201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0252 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0252  iron-sulfur flavoprotein  100 
 
 
227 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.488898  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2377  NADPH-dependent FMN reductase  73.76 
 
 
209 aa  328  6e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000848109  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  60.1 
 
 
197 aa  249  3e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  59.47 
 
 
197 aa  238  5.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0421  NADPH-dependent FMN reductase  58.95 
 
 
197 aa  236  3e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0414  NADPH-dependent FMN reductase  58.95 
 
 
197 aa  234  6e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  54.21 
 
 
197 aa  228  6e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  56.84 
 
 
213 aa  211  7e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  44.22 
 
 
194 aa  139  3e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  45.73 
 
 
193 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  44.72 
 
 
193 aa  136  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  45.23 
 
 
193 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  41.87 
 
 
193 aa  122  3e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  37 
 
 
193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  36.22 
 
 
187 aa  103  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1072  NADPH-dependent FMN reductase  30.33 
 
 
212 aa  89  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1510  NADPH-dependent FMN reductase  39.13 
 
 
202 aa  87.4  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  29.84 
 
 
192 aa  86.7  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  32.04 
 
 
200 aa  86.7  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  32.99 
 
 
204 aa  86.3  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  37.82 
 
 
195 aa  85.9  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  34.04 
 
 
192 aa  85.5  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3039  NADPH-dependent FMN reductase  31.82 
 
 
202 aa  85.1  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.301206 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  32.39 
 
 
206 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  38.56 
 
 
224 aa  84  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  30.98 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  32.43 
 
 
191 aa  82  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  29.81 
 
 
207 aa  82  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  31.61 
 
 
191 aa  82  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  33.67 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2465  NADPH-dependent FMN reductase  29.06 
 
 
202 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  32.24 
 
 
205 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  31.09 
 
 
199 aa  79.7  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  33.5 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0549  NADPH-dependent FMN reductase  30.5 
 
 
199 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1543  NADPH-dependent FMN reductase  29.26 
 
 
193 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0882991  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  36.89 
 
 
179 aa  77  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0325  NADPH-dependent FMN reductase  29.51 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0870  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
195 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000162046  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  27.98 
 
 
198 aa  76.6  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0489  NADPH-dependent FMN reductase  31.86 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  29.73 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1057  NADPH-dependent FMN reductase  30.37 
 
 
190 aa  75.1  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.840292  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1029  iron-sulfur flavoprotein  30.64 
 
 
190 aa  74.3  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.343926  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  28.8 
 
 
199 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  27.89 
 
 
194 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  26.44 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  29.19 
 
 
190 aa  72  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1244  NADPH-dependent FMN reductase  29.84 
 
 
190 aa  71.6  0.000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3707  NADPH-dependent FMN reductase  32.89 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0930977 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  35.51 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  33.54 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  26.05 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  26.06 
 
 
195 aa  69.7  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2925  NADPH-dependent FMN reductase  27.75 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000194359  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  25.59 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0225  NADPH-dependent FMN reductase  31.02 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.545185  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0621  NADPH-dependent FMN reductase  30.61 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.295503  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1029  NADPH-dependent FMN reductase  32.54 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.153649  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  29.27 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  30.81 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0797  hypothetical protein  30.22 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000338584 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  30.98 
 
 
190 aa  67.8  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  28.77 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2979  NADPH-dependent FMN reductase  25.11 
 
 
204 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.670971 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  30.23 
 
 
190 aa  67  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  37.38 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  27.68 
 
 
208 aa  67  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  32.35 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  29.59 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  25.12 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0284  NADPH-dependent FMN reductase  28.3 
 
 
211 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  37.04 
 
 
220 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  35.19 
 
 
220 aa  63.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0719  Multimeric flavodoxin WrbA-like protein  34.51 
 
 
248 aa  63.9  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.96421  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2647  NADPH-dependent FMN reductase  30.26 
 
 
209 aa  63.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000475353  normal  0.334507 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  25.27 
 
 
191 aa  63.2  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  34.58 
 
 
204 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  28 
 
 
173 aa  62.4  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
194 aa  62.4  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  41.75 
 
 
211 aa  62  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0954  NADPH-dependent FMN reductase  31.76 
 
 
184 aa  62  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1851  NADPH-dependent FMN reductase  32.89 
 
 
204 aa  61.6  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0492811  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  34.43 
 
 
186 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  31.82 
 
 
188 aa  61.2  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0630  NADPH-dependent FMN reductase  29.95 
 
 
233 aa  61.2  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1130  NADPH-dependent FMN reductase  38.1 
 
 
182 aa  60.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1046  hypothetical protein  37.5 
 
 
187 aa  60.5  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.882215 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  34.29 
 
 
197 aa  60.8  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0275  NADPH-dependent FMN reductase  34.82 
 
 
178 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  35.58 
 
 
185 aa  59.7  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  30.92 
 
 
183 aa  59.7  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  34.43 
 
 
186 aa  60.1  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  38.53 
 
 
189 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2261  NADPH-dependent FMN reductase  31.5 
 
 
222 aa  58.9  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  0.127615 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  33.03 
 
 
206 aa  58.9  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1058  NADPH-dependent FMN reductase  27.98 
 
 
192 aa  58.9  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  36.45 
 
 
217 aa  58.9  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>