33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2844 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2844  hypothetical protein  100 
 
 
432 aa  878    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2717  hypothetical protein  53.29 
 
 
432 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0919  hypothetical protein  51.4 
 
 
435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.432365  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  48.3 
 
 
435 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2008  hypothetical protein  46.74 
 
 
429 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574447  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2227  hypothetical protein  46.05 
 
 
429 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410036  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2249  hypothetical protein  45.08 
 
 
432 aa  355  7.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0477  hypothetical protein  45.15 
 
 
443 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179646  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7591  hypothetical protein  43.18 
 
 
449 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29036  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0556  hypothetical protein  42.53 
 
 
453 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2980  hypothetical protein  37.95 
 
 
431 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.177531  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0362  hypothetical protein  33.33 
 
 
437 aa  232  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0639849  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0799  hypothetical protein  32.39 
 
 
468 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7530  hypothetical protein  28.78 
 
 
511 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4864  hypothetical protein  27.31 
 
 
462 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.739447 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0869  hypothetical protein  27.62 
 
 
477 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4788  hypothetical protein  27.08 
 
 
461 aa  126  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.110982 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0933  hypothetical protein  25.97 
 
 
473 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.298047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0894  hypothetical protein  25.97 
 
 
477 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.889276  normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5224  hypothetical protein  27.14 
 
 
478 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.313763  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6382  hypothetical protein  26.85 
 
 
482 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.260621  normal  0.316539 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  31.36 
 
 
456 aa  59.7  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3326  hypothetical protein  32 
 
 
479 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  31.25 
 
 
483 aa  51.6  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  32.87 
 
 
605 aa  50.8  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  25.93 
 
 
455 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4775  hypothetical protein  25.48 
 
 
602 aa  47.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2084  hypothetical protein  44.83 
 
 
463 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.446219  normal  0.0261738 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  22.93 
 
 
464 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4419  hypothetical protein  24.65 
 
 
303 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107264  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2267  hypothetical protein  30.32 
 
 
553 aa  44.7  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.593229 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2204  hypothetical protein  31.03 
 
 
409 aa  44.3  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4937  hypothetical protein  30.5 
 
 
440 aa  43.9  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>