45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1167 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1167  bifunctional DNA primase/polymerase  100 
 
 		 289 aa  591  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5166  bifunctional DNA primase/polymerase  56.54 
 
 		 289 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  42.34 
 
 		 283 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  41.61 
 
 		 283 aa  195  8.000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0745  Bifunctional DNA primase/polymerase  36.53 
 
 		 287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127407  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  39.63 
 
 		 717 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1980  hypothetical protein  40.08 
 
 		 266 aa  165  8e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  38.52 
 
 		 717 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  36.94 
 
 		 746 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  37.04 
 
 		 717 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2020  hypothetical protein  38.17 
 
 		 263 aa  155  9e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2824  hypothetical protein  38.17 
 
 		 263 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000228641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2853  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  37.02 
 
 		 266 aa  145  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000416381  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  34.26 
 
 		 746 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  34.26 
 
 		 746 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2837  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  38.25 
 
 		 183 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0750475  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1451  bifunctional DNA primase/polymerase  26.67 
 
 		 255 aa  87  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0151027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2521  Bifunctional DNA primase/polymerase  37.78 
 
 		 206 aa  82  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0275963  normal  0.180999 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  34.24 
 
 		 749 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0876  Bifunctional DNA primase/polymerase  36.42 
 
 		 599 aa  76.3  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.46542  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  31.8 
 
 		 667 aa  74.3  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1578  Bifunctional DNA primase/polymerase  36.92 
 
 		 1006 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.357329 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1926  bifunctional DNA primase/polymerase  34.91 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.394144  hitchhiker  0.00427695 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0062  hypothetical protein  32.87 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.199753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1213  bifunctional DNA primase/polymerase  33.85 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0963471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2259  hypothetical protein  22.5 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  34.03 
 
 		 955 aa  63.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2772  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.54 
 
 		 1002 aa  63.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.818875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3733  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.76 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.52 
 
 		 970 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.79 
 
 		 970 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1201  hypothetical protein  30.86 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000142595  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3896  hypothetical protein  32.57 
 
 		 692 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.425308  normal  0.91209 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2527  hypothetical protein  34.07 
 
 		 756 aa  53.5  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1346  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.82 
 
 		 289 aa  53.1  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111909  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6679  Bifunctional DNA primase/polymerase  38.26 
 
 		 201 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1983  Bifunctional DNA primase/polymerase  36.52 
 
 		 201 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0265  bifunctional DNA primase/polymerase  36.25 
 
 		 214 aa  50.4  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0228201  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8778  Bifunctional DNA primase/polymerase  28.57 
 
 		 223 aa  49.3  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.635311 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4368  Bifunctional DNA primase/polymerase  36.11 
 
 		 217 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2729  hypothetical protein  34.62 
 
 		 220 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4212  Bifunctional DNA primase/polymerase  34.21 
 
 		 304 aa  46.6  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567212  normal  0.394336 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0829  Bifunctional DNA primase/polymerase  36.72 
 
 		 305 aa  45.8  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2843  hypothetical protein  33.33 
 
 		 102 aa  43.5  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00805434  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2304  hypothetical protein  31.78 
 
 		 158 aa  42.4  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0886627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>