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for query gene Lreu_0360 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0360  major facilitator transporter  100 
 
 		 461 aa  909    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1423  major facilitator superfamily permease  56.95 
 
 		 464 aa  496  1e-139  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.904673  hitchhiker  0.0000661431 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1853  major facilitator superfamily permease  52.16 
 
 		 471 aa  475  1e-133  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.68 
 
 		 485 aa  328  9e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1471  major facilitator superfamily permease  38.33 
 
 		 454 aa  290  4e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00462633  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0049  sugar efflux permease  38.28 
 
 		 485 aa  288  1e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0290  major facilitator superfamily permease  35.57 
 
 		 463 aa  286  5e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.146864  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1088  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.57 
 
 		 446 aa  261  1e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0456  major facilitator superfamily permease  35.26 
 
 		 462 aa  257  4e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0963  major facilitator superfamily permease  34.14 
 
 		 449 aa  248  2e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.337437  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1318  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.04 
 
 		 465 aa  235  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0734  lincomycin resistance protein  33.26 
 
 		 480 aa  234  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.498733  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1003  lincomycin resistance protein LmrB  33.26 
 
 		 480 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.2001  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1628  major facilitator superfamily permease  32.5 
 
 		 457 aa  233  4.0000000000000004e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0280  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 466 aa  230  4e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040332  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2424  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.09 
 
 		 496 aa  223  8e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.153591 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1468  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.7 
 
 		 491 aa  221  3e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.986472  normal  0.151461 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06270  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.85 
 
 		 490 aa  219  8.999999999999998e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0877  major facilitator superfamily permease  30.02 
 
 		 496 aa  218  2e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.192576  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0725  major facilitator superfamily permease  33.75 
 
 		 490 aa  218  2e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.29773 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0937  major facilitator superfamily permease  32.46 
 
 		 463 aa  217  2.9999999999999998e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.343736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1115  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.43 
 
 		 491 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0959  permease, general substrate transporter  32.07 
 
 		 482 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0281229  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2440  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.7 
 
 		 479 aa  214  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2488  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.7 
 
 		 479 aa  214  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0988  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.12 
 
 		 491 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0971  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.17 
 
 		 482 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4325  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.91 
 
 		 491 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1038  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.17 
 
 		 482 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1116  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.07 
 
 		 482 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000271146 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.43 
 
 		 491 aa  212  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0888  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.42 
 
 		 486 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1459  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.84 
 
 		 483 aa  211  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.257317  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.42 
 
 		 486 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0949  permease, general substrate transporter  31.63 
 
 		 482 aa  210  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000025972  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1519  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.38 
 
 		 502 aa  210  4e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1833  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.62 
 
 		 564 aa  210  4e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0281974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1028  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.81 
 
 		 491 aa  209  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10576e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3232  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.42 
 
 		 513 aa  206  8e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1863  major facilitator superfamily permease  31.31 
 
 		 465 aa  205  1e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0147099  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0161  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.9 
 
 		 494 aa  203  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2014  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.91 
 
 		 513 aa  203  6e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2937  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.12 
 
 		 492 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2922  multidrug resistance protein B  32.41 
 
 		 492 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.16 
 
 		 492 aa  200  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3251  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.16 
 
 		 492 aa  200  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3230  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.16 
 
 		 492 aa  199  6e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0268  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.84 
 
 		 500 aa  199  6e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0312698  decreased coverage  0.00157172 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2982  multidrug resistance protein B  32.16 
 
 		 492 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30030  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.49 
 
 		 487 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00171806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0659  permease of the major facilitator superfamily  31.82 
 
 		 683 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2448  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.21 
 
 		 570 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1383  major facilitator superfamily permease  31.49 
 
 		 519 aa  197  4.0000000000000005e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.601618  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.66 
 
 		 492 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.66 
 
 		 492 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0356226  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1707  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.77 
 
 		 499 aa  196  6e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00395265  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0845  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.5 
 
 		 489 aa  196  7e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222515  normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.78 
 
 		 635 aa  194  4e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.36 
 
 		 561 aa  193  4e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0683901  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.75 
 
 		 490 aa  194  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.56 
 
 		 500 aa  192  8e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000893352  hitchhiker  0.00471574 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2340  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.67 
 
 		 472 aa  191  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4699  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.28 
 
 		 599 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.07 
 
 		 579 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0561  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.52 
 
 		 599 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000151463  hitchhiker  0.00000000000000678179 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.18 
 
 		 479 aa  190  4e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.239731  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05820  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.69 
 
 		 510 aa  190  5e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.835158  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4676  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.43 
 
 		 599 aa  189  7e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00195609  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4692  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.43 
 
 		 599 aa  189  9e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000143582  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4399  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.44 
 
 		 597 aa  189  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00696651  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22510  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.75 
 
 		 494 aa  188  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.319093  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4464  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.18 
 
 		 599 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.737474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4299  multidrug resistance protein B  31.93 
 
 		 599 aa  187  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.649426  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4310  multidrug resistance protein B  32.18 
 
 		 599 aa  187  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4812  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.18 
 
 		 599 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.127812  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4683  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.93 
 
 		 599 aa  186  7e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.74665e-44 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3194  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.06 
 
 		 484 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.794509  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.47 
 
 		 657 aa  182  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2236  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.29 
 
 		 481 aa  181  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.126562  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2198  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.29 
 
 		 481 aa  181  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0460557  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.02 
 
 		 492 aa  179  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2739  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.24 
 
 		 482 aa  178  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000169232  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_5520  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.55 
 
 		 502 aa  178  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011832  Mpal_0874  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.49 
 
 		 479 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132531  normal  1 
 
 
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NC_008531  LEUM_1880  major facilitator superfamily permease  27.27 
 
 		 503 aa  173  5.999999999999999e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013169  Ksed_14700  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.36 
 
 		 491 aa  169  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0438074  normal  0.116411 
 
 
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NC_008528  OEOE_1378  major facilitator superfamily permease  30.57 
 
 		 512 aa  169  1e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0602023  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_1686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.09 
 
 		 620 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.892029  n/a   
 
 
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NC_010816  BLD_0998  putative permease  26.36 
 
 		 548 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013170  Ccur_08630  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.74 
 
 		 509 aa  167  5e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.315329 
 
 
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NC_014158  Tpau_3099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.43 
 
 		 491 aa  166  8e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.09 
 
 		 524 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.82 
 
 		 545 aa  164  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
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NC_013204  Elen_2756  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.5 
 
 		 471 aa  164  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.35 
 
 		 558 aa  163  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013721  HMPREF0424_0354  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-2 (14 Spanner) (DHA2) family protein  28.47 
 
 		 542 aa  163  8.000000000000001e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_002976  SERP1944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.48 
 
 		 658 aa  162  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009513  Lreu_0947  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.35 
 
 		 462 aa  161  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000410718  n/a   
 
 
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NC_013172  Bfae_02600  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.17 
 
 		 505 aa  161  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.16 
 
 		 501 aa  157  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal  1 
 
 
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