More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2790 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  395  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  58.64 
 
 
191 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  62.87 
 
 
191 aa  225  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  62.28 
 
 
191 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  55.96 
 
 
191 aa  222  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  55.96 
 
 
191 aa  222  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  55.96 
 
 
191 aa  221  4e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  55.96 
 
 
191 aa  221  4e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  55.96 
 
 
191 aa  221  4e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  55.96 
 
 
191 aa  221  4e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  55.96 
 
 
191 aa  221  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  55.96 
 
 
191 aa  221  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  55.96 
 
 
191 aa  221  4e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  55.96 
 
 
191 aa  221  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  55.96 
 
 
191 aa  221  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  55.44 
 
 
191 aa  221  7e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  55.96 
 
 
191 aa  220  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  54.92 
 
 
192 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  55.44 
 
 
191 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  54.4 
 
 
192 aa  218  3e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  54.92 
 
 
192 aa  218  5e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  56.32 
 
 
192 aa  218  5e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3055  hypothetical protein  52.31 
 
 
191 aa  214  9e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0011163  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1323  hypothetical protein  52.31 
 
 
191 aa  214  9e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00141701  normal  0.012746 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  53.65 
 
 
192 aa  213  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1217  hypothetical protein  54.4 
 
 
192 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000670198  normal  0.302127 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2875  hypothetical protein  51.81 
 
 
191 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367031  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  52.6 
 
 
192 aa  212  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3198  hypothetical protein  51.79 
 
 
191 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  52.6 
 
 
192 aa  212  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  52.6 
 
 
192 aa  212  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3041  hypothetical protein  51.79 
 
 
191 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000749458  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  59.28 
 
 
192 aa  211  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1179  hypothetical protein  51.81 
 
 
191 aa  210  9e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000115477  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03828  YceI  56.89 
 
 
188 aa  209  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2702  hypothetical protein  51.28 
 
 
191 aa  209  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.120827  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1178  hypothetical protein  51.81 
 
 
191 aa  209  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000879388  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1249  hypothetical protein  51.81 
 
 
191 aa  209  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00199018  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  51.81 
 
 
189 aa  202  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1121  hypothetical protein  53.98 
 
 
177 aa  201  5e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000345646  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1317  hypothetical protein  49.74 
 
 
191 aa  201  5e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.269449  normal  0.532637 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3598  hypothetical protein  53.01 
 
 
199 aa  199  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0950  hypothetical protein  49.48 
 
 
190 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000269923  normal  0.477847 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2128  hypothetical protein  55.09 
 
 
191 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000295006  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  51.37 
 
 
196 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  50.78 
 
 
189 aa  196  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2890  hypothetical protein  51.15 
 
 
189 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.11559  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05924  hypothetical protein  48.7 
 
 
189 aa  191  7e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000194  hypothetical protein  53.29 
 
 
176 aa  187  5.999999999999999e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352716  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3370  hypothetical protein  49.74 
 
 
191 aa  187  9e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5284  hypothetical protein  48.22 
 
 
208 aa  186  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.547725  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1739  hypothetical protein  48.4 
 
 
203 aa  184  6e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000033243  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  45.45 
 
 
201 aa  182  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  53.29 
 
 
192 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  52.69 
 
 
192 aa  181  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  52.54 
 
 
198 aa  180  9.000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  51.5 
 
 
204 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  51.5 
 
 
192 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  50.3 
 
 
192 aa  176  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  49.7 
 
 
192 aa  175  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  45.11 
 
 
179 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  41.38 
 
 
182 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  42.17 
 
 
188 aa  136  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  41.57 
 
 
187 aa  136  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  44.12 
 
 
196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  42.51 
 
 
183 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  41.92 
 
 
183 aa  134  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  43.03 
 
 
183 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  39.08 
 
 
182 aa  131  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  39.08 
 
 
182 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  40.83 
 
 
182 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  40.68 
 
 
187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  42.6 
 
 
201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  34.87 
 
 
213 aa  124  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  34.87 
 
 
213 aa  124  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  42.17 
 
 
183 aa  119  3e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1264  YceI family protein  39.05 
 
 
185 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0195  YceI family protein  39.41 
 
 
187 aa  118  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3229  hypothetical protein  34.59 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.474421  normal  0.780413 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1831  YceI  37.21 
 
 
193 aa  115  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.033679  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  35.19 
 
 
205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1026  YceI family protein  36.21 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  41.62 
 
 
181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3514  YceI family protein  39.43 
 
 
285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  37.04 
 
 
189 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  40.11 
 
 
186 aa  112  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  34.32 
 
 
237 aa  112  5e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7029  YceI family protein  34.09 
 
 
183 aa  111  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  40.57 
 
 
182 aa  111  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  33.7 
 
 
237 aa  111  8.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  39.29 
 
 
177 aa  110  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  38.2 
 
 
196 aa  110  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  35.96 
 
 
196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  39.08 
 
 
182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  36.26 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  37.56 
 
 
195 aa  109  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  34.83 
 
 
181 aa  109  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  40.38 
 
 
182 aa  109  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  39.77 
 
 
178 aa  109  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  35.06 
 
 
206 aa  108  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.560218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>