142  GMP synthase subunit B  58.65 
 
 		 310 aa  335  5e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal  0.0356304 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1761  GMP synthase subunit B  58.01 
 
 		 310 aa  333  2e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247758  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0027  GMP synthase subunit B  57.69 
 
 		 310 aa  332  4e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0586295  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0702  GMP synthase subunit B  57.69 
 
 		 310 aa  332  5e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28782  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0173  GMP synthase subunit B  56.23 
 
 		 310 aa  330  2e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.768744  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  54.78 
 
 		 512 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0486  GMP synthase, large subunit  55.06 
 
 		 312 aa  315  4e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  54.14 
 
 		 510 aa  314  9e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1001  GMP synthase  54.81 
 
 		 501 aa  311  6.999999999999999e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  53.5 
 
 		 512 aa  311  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1105  GMP synthase  54.81 
 
 		 501 aa  311  7.999999999999999e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  53.5 
 
 		 512 aa  311  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  53.5 
 
 		 515 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  53.5 
 
 		 515 aa  311  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  53.5 
 
 		 515 aa  311  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  53.5 
 
 		 512 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  53.5 
 
 		 515 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  53.5 
 
 		 512 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  53.8 
 
 		 511 aa  311  1e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  53.82 
 
 		 512 aa  310  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  53.38 
 
 		 510 aa  309  2.9999999999999997e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  54.63 
 
 		 516 aa  309  2.9999999999999997e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  52.87 
 
 		 512 aa  309  4e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  52.87 
 
 		 512 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  51.9 
 
 		 511 aa  306  2.0000000000000002e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  51.85 
 
 		 575 aa  306  2.0000000000000002e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  51.75 
 
 		 560 aa  306  3e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  53.04 
 
 		 509 aa  306  4.0000000000000004e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  53.82 
 
 		 511 aa  305  5.0000000000000004e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  52.08 
 
 		 510 aa  305  6e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  51.43 
 
 		 533 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  51.43 
 
 		 517 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  52.87 
 
 		 510 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0959  GMP synthase, large subunit  52.2 
 
 		 531 aa  301  7.000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00351  GMP synthase  51.56 
 
 		 528 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1363  GMP synthase  51.55 
 
 		 528 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00361  GMP synthase  50.31 
 
 		 528 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  51.11 
 
 		 560 aa  300  2e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00361  GMP synthase  50.31 
 
 		 528 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.819005  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0046  GMP synthase  51.43 
 
 		 507 aa  300  3e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.214128  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  51.23 
 
 		 537 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  51.11 
 
 		 516 aa  299  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  50.48 
 
 		 516 aa  299  4e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  53.18 
 
 		 512 aa  299  5e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1718  GMP synthase  50 
 
 		 523 aa  298  6e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0887175  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4445  GMP synthase, large subunit  50.62 
 
 		 520 aa  298  6e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637839  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0629  GMP synthase large subunit  51.4 
 
 		 517 aa  298  7e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.522683 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  52.72 
 
 		 513 aa  298  7e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  51.75 
 
 		 518 aa  298  8e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0037  GMP synthase  49.69 
 
 		 528 aa  298  9e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  50.16 
 
 		 516 aa  298  9e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  51.75 
 
 		 518 aa  297  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  49.69 
 
 		 575 aa  296  2e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0645  GMP synthase  50.31 
 
 		 556 aa  296  3e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  50 
 
 		 542 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0460  GMP synthase, large subunit  51.27 
 
 		 517 aa  295  4e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.797387  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0042  GMP synthase  50.94 
 
 		 528 aa  296  4e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  51.11 
 
 		 518 aa  295  5e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  49.36 
 
 		 517 aa  295  7e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1806  GMP synthase  48.76 
 
 		 511 aa  294  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0967  GMP synthase  50 
 
 		 520 aa  294  1e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0246397  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  51.11 
 
 		 518 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  50.64 
 
 		 510 aa  294  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00361  GMP synthase  49.07 
 
 		 528 aa  294  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.859384  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0046  GMP synthase  50.31 
 
 		 528 aa  293  2e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  51.28 
 
 		 513 aa  294  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00451  GMP synthase  50.62 
 
 		 528 aa  293  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  50 
 
 		 513 aa  293  3e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6529  GMP synthase  50.47 
 
 		 519 aa  293  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.413067  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  50 
 
 		 513 aa  293  3e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  48.73 
 
 		 511 aa  293  3e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  54.17 
 
 		 510 aa  292  4e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  49.52 
 
 		 517 aa  292  4e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2551  GMP synthase, large subunit  49.08 
 
 		 533 aa  293  4e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0264  GMP synthase  50.63 
 
 		 507 aa  292  5e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0600  GMP synthase  51.58 
 
 		 505 aa  292  5e-78  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0760838  hitchhiker  0.0000221926 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1793  GMP synthase  49.07 
 
 		 515 aa  292  6e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1543  GMP synthase, large subunit  49.21 
 
 		 507 aa  291  8e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1516  GMP synthase  52.05 
 
 		 505 aa  291  1e-77  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  49.06 
 
 		 540 aa  290  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  48.76 
 
 		 534 aa  290  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  50.96 
 
 		 509 aa  291  1e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0626  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing), C-terminal domain protein  49.54 
 
 		 520 aa  291  1e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  50.16 
 
 		 527 aa  291  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00371  GMP synthase  50.47 
 
 		 548 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.280363  normal  0.275334 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  50.96 
 
 		 509 aa  290  2e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  49.84 
 
 		 514 aa  289  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1228  GMP synthase, large subunit  50.96 
 
 		 513 aa  290  3e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>