More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0206 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0206  Mg-dependent DNase  100 
 
 		 256 aa  531  1e-150  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000791491  normal  0.0173908 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  50.59 
 
 		 260 aa  281  7.000000000000001e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  50.98 
 
 		 258 aa  276  2e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0211  TatD family hydrolase  49.21 
 
 		 269 aa  270  2e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0715  Mg-dependent DNase  47.27 
 
 		 258 aa  265  4e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  45.2 
 
 		 265 aa  235  4e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  46.27 
 
 		 257 aa  235  5.0000000000000005e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  45.49 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1551  Mg-dependent DNase  42.52 
 
 		 274 aa  220  9.999999999999999e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  43.53 
 
 		 256 aa  219  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  42.97 
 
 		 255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  42.13 
 
 		 255 aa  214  8e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  42.13 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  41.73 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  41.73 
 
 		 255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  41.73 
 
 		 255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  41.73 
 
 		 255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  41.73 
 
 		 255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  41.73 
 
 		 255 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  41.34 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  40 
 
 		 258 aa  209  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  40.94 
 
 		 255 aa  209  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  41.11 
 
 		 253 aa  206  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  41.18 
 
 		 256 aa  202  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  42.23 
 
 		 256 aa  202  6e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  41.41 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  40.78 
 
 		 259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  39.76 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  39.76 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  39.37 
 
 		 256 aa  192  5e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  41.96 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  40.71 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  40.32 
 
 		 255 aa  189  5e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  41.41 
 
 		 251 aa  188  5.999999999999999e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  38.19 
 
 		 268 aa  188  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  39.85 
 
 		 267 aa  188  8e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  38.46 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  37.15 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  39.53 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  40 
 
 		 261 aa  185  7e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  37.01 
 
 		 462 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  35.27 
 
 		 464 aa  183  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  40.86 
 
 		 257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  37.45 
 
 		 264 aa  182  6e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  36.72 
 
 		 458 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  35.94 
 
 		 256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  38.67 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  35.43 
 
 		 462 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  35.94 
 
 		 458 aa  177  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  37.74 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  37.4 
 
 		 256 aa  176  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  34.9 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0740  hydrolase, TatD family  36.82 
 
 		 270 aa  175  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0308  hydrolase, TatD family  36.22 
 
 		 254 aa  175  7e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  36.86 
 
 		 457 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  35.04 
 
 		 606 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1779  hydrolase, TatD family  37.07 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1752  hydrolase, TatD family  37.07 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0489  hydrolase, TatD family  39.38 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.868901 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0316  TatD family hydrolase  38.49 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  0.040307 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  37.4 
 
 		 258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16661  TatD family deoxyribonuclease  36.9 
 
 		 264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  37.45 
 
 		 264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  35.02 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  36.08 
 
 		 253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3632  hydrolase, TatD family  35.43 
 
 		 262 aa  172  5.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.508824  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  35.83 
 
 		 259 aa  172  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  35.46 
 
 		 256 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  37.01 
 
 		 258 aa  171  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  34.9 
 
 		 461 aa  171  9e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  37.01 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  34.66 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2940  Sec-independent protein translocase TatD  37.35 
 
 		 273 aa  170  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.355408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16771  TatD family deoxyribonuclease  37.3 
 
 		 264 aa  169  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  37.55 
 
 		 265 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  37.8 
 
 		 258 aa  169  4e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  37.85 
 
 		 257 aa  169  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0910  TatD family hydrolase  35.83 
 
 		 251 aa  168  6e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0567  hydrolase, TatD family  37.25 
 
 		 256 aa  168  7e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2645  TatD family hydrolase  39.2 
 
 		 262 aa  168  7e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  38.67 
 
 		 261 aa  168  7e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  37.74 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1227  hydrolase, TatD family  37.6 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  35.32 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  38.25 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  37.5 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  36.36 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  37.35 
 
 		 258 aa  165  5.9999999999999996e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  37.6 
 
 		 262 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  38 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  37.4 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  37.4 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  34.38 
 
 		 259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  36.33 
 
 		 256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  32.41 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  35.69 
 
 		 459 aa  163  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1985  TatD family hydrolase  38.8 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  34.78 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1664  TatD family hydrolase  37.4 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3661  TatD family hydrolase  34.52 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>