More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0217 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0217  ABC transporter related  100 
 
 		 223 aa  456  1e-127  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000121534  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1187  ABC-type Mn/Zn transport system, ATPase component  46.05 
 
 		 222 aa  195  4.0000000000000005e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1610  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  42.33 
 
 		 234 aa  188  5e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1721  ABC-type Mn/Zn transport system, ATPase component  40.83 
 
 		 219 aa  179  2e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0049176  normal  0.88326 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0804  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  45.95 
 
 		 228 aa  179  2e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.321319  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2475  ABC transporter related  38.39 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.322042  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2614  ABC transporter related  34.98 
 
 		 273 aa  142  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.781657  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  36.36 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  37.98 
 
 		 251 aa  142  6e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0140  ATPase  37.02 
 
 		 252 aa  138  7e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0265592  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  37.79 
 
 		 536 aa  138  7.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0043  ABC transporter related  34.89 
 
 		 247 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016055  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1231  ABC transporter related  35.71 
 
 		 275 aa  135  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  36.11 
 
 		 243 aa  135  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0097  ABC transporter ATP-binding protein  31.9 
 
 		 281 aa  134  8e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00699805  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  33.49 
 
 		 271 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  33.49 
 
 		 262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0439  ABC transporter related  34.13 
 
 		 237 aa  131  6.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0164474  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1834  ABC transporter related  35.71 
 
 		 249 aa  131  9e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0815  ABC transporter-related protein  32.71 
 
 		 255 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0597  ABC transporter related protein  32.68 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0206  ABC transporter related  36.79 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1339  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.41 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1589  ABC transporter related protein  32.14 
 
 		 250 aa  129  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.741401  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  34.13 
 
 		 251 aa  129  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  33.17 
 
 		 255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  33.18 
 
 		 490 aa  128  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4497  ABC transporter related  33.03 
 
 		 262 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0293  ABC transporter related  34.4 
 
 		 273 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0061  ABC transporter-like  33.03 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0964  ABC transporter related protein  31.63 
 
 		 250 aa  126  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000527176  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0118  zinc ABC transporter ATP-binding protein  33.03 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550689  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5266  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  33.49 
 
 		 264 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3498  ABC transporter related  30.49 
 
 		 298 aa  126  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.807491  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1536  ABC transporter related  31.82 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.591155 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1974  ABC transporter, ATP-binding component  26.48 
 
 		 235 aa  126  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0277  ABC transporter  33.49 
 
 		 262 aa  125  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1512  ABC transporter-related protein  31.16 
 
 		 419 aa  125  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  32.02 
 
 		 258 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  31.7 
 
 		 258 aa  125  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  32.02 
 
 		 258 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4707  ABC transporter related  32.41 
 
 		 246 aa  124  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.148453 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0844  ABC transporter, ATP-binding protein  30.7 
 
 		 247 aa  124  9e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0133  ABC transporter related  32.58 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.875214  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2734  ABC transporter related  34.8 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0135  ABC transporter related  32.58 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0238  ABC transporter related  34.26 
 
 		 268 aa  124  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.904203  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  32.84 
 
 		 257 aa  123  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  32.12 
 
 		 249 aa  123  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  34.69 
 
 		 255 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1046  ABC transporter related  32.11 
 
 		 303 aa  123  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00960744 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5110  ABC transporter related  32.54 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155841 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  29.6 
 
 		 247 aa  122  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1174  ABC transporter related  31.34 
 
 		 299 aa  122  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2368  ABC transporter related  32.24 
 
 		 271 aa  122  5e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.457154  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1265  ABC transporter related  30.73 
 
 		 417 aa  122  5e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  30.56 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2110  high-affinity zinc transporter ATPase  33.17 
 
 		 252 aa  122  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.03365  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31320  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  29.96 
 
 		 248 aa  122  6e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  33.49 
 
 		 419 aa  121  7e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0517  ABC transporter related  30.09 
 
 		 221 aa  121  8e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2138  ABC transporter related  33.93 
 
 		 250 aa  121  9e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000174943  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5387  ABC transporter related  33.86 
 
 		 297 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2422  ABC transporter, ATPase subunit  31.73 
 
 		 243 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  29.86 
 
 		 262 aa  120  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2028  high-affinity zinc transporter ATPase  32.23 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000463637  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  26.13 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2418  high-affinity zinc transporter ATPase  32.23 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000136386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2141  high-affinity zinc transporter ATPase  32.23 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523948  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2845  ABC transporter related  27.56 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18340  ABC transporter related  30.37 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000733695  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  32.6 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0623  ABC transporter related  33.84 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3726  ABC transporter related  31.02 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1826  high-affinity zinc transporter ATPase  32.7 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11011  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2774  high-affinity zinc transporter ATPase  31.73 
 
 		 252 aa  119  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000747902  hitchhiker  0.00672934 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  31.02 
 
 		 255 aa  119  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18240  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  32.2 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  30.67 
 
 		 258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1317  ATPase  30.29 
 
 		 245 aa  119  4.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0486  ABC transporter related  37.1 
 
 		 309 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0680006  hitchhiker  0.00154743 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0517  manganese transport system ATP-binding protein MntA  29.67 
 
 		 273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  30.59 
 
 		 250 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2427  high-affinity zinc transporter ATPase  32.86 
 
 		 251 aa  118  6e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000130602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1729  ABC transporter ATP-binding protein  28.16 
 
 		 251 aa  118  6e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  26.82 
 
 		 249 aa  118  7e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0926  ABC transporter related  32.26 
 
 		 249 aa  118  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18612  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1193  ABC transporter related protein  30.4 
 
 		 250 aa  118  7e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  29.58 
 
 		 240 aa  118  7e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0823  ABC transporter related  29.58 
 
 		 240 aa  118  7e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0576  ABC transporter related  29.86 
 
 		 258 aa  118  7.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.925588  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0610  ABC transporter related protein  33.49 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.594594  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  30.84 
 
 		 256 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3250  ABC transporter related  36.65 
 
 		 313 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.811224  normal  0.498578 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  30.84 
 
 		 256 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  30 
 
 		 258 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  30.88 
 
 		 266 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00850  zinc ABC transporter, ATP binding protein  32.13 
 
 		 257 aa  117  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5103  ABC transporter related  36.51 
 
 		 257 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.250268 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3573  ABC transporter related  36.07 
 
 		 313 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>