More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0474 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0474  cell cycle protein  100 
 
 		 397 aa  805    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000113448  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0262  cell division membrane protein  56.17 
 
 		 404 aa  469  1.0000000000000001e-131  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1232  cell division membrane protein  54.64 
 
 		 398 aa  461  9.999999999999999e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000556931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0670  cell division membrane protein  54.52 
 
 		 407 aa  422  1e-117  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0972  cell division membrane protein  49.23 
 
 		 414 aa  370  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0621  rod shape-determining protein RodA, putative  46.11 
 
 		 401 aa  349  6e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.898284  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1197  cell division protein  46.17 
 
 		 475 aa  324  2e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.561695  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0779  cell cycle protein  35.46 
 
 		 390 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1634  cell cycle protein  35.46 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1691  cell cycle protein FtsW  38.3 
 
 		 403 aa  234  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.951767  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1113  cell cycle protein  36.6 
 
 		 386 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4083  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  34.96 
 
 		 386 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1325  cell cycle protein FtsW  34.7 
 
 		 386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1258  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  34.97 
 
 		 386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1106  cell division protein ftsW  35.48 
 
 		 386 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.058773  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1100  stage V sporulation protein E  35.48 
 
 		 386 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1287  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  35.48 
 
 		 386 aa  216  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1363  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  35.46 
 
 		 386 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2121  cell cycle protein  44.6 
 
 		 400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0218982  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2159  cell cycle protein  44.6 
 
 		 400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  34.55 
 
 		 365 aa  211  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0919  cell cycle protein  38.64 
 
 		 386 aa  209  6e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00189274  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  31.63 
 
 		 369 aa  192  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  32.4 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  30.98 
 
 		 380 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4064  cell cycle protein FtsW  33.67 
 
 		 392 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00280746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4381  cell cycle protein FtsW  33.67 
 
 		 392 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000586046  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4289  cell division protein, FtsW/RodA/SpoVE family  34.35 
 
 		 392 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000204689  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4231  cell cycle protein FtsW  34.1 
 
 		 392 aa  187  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000283909  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3911  cell cycle protein FtsW  34.35 
 
 		 392 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0342501  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3902  cell cycle protein FtsW  33.33 
 
 		 392 aa  186  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189627  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4179  cell division protein, FtsW/RodA/SpoVE family  33.33 
 
 		 392 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00281281 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4000  cell cycle protein  34.26 
 
 		 392 aa  186  6e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00611933  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  30.59 
 
 		 388 aa  184  3e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  32.82 
 
 		 371 aa  182  6e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  29.12 
 
 		 374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0965  cell division protein, FtsW/RodA/SpoVE family  33.33 
 
 		 392 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00243043  normal  0.190931 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4269  cell division protein, FtsW/RodA/SpoVE family  34.38 
 
 		 392 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  32.55 
 
 		 373 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  31.03 
 
 		 403 aa  170  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  31.66 
 
 		 364 aa  168  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2853  cell cycle protein  32.56 
 
 		 392 aa  167  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000185268  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  32.91 
 
 		 377 aa  166  8e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  31.62 
 
 		 378 aa  166  9e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2113  stage V sporulation protein E  29.49 
 
 		 374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.985663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  31.13 
 
 		 366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  31.59 
 
 		 379 aa  164  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  29.93 
 
 		 376 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  30.23 
 
 		 378 aa  162  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2816  cell cycle protein  31.62 
 
 		 374 aa  161  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  30.87 
 
 		 387 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1730  rod shape-determining protein RodA  29.43 
 
 		 407 aa  159  5e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0257403  decreased coverage  0.00417518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  29.79 
 
 		 367 aa  159  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2306  cell cycle protein  31.67 
 
 		 426 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.186468  hitchhiker  0.000727648 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09500  cell division membrane protein  32.04 
 
 		 606 aa  158  2e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0513587 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0568  rod shape-determining protein RodA  27.61 
 
 		 421 aa  157  3e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  30.71 
 
 		 373 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2662  rod shape-determining protein RodA  30.55 
 
 		 398 aa  156  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0956  rod shape-determining protein RodA  33.04 
 
 		 382 aa  156  8e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215548  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  30.12 
 
 		 373 aa  155  9e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  30.71 
 
 		 373 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  33.68 
 
 		 384 aa  155  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  28.3 
 
 		 419 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2103  cell cycle protein FtsW  28.35 
 
 		 374 aa  155  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000319192  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06110  rod shape-determining protein RodA  31.02 
 
 		 404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000223269 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2391  cell cycle protein FtsW  28.03 
 
 		 374 aa  153  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00202721  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  31.14 
 
 		 368 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  27.74 
 
 		 390 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  31.43 
 
 		 417 aa  152  7e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0631  rod shape-determining protein RodA  33.94 
 
 		 418 aa  152  8e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0474  rod shape-determining protein RodA  31.13 
 
 		 378 aa  152  8e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268193  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  29.02 
 
 		 417 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1034  cell cycle protein  30.66 
 
 		 402 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  29.02 
 
 		 417 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0420  cell cycle protein  27.9 
 
 		 408 aa  152  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000126174  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0500  rod shape-determining protein RodA  29.44 
 
 		 384 aa  151  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107532 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0659  rod shape-determining protein RodA  29.37 
 
 		 386 aa  151  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  30.36 
 
 		 426 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  31.71 
 
 		 363 aa  150  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  29.32 
 
 		 407 aa  150  3e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1919  rod shape-determining protein RodA  30.97 
 
 		 360 aa  149  8e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.403487  hitchhiker  0.000000909205 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  31.96 
 
 		 371 aa  148  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  29.47 
 
 		 369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  30.23 
 
 		 374 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  33.8 
 
 		 382 aa  148  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0663  rod shape-determining protein RodA  33.8 
 
 		 362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00441325  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  30 
 
 		 382 aa  147  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1353  rod shape-determining protein RodA  24.66 
 
 		 433 aa  147  3e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  30.83 
 
 		 372 aa  147  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  31.52 
 
 		 372 aa  147  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  31.52 
 
 		 368 aa  147  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  30.95 
 
 		 368 aa  147  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2368  cell cycle protein  28.57 
 
 		 389 aa  147  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0217329  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07034  hypothetical protein  27.56 
 
 		 360 aa  146  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  32.49 
 
 		 373 aa  146  5e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14200  cell division membrane protein  32.16 
 
 		 405 aa  146  5e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  30.43 
 
 		 368 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  31.15 
 
 		 368 aa  147  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  30.43 
 
 		 368 aa  146  6e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  30.43 
 
 		 368 aa  146  6e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>