89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1897 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1897  ribonuclease P  100 
 
 		 122 aa  248  3e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.53987e-16  hitchhiker  4.71177e-26 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  60.17 
 
 		 117 aa  134  4e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  55.14 
 
 		 115 aa  114  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2064  ribonuclease P  52.17 
 
 		 116 aa  113  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0143582  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  53.27 
 
 		 115 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  53.27 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  53.27 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  53.27 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  53.27 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  53.27 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  53.27 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  52.34 
 
 		 115 aa  111  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  52.34 
 
 		 115 aa  111  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  52.68 
 
 		 109 aa  110  4.0000000000000004e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  51.4 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  51.4 
 
 		 115 aa  108  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  47.46 
 
 		 117 aa  103  8e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  47.75 
 
 		 111 aa  100  9e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  48.67 
 
 		 115 aa  99.8  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  46.02 
 
 		 117 aa  96.7  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  46.02 
 
 		 117 aa  96.7  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  46.15 
 
 		 116 aa  94  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1863  RNase P protein component  39.83 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.546361  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  34.45 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  39.13 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  33.04 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  35.4 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  29.92 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  35.85 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  29.84 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  33.96 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  34.31 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  39.77 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  34.86 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1040  ribonuclease P protein component  41.38 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000299838  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  34.38 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  34.31 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2198  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000952989  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0766  ribonuclease P protein component  29.75 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000948284  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  26.27 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  36.67 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  38.95 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  30.17 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  30.17 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0685  ribonuclease P protein component  32.14 
 
 		 140 aa  52  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  29.41 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  34.65 
 
 		 109 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4044  ribonuclease P protein component  32.22 
 
 		 152 aa  51.6  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.534814 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  27.05 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  35.23 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  35.56 
 
 		 116 aa  50.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  35.56 
 
 		 116 aa  50.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682  ribonuclease P protein component  34.41 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1265  ribonuclease P protein component  26.5 
 
 		 127 aa  50.4  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000149389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3433  ribonuclease P  30 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2762  ribonuclease P protein component  36.96 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000158886  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0869  ribonuclease P protein component  31.37 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2883  ribonuclease P protein component  31.96 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0117467  normal  0.419637 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1331  ribonuclease P protein component  40.79 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271159  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  28.57 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002014  ribonuclease P protein component  34.09 
 
 		 107 aa  47.8  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000192203  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00437  ribonuclease P  32.97 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2513  ribonuclease P  34.07 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477039  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3320  ribonuclease P protein component  25 
 
 		 120 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  32 
 
 		 126 aa  45.4  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  32 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  31.03 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  27.78 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0004  ribonuclease P  32.61 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00123584  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4062  ribonuclease P  28.93 
 
 		 127 aa  43.5  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1040  ribonuclease P protein component  28.43 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0513155  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4101  ribonuclease P  28.57 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  30.33 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  32 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1355  ribonuclease P protein component  40.28 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00991852  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0873  ribonuclease P protein component  41.07 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0983  ribonuclease P protein component  28.43 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.162194  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0821  ribonuclease P protein component  27.45 
 
 		 108 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03486  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  30.21 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  27.91 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4486  ribonuclease P protein component  34.21 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000175876  hitchhiker  0.00000000129187 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  31.33 
 
 		 130 aa  40.4  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5311  ribonuclease P  34.94 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346243 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73420  ribonuclease P  35.37 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0472215  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0008  ribonuclease P  34.94 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000255186 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3897  ribonuclease P protein component  33.72 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0590207  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  36.67 
 
 		 240 aa  40.4  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0503027 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>