32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00263 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00263  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshQ (pilus type IV)  100 
 
 		 1168 aa  2387    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0478  MSHA biogenesis protein MshQ  27.86 
 
 		 1255 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233703  normal  0.793103 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4403  hypothetical protein  27.37 
 
 		 1463 aa  174  7.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3473  MSHA biogenesis protein MshQ  27.88 
 
 		 1261 aa  172  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134713  normal  0.928372 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0573  MSHA biogenesis protein MshQ  27.12 
 
 		 1258 aa  171  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0117136  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0557  MSHA biogenesis protein MshQ  27.52 
 
 		 906 aa  169  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0109211  normal  0.590942 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3649  MSHA biogenesis protein MshQ  28.02 
 
 		 1248 aa  169  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.516469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3335  hypothetical protein  27.3 
 
 		 1553 aa  160  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.545908  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0402  MSHA biogenesis protein MshQ  26.05 
 
 		 900 aa  159  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0473177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3755  PA14 domain-containing protein  27.21 
 
 		 1382 aa  158  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0111574  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4562  hypothetical protein  25.3 
 
 		 1576 aa  156  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  26.44 
 
 		 1504 aa  152  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0521  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1543 aa  147  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.402104 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0466  MSHA biogenesis protein MshQ  24.51 
 
 		 837 aa  144  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0264284  normal  0.812437 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3739  hypothetical protein  25.75 
 
 		 1532 aa  142  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3823  hypothetical protein  27.08 
 
 		 1541 aa  140  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.473732  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0517  hypothetical protein  25.85 
 
 		 1543 aa  140  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0496  hypothetical protein  26.27 
 
 		 1543 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0848067  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4100  MSHA biogenesis protein MshQ  26.13 
 
 		 1257 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0396  VcfQ-like protein  26.07 
 
 		 1306 aa  129  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0182  CUB domain-containing protein  25.23 
 
 		 1537 aa  128  8.000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.384689  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3263  VcfQ-like protein  26.23 
 
 		 1072 aa  109  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002382  hypothetical protein  23.47 
 
 		 1508 aa  100  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0765  hypothetical protein  24.91 
 
 		 1085 aa  99.4  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232029  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2833  hypothetical protein  23.67 
 
 		 1252 aa  96.3  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000270915  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0759  hypothetical protein  25.71 
 
 		 907 aa  83.6  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.747993 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3101  hypothetical protein  23.92 
 
 		 1133 aa  79.3  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03686  hypothetical protein  23.87 
 
 		 1544 aa  69.7  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0888  hypothetical protein  30.93 
 
 		 1191 aa  68.6  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.199681 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05444  hypothetical protein  23.29 
 
 		 793 aa  63.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3337  hypothetical protein  27.67 
 
 		 1202 aa  62.4  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001507  MSHA biogenesis protein MshQ  23.06 
 
 		 1008 aa  55.5  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.101461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>