119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02694 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02694  Phosphohistidine phosphatase SixA (RX6)  100 
 
 
175 aa  361  3e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0471403  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1667  phosphohistidine phosphatase, SixA  41.25 
 
 
157 aa  124  9e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002860  phosphohistidine phosphatase SixA  37.82 
 
 
154 aa  105  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03117  hypothetical protein  35.26 
 
 
154 aa  100  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3154  phosphohistidine phosphatase SixA  40.51 
 
 
166 aa  99.8  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0131638  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2814  phosphohistidine phosphatase  35.4 
 
 
160 aa  99.4  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2165  phosphohistidine phosphatase SixA  37.82 
 
 
156 aa  99.4  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1450  phosphohistidine phosphatase  35.4 
 
 
160 aa  97.8  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2576  phosphohistidine phosphatase  37.58 
 
 
161 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2629  phosphohistidine phosphatase  37.58 
 
 
161 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000296858 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2616  phosphohistidine phosphatase  37.58 
 
 
161 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6448  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2527  phosphohistidine phosphatase  37.58 
 
 
161 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2741  phosphohistidine phosphatase  37.58 
 
 
161 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.191818  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1342  phosphohistidine phosphatase, SixA  35 
 
 
161 aa  94  9e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2880  phosphohistidine phosphatase  36.65 
 
 
161 aa  92.8  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00688568  normal  0.224606 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1658  phosphohistidine phosphatase  37.5 
 
 
157 aa  93.2  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1402  phosphohistidine phosphatase  38.06 
 
 
163 aa  93.2  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0380  phosphohistidine phosphatase  36.36 
 
 
163 aa  92.4  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1534  phosphohistidine phosphatase SixA  38.67 
 
 
166 aa  91.3  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02264  phosphohistidine phosphatase  37.84 
 
 
161 aa  87.8  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1317  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.84 
 
 
161 aa  87.8  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02225  hypothetical protein  37.84 
 
 
161 aa  87.8  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2491  phosphohistidine phosphatase  37.84 
 
 
161 aa  87.8  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2636  phosphohistidine phosphatase  37.84 
 
 
161 aa  87.8  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.710371  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1511  phosphohistidine phosphatase  38 
 
 
158 aa  87.8  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1313  phosphohistidine phosphatase  37.84 
 
 
161 aa  87.8  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.144029  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2498  phosphohistidine phosphatase  37.84 
 
 
161 aa  87.8  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826923  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2719  phosphohistidine phosphatase  37.84 
 
 
161 aa  87.8  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2670  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.76 
 
 
157 aa  87.8  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3482  phosphohistidine phosphatase  37.84 
 
 
161 aa  87.8  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3377  phosphohistidine phosphatase  39.04 
 
 
160 aa  87  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2596  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.59 
 
 
162 aa  86.7  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2591  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.5 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2810  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.99 
 
 
158 aa  85.5  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0731  phosphohistidine phosphatase  37.01 
 
 
181 aa  84.3  8e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3082  phosphohistidine phosphatase SixA  39.86 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2454  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.76 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1413  phosphohistidine phosphatase, SixA  39.16 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575562  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1478  phosphohistidine phosphatase, SixA  39.16 
 
 
156 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.49019  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1466  phosphohistidine phosphatase, SixA  39.16 
 
 
156 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970455 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2755  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.06 
 
 
156 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2772  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.06 
 
 
156 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2849  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.06 
 
 
156 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000875019 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1604  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.06 
 
 
156 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0959361 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1635  phosphohistidine phosphatase, SixA  36 
 
 
162 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2419  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.66 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.758987 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3020  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.33 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.741843 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2162  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.55 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2489  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.93 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2164  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.1 
 
 
161 aa  67  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2024  phosphohistidine phosphatase SixA  31.76 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.469683  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2465  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.08 
 
 
152 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.101249  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2123  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.43 
 
 
159 aa  60.5  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263513 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1700  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.25 
 
 
152 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.047664  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29020  phosphohistidine phosphatase SixA  32.89 
 
 
156 aa  58.5  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1097  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.79 
 
 
152 aa  58.5  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.832383  normal  0.23476 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2215  phosphohistidine phosphatase SixA  30.41 
 
 
151 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4167  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.23 
 
 
152 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2096  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.85 
 
 
158 aa  57.4  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0001187  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1285  phospho-histidine phosphatase  31.29 
 
 
152 aa  56.6  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.849607  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3657  phosphohistidine phosphatase SixA  33.11 
 
 
154 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1002  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.19 
 
 
164 aa  53.9  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0697056 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43620  putative phosphohistidine phosphatase SixA  32 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.01886  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3491  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.19 
 
 
152 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0099  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.26 
 
 
158 aa  52.4  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.239035  normal  0.0377722 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0932  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.8 
 
 
151 aa  52  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.830676  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3739  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
152 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1195  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.63 
 
 
152 aa  51.6  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186359  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4278  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.86 
 
 
175 aa  50.8  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1220  phosphohistidine phosphatase, SixA  26.97 
 
 
153 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03579  putative phosphoglycerate mutase family protein  29.33 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4206  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.86 
 
 
150 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.550023 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2848  phosphohistidine phosphatase, SixA  32 
 
 
152 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.846739 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1955  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.03 
 
 
160 aa  48.9  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.187267  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2314  phosphohistidine phosphatase SixA  31.03 
 
 
160 aa  48.9  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.889503  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0198  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.13 
 
 
155 aa  48.1  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0781  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.99 
 
 
150 aa  48.5  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4118  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28 
 
 
173 aa  48.5  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0361837  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2067  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.23 
 
 
150 aa  48.1  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1691  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.27 
 
 
183 aa  48.1  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1998  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.57 
 
 
153 aa  47.8  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3007  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.26 
 
 
153 aa  47.8  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1207  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.01 
 
 
162 aa  47.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3823  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.78 
 
 
176 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1661  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.01 
 
 
176 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0747644  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2564  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28 
 
 
167 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000228315  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0829  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.57 
 
 
153 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1310  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.57 
 
 
153 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.593656  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1292  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.57 
 
 
153 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.34 
 
 
174 aa  45.1  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17454  predicted protein  34.83 
 
 
291 aa  45.1  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.408947  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4453  phosphohistidine phosphatase, SixA  25.66 
 
 
153 aa  44.7  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.243085  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1476  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.97 
 
 
149 aa  44.7  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.327874  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0780  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.47 
 
 
143 aa  44.7  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.06 
 
 
161 aa  44.3  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2320  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
182 aa  43.9  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.825769  normal  0.76256 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0892  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  38.46 
 
 
152 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0509974 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37201  predicted protein  30.43 
 
 
311 aa  43.9  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0314  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.33 
 
 
146 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1328  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.6 
 
 
179 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>