More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1431 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1431  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
164 aa  338  2e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4372  isochorismatase family protein  52.83 
 
 
170 aa  188  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4009  isochorismatase family protein  53.37 
 
 
169 aa  186  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4338  isochorismatase family protein  53.12 
 
 
170 aa  186  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3999  isochorismatase family protein  52.76 
 
 
169 aa  185  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4278  isochorismatase family protein  52.76 
 
 
169 aa  185  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4391  isochorismatase family protein  51.57 
 
 
170 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0862  isochorismatase family protein  51.57 
 
 
170 aa  181  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0367  amidase  50.96 
 
 
166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4160  isochorismatase family protein  50.33 
 
 
153 aa  163  8e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2347  amidase  48.45 
 
 
164 aa  159  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00237714  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0547  amidase  41.88 
 
 
161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145331  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5659  isochorismatase hydrolase  36.91 
 
 
177 aa  117  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.616311  normal  0.236437 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3564  isochorismatase hydrolase  37.42 
 
 
177 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  36 
 
 
176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  35.1 
 
 
359 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  34.67 
 
 
174 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  35.1 
 
 
359 aa  110  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  33.77 
 
 
176 aa  110  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  33.77 
 
 
176 aa  110  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  33.77 
 
 
176 aa  110  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2135  isochorismatase hydrolase  36.05 
 
 
177 aa  107  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1847  isochorismatase hydrolase  35.17 
 
 
177 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.614848  hitchhiker  0.00000933231 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  34 
 
 
176 aa  105  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1230  isochorismatase hydrolase  35.95 
 
 
174 aa  105  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  34.67 
 
 
176 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2678  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 
184 aa  104  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2817  isochorismatase hydrolase  33.82 
 
 
188 aa  99.8  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369083  hitchhiker  0.00306149 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2838  isochorismatase hydrolase  33.12 
 
 
174 aa  99.8  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102988  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2534  isochorismatase hydrolase  34.42 
 
 
174 aa  100  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.70955  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1403  isochorismatase hydrolase  36.11 
 
 
175 aa  99.4  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2701  isochorismatase  33.57 
 
 
168 aa  98.2  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1224  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
181 aa  98.2  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1153  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
181 aa  97.8  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0487  isochorismatase hydrolase  29.7 
 
 
183 aa  97.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.972949 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1154  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
181 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.399552  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2589  isochorismatase hydrolase  29.09 
 
 
183 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0515  isochorismatase hydrolase  29.09 
 
 
183 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170108  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1652  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 
173 aa  95.1  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  29.19 
 
 
173 aa  94.7  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3602  isochorismatase hydrolase  28.48 
 
 
183 aa  94  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.865119 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0076  isochorismatase hydrolase  33.56 
 
 
184 aa  93.6  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3421  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 
176 aa  92  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0489  isochorismatase hydrolase  31.88 
 
 
184 aa  91.7  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0419  isochorismatase hydrolase  27.88 
 
 
183 aa  91.3  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.860585  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2926  isochorismatase family protein  27.33 
 
 
183 aa  89.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  32.53 
 
 
180 aa  89  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0445  isochorismatase hydrolase  26.67 
 
 
183 aa  89  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0251  isochorismatase family protein  30 
 
 
176 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1978  isochorismatase hydrolase  29.93 
 
 
185 aa  87.8  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3597  isochorismatase family protein  25.47 
 
 
237 aa  87  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0508  isochorismatase family protein  25.47 
 
 
183 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.537066  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1936  isochorismatase family protein  25.47 
 
 
183 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0966  isochorismatase family protein  25.47 
 
 
183 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.145103  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3608  isochorismatase family protein  25.47 
 
 
237 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0670  isochorismatase family protein  25.47 
 
 
183 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2883  isochorismatase hydrolase  28.48 
 
 
183 aa  86.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226746  normal  0.142757 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2716  isochorismatase hydrolase  29.7 
 
 
183 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1927  isochorismatase hydrolase  28.38 
 
 
172 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.110403  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3583  isochorismatase family protein  25.47 
 
 
183 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.46144  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1660  isochorismatase family protein  28.57 
 
 
173 aa  85.1  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000971288  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4942  isochorismatase hydrolase  27.14 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0334336 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  27.11 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1174  isochorismatase hydrolase  24.84 
 
 
216 aa  81.3  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.910338  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0812  isochorismatase hydrolase  27.66 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2188  isochorismatase hydrolase  25.97 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288867  normal  0.048401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5030  isochorismatase hydrolase  25.79 
 
 
186 aa  77.8  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0593911  decreased coverage  0.00786893 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  32.21 
 
 
187 aa  77.8  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  32.21 
 
 
187 aa  77.8  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  29.45 
 
 
185 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4372  isochorismatase hydrolase  29.58 
 
 
199 aa  77  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0306857  normal  0.52694 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  24.68 
 
 
186 aa  77  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1721  isochorismatase hydrolase  27.21 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  25.93 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  28.19 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  28.86 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  28.86 
 
 
187 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  27.27 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  30.2 
 
 
187 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  30.2 
 
 
187 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  27.21 
 
 
181 aa  74.3  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  30.2 
 
 
187 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  30.2 
 
 
187 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  29.53 
 
 
185 aa  74.3  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 
187 aa  73.9  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  30.13 
 
 
199 aa  73.9  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  30.13 
 
 
199 aa  73.9  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  30.13 
 
 
199 aa  73.9  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  30.97 
 
 
181 aa  73.6  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  27.81 
 
 
210 aa  72  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  26.06 
 
 
196 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1761  isochorismatase family protein  27.95 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  27.15 
 
 
190 aa  71.6  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1917  isochorismatase hydrolase  26.9 
 
 
190 aa  71.6  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  28.19 
 
 
181 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 
231 aa  70.5  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>