More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3800 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  100 
 
 		 176 aa  355  1.9999999999999998e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  69.49 
 
 		 185 aa  241  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  59.63 
 
 		 179 aa  197  5e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  59.04 
 
 		 179 aa  197  9e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  61.54 
 
 		 184 aa  187  5.999999999999999e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  54.88 
 
 		 187 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  55.56 
 
 		 179 aa  162  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04752  chemotaxis protein  50 
 
 		 171 aa  157  9e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  46.91 
 
 		 178 aa  148  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  42.51 
 
 		 178 aa  148  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  44.65 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  44.03 
 
 		 164 aa  144  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  49.03 
 
 		 169 aa  141  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  41.25 
 
 		 164 aa  140  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  43.42 
 
 		 164 aa  140  8e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  40.12 
 
 		 164 aa  140  8e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  42.33 
 
 		 169 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  45.78 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  41.29 
 
 		 157 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  44.44 
 
 		 194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  44.44 
 
 		 194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  44.44 
 
 		 192 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  44.3 
 
 		 169 aa  139  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  40.13 
 
 		 163 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  44.59 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.02 
 
 		 164 aa  136  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  44.67 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  44.14 
 
 		 161 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  43.51 
 
 		 179 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  42.86 
 
 		 169 aa  134  9e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  43.59 
 
 		 173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  43.24 
 
 		 161 aa  131  6e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  37.42 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  38.89 
 
 		 171 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  41.67 
 
 		 167 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  37.27 
 
 		 185 aa  127  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  37.65 
 
 		 181 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  37.27 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  42.94 
 
 		 205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  38.61 
 
 		 164 aa  122  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  37.74 
 
 		 167 aa  119  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  39.02 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  39.07 
 
 		 164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  39.07 
 
 		 164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  39.74 
 
 		 165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  39.07 
 
 		 170 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1529  CheW protein  39.86 
 
 		 183 aa  117  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.205941 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2373  chemotaxis protein CheW  38.36 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.158617  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  37.34 
 
 		 160 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  36.84 
 
 		 170 aa  114  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1692  CheW protein  40.85 
 
 		 191 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484464  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  36.84 
 
 		 170 aa  114  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  36.84 
 
 		 170 aa  114  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.57 
 
 		 170 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  38.99 
 
 		 158 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2141  chemotaxis protein CheW2  37.11 
 
 		 170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183407  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0231  chemotaxis protein CheW  37.11 
 
 		 170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1984  chemotaxis protein CheW  37.11 
 
 		 170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0928  chemotaxis protein CheW  37.11 
 
 		 170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  34.57 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2003  chemotaxis protein CheW  37.11 
 
 		 170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1570  chemotaxis protein CheW  37.11 
 
 		 170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0789103  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  31.03 
 
 		 218 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1129  chemotaxis protein CheW  37.11 
 
 		 158 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.127298  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  40 
 
 		 157 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  34.18 
 
 		 165 aa  112  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1763  CheW protein  39.44 
 
 		 191 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  30.32 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  36.53 
 
 		 163 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  38.75 
 
 		 163 aa  111  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  38.3 
 
 		 185 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0620  CheW protein  38.78 
 
 		 212 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0159929 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  34.84 
 
 		 158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  38.67 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  35.58 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  34.73 
 
 		 163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  35.53 
 
 		 174 aa  108  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2363  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like protein  41.13 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  37.42 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  36.17 
 
 		 183 aa  108  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  37.86 
 
 		 158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  33.73 
 
 		 169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  33.75 
 
 		 159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  34.15 
 
 		 163 aa  108  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2186  CheW protein  38.46 
 
 		 194 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  33.54 
 
 		 174 aa  108  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  44.62 
 
 		 158 aa  107  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  35.29 
 
 		 156 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  36.3 
 
 		 174 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  34.69 
 
 		 160 aa  107  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  39.57 
 
 		 145 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  37.86 
 
 		 187 aa  107  8.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  31.1 
 
 		 164 aa  107  8.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  44.88 
 
 		 158 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  32.34 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  34.9 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  32.34 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  40 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  32.34 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  32.34 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>