49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2966 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2966  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  471  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280918  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0886  transcription antitermination protein NusG  42.8 
 
 		 212 aa  157  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  hitchhiker  0.00000687026 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1852  hypothetical protein  45.88 
 
 		 166 aa  122  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1372  hypothetical protein  43.33 
 
 		 174 aa  119  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3039  hypothetical protein  42.68 
 
 		 204 aa  116  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1897  hypothetical protein  41.77 
 
 		 202 aa  111  8.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.169609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1384  hypothetical protein  36.31 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0576  hypothetical protein  35.98 
 
 		 197 aa  97.8  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2934  membrane-like protein  41.51 
 
 		 188 aa  97.1  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.391683 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2734  hypothetical protein  41.45 
 
 		 190 aa  96.7  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3105  hypothetical protein  39.39 
 
 		 204 aa  92.8  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.27509  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1398  hypothetical protein  37.01 
 
 		 190 aa  81.3  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0259428  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4342  hypothetical protein  40 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.121402 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2838  membrane protein  31.29 
 
 		 166 aa  74.7  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.768899  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3822  hypothetical protein  34.35 
 
 		 423 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0115673  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44880  hypothetical protein  34.35 
 
 		 425 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.798821  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1917  hypothetical protein  41.33 
 
 		 448 aa  48.5  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.159844  normal  0.631971 
 
 
-
 
NC_004310  BR0353  hypothetical protein  38.67 
 
 		 414 aa  47.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0455  hypothetical protein  38.67 
 
 		 411 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.730035  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2869  protein of unknown function DUF989  33.98 
 
 		 412 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.492363 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3207  protein of unknown function DUF989  37.33 
 
 		 410 aa  46.6  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.175006 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2761  hypothetical protein  32.17 
 
 		 430 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3141  protein of unknown function DUF989  33.98 
 
 		 412 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1702  hypothetical protein  33.33 
 
 		 437 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.317159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4495  hypothetical protein  37.5 
 
 		 410 aa  46.6  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122524  normal  0.0576102 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1805  hypothetical protein  33.03 
 
 		 430 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.916296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3268  hypothetical protein  35.8 
 
 		 406 aa  45.4  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.152004 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3670  hypothetical protein  32.11 
 
 		 421 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.753123  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21090  hypothetical protein  39.02 
 
 		 389 aa  45.4  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0855882  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02521  predicted membrane protein  29.2 
 
 		 426 aa  45.4  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.216294  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3615  hypothetical protein  29.91 
 
 		 442 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130992  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4289  hypothetical protein  29.91 
 
 		 446 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1579  hypothetical protein  29.91 
 
 		 442 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2837  hypothetical protein  38.67 
 
 		 404 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3294  hypothetical protein  40 
 
 		 407 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.198313  normal  0.824259 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3325  hypothetical protein  36 
 
 		 410 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1391  hypothetical protein  37.11 
 
 		 438 aa  43.9  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.196967  normal  0.0829452 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0835  protein of unknown function DUF989  38.67 
 
 		 398 aa  43.9  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.510797  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3583  class I monoheme cytochrome c  34.57 
 
 		 406 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.22446  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3889  hypothetical protein  34.57 
 
 		 408 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.619788 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3853  hypothetical protein  29.91 
 
 		 442 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0186652  normal  0.587321 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6197  hypothetical protein  39 
 
 		 417 aa  43.5  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.328689 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3914  hypothetical protein  35 
 
 		 415 aa  43.5  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0357  hypothetical protein  29.67 
 
 		 405 aa  43.5  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.155454 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4624  hypothetical protein  36.25 
 
 		 412 aa  43.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2611  hypothetical protein  37.33 
 
 		 413 aa  42  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3478  hypothetical protein  32.5 
 
 		 419 aa  42  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.300585  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1781  protein of unknown function DUF989  36.73 
 
 		 438 aa  42  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.201182 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3709  hypothetical protein  40.79 
 
 		 394 aa  42  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191189  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>