More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2461 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2461  methylmalonyl-CoA decarboxylase  100 
 
 		 259 aa  528  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000140768 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3534  methylmalonyl-CoA decarboxylase  52.12 
 
 		 259 aa  296  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0684  methylmalonyl-CoA decarboxylase  50.97 
 
 		 259 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0753206  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0696  methylmalonyl-CoA decarboxylase  50.97 
 
 		 259 aa  281  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000012263 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1378  methylmalonyl-CoA decarboxylase  50.59 
 
 		 260 aa  278  7e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1611  methylmalonyl-CoA decarboxylase  50.79 
 
 		 271 aa  271  6e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3341  methylmalonyl-CoA decarboxylase  46.54 
 
 		 261 aa  256  3e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02750  methylmalonyl-CoA decarboxylase, biotin-independent  48.19 
 
 		 261 aa  254  7e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.19 
 
 		 261 aa  254  7e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0791  methylmalonyl-CoA decarboxylase  48.19 
 
 		 261 aa  254  7e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3055  methylmalonyl-CoA decarboxylase  48.19 
 
 		 261 aa  254  7e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3246  methylmalonyl-CoA decarboxylase  48.19 
 
 		 261 aa  254  7e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4215  methylmalonyl-CoA decarboxylase  48.19 
 
 		 261 aa  254  7e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02713  hypothetical protein  48.19 
 
 		 261 aa  254  7e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3077  methylmalonyl-CoA decarboxylase  48.19 
 
 		 261 aa  254  7e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0459  methylmalonyl-CoA decarboxylase  38.89 
 
 		 269 aa  195  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0938  methylmalonyl-CoA decarboxylase  38.89 
 
 		 269 aa  195  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4040  methylmalonyl-CoA decarboxylase  38.1 
 
 		 269 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.642217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2996  methylmalonyl-CoA decarboxylase  38.58 
 
 		 266 aa  191  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0900  methylmalonyl-CoA decarboxylase  38.49 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 		 263 aa  126  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3883  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.4 
 
 		 262 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0303551  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3799  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.4 
 
 		 262 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0645207  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0858  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.58 
 
 		 264 aa  121  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.229661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3742  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.262023  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 		 258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.68 
 
 		 254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  35.94 
 
 		 261 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  34.23 
 
 		 261 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.27 
 
 		 255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4560  short chain enoyl-CoA hydratase  33.71 
 
 		 256 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127005  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  35.04 
 
 		 261 aa  111  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  33.98 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  33.98 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  34.65 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  31.54 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  33.98 
 
 		 297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.98 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  34.65 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  33.98 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  33.98 
 
 		 297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  33.59 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  34.65 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  33.98 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  34.65 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2620  enoyl-CoA hydratase  27.95 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124427  normal  0.0671536 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4763  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.84 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254643  normal  0.582812 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3860  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.39 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.897739 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  29.69 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0245  enoyl-CoA hydratase  31.05 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1048  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.67 
 
 		 265 aa  109  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5352  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 		 265 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5509  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 		 265 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.02 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.28 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2032  short chain enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  32.57 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  32.42 
 
 		 254 aa  107  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.13 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.71 
 
 		 267 aa  106  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.13 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.13 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  33.59 
 
 		 261 aa  105  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2805  enoyl-CoA hydratase  26.95 
 
 		 273 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  30.27 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4733  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.04 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  30.43 
 
 		 258 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  30.2 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.13 
 
 		 270 aa  103  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.96 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0222  enoyl-CoA hydratase  31.32 
 
 		 253 aa  102  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  31.15 
 
 		 261 aa  102  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.46 
 
 		 260 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2793  carnitinyl-CoA dehydratase  32.41 
 
 		 262 aa  102  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0149  short chain enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 		 266 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.227059  normal  0.14158 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0655  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.57 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2344  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.04 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0973  enoyl-CoA hydratase  31.64 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0850913 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1736  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.77 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.841182 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  28.46 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  29.39 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  31.1 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  30.62 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  30.62 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  30.62 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  30.62 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  30.62 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  30.62 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  31.52 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2485  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.23 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.380203 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  30.62 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 		 262 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3023  enoyl-CoA hydratase  26.91 
 
 		 269 aa  99.4  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.84 
 
 		 257 aa  99.4  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  30.56 
 
 		 264 aa  99  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.8 
 
 		 259 aa  98.6  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  27.03 
 
 		 260 aa  99  8e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>