172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5864 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6372  glycosyl transferase family protein  85.19 
 
 		 600 aa  788    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5864  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 579 aa  1090    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0380825  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4686  glycosyl transferase family 39  66.56 
 
 		 598 aa  635    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4173  glycosyl transferase family protein  67.3 
 
 		 602 aa  624  1e-177  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4542  glycosyl transferase family 39  67.3 
 
 		 602 aa  616  1e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0207348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2164  glycosyl transferase family protein  65.28 
 
 		 573 aa  546  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2076  glycosyl transferase family protein  46.47 
 
 		 580 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654023  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1533  glycosyl transferase family protein  48.24 
 
 		 584 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.030992  normal  0.239823 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2917  glycosyl transferase family protein  46.71 
 
 		 580 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2544  glycosyl transferase family protein  48.07 
 
 		 581 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.327974  normal  0.26724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3917  glycosyl transferase family protein 39  47.8 
 
 		 580 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4551  glycosyl transferase family protein  46.7 
 
 		 577 aa  421  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2553  glycosyl transferase family protein  46.03 
 
 		 580 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2825  glycosyl transferase family 39  46.41 
 
 		 581 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1888  glycosyl transferase family 39  40.52 
 
 		 552 aa  327  5e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0174434 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0012  glycosyl transferase family protein  40.98 
 
 		 557 aa  280  6e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0380  glycosyl transferase family protein  39.63 
 
 		 570 aa  272  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1482  glycosyl transferase family protein  39.1 
 
 		 547 aa  256  7e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4522  glycosyl transferase family protein  40.49 
 
 		 568 aa  238  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185613  normal  0.129654 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2389  glycosyl transferase family protein  35.38 
 
 		 637 aa  223  9e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5072  family 39 glycosyl transferase  26.94 
 
 		 605 aa  125  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2984  glycosyl transferase family 39  27.89 
 
 		 553 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0432  glycosyl transferase family 39  25.13 
 
 		 611 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.623031  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3093  glycosyl transferase family 39  33.74 
 
 		 527 aa  107  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798071  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  26.74 
 
 		 553 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1034  glycosyl transferase family protein  25.56 
 
 		 631 aa  103  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1792  glycosyl transferase family 39  28 
 
 		 528 aa  102  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1670  glycosyl transferase family 39  27.13 
 
 		 514 aa  101  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000109819  normal  0.252715 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3801  glycosyl transferase family protein  23.19 
 
 		 666 aa  101  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3551  glycosyl transferase family protein  27.96 
 
 		 547 aa  100  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141392  normal  0.701436 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 		 554 aa  97.8  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1771  hypothetical protein  28.23 
 
 		 525 aa  97.8  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1411  glycosyl transferase family 39  25.97 
 
 		 622 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  27.13 
 
 		 575 aa  92  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1440  glycosyl transferase family 39  25.97 
 
 		 622 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1145  glycosyl transferase family 39  27.41 
 
 		 519 aa  91.3  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107817  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2202  glycosyl transferase family 39  25.55 
 
 		 515 aa  88.6  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0453  glycosyl transferase family 39  28.57 
 
 		 556 aa  88.2  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363312 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0276  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.57 
 
 		 556 aa  88.2  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1778  hypothetical protein  29.5 
 
 		 596 aa  85.5  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0606  hypothetical protein  25.81 
 
 		 516 aa  84.3  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339392  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1278  hypothetical protein  22.16 
 
 		 601 aa  83.2  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4095  glycosyl transferase family 39  26.27 
 
 		 606 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0690  glycosyl transferase family protein  27.99 
 
 		 514 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4212  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 		 557 aa  80.9  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.872167  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0636  glycosyl transferase family 39  24.26 
 
 		 520 aa  80.1  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0796  hypothetical protein  23.68 
 
 		 612 aa  79  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.886904  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13781  glycosyltransferase  23.89 
 
 		 601 aa  79  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.938605  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12641  glycosyltransferase  24.73 
 
 		 604 aa  79.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.547801  hitchhiker  0.00232598 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16511  glycosyltransferase  23.97 
 
 		 612 aa  78.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.760538  normal  0.297105 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02790  hypothetical protein  25.81 
 
 		 468 aa  79  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0526  glycosyl transferase family 39  23.1 
 
 		 534 aa  78.2  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4019  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.62 
 
 		 550 aa  78.2  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13491  glycosyltransferase  23.24 
 
 		 609 aa  77.8  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0465  hypothetical protein  27.91 
 
 		 515 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  26.01 
 
 		 323 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4228  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.67 
 
 		 552 aa  76.6  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1354  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.78 
 
 		 556 aa  74.3  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.515777  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0441  glycosyl transferase family 39  24.85 
 
 		 563 aa  72.8  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2925  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.17 
 
 		 563 aa  72  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2540  glycosyl transferase family 39  28.17 
 
 		 563 aa  72  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13701  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.03 
 
 		 601 aa  72  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2235  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.1 
 
 		 568 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1388  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.43 
 
 		 576 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1878  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.43 
 
 		 576 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0019  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.43 
 
 		 576 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1150  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.43 
 
 		 576 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2399  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.69 
 
 		 553 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2273  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.69 
 
 		 568 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1336  glycosyl transferase family protein  26.99 
 
 		 586 aa  69.3  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478809  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2075  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.5 
 
 		 553 aa  69.3  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5962  family 39 glycosyltransferase  27.55 
 
 		 561 aa  68.2  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00513205 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1729  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.91 
 
 		 554 aa  67.8  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2608  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.91 
 
 		 554 aa  67.8  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2195  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  25.8 
 
 		 601 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000970207  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.91 
 
 		 554 aa  67.8  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590917  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0586  hypothetical protein  27.15 
 
 		 613 aa  67.4  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.38 
 
 		 569 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2384  putative transmembrane protein  24.66 
 
 		 578 aa  67  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4828  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  25.31 
 
 		 575 aa  67  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277829  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2663  glycosyl transferase family protein  23.6 
 
 		 476 aa  66.6  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202263  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3623  glycosyl transferase family protein  31.18 
 
 		 603 aa  66.6  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000798487 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1790  glycosyl transferase family 39  23.59 
 
 		 565 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0176335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0533  glycosyl transferase family protein  27.71 
 
 		 557 aa  65.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0287  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 		 515 aa  66.2  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02183  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.76 
 
 		 550 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1401  glycosyl transferase family 39  24.76 
 
 		 550 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02142  hypothetical protein  24.76 
 
 		 550 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0928  glycosyl transferase family protein  25.36 
 
 		 600 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0620679  normal  0.549908 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1803  glycosyl transferase family 39  25 
 
 		 585 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00158078 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0435  glycosyl transferase family protein  26.33 
 
 		 564 aa  65.5  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58669  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2411  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.39 
 
 		 550 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1392  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.76 
 
 		 550 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3979  glycosyl transferase family protein  25.65 
 
 		 573 aa  64.7  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3370  glycosyl transferase family protein  24.7 
 
 		 582 aa  64.7  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0479028  normal  0.0785337 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2402  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.76 
 
 		 550 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.770556  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1273  glycosyltransferase  25.92 
 
 		 510 aa  64.7  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2633  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.76 
 
 		 550 aa  64.7  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.283519  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5573  glycosyl transferase family 39  31.49 
 
 		 537 aa  64.7  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0245521  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1260  glycosyl transferase family 39  24.38 
 
 		 556 aa  63.9  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367598  normal  0.736156 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>