More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0605 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0605  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  431  1e-120  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0553008  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  33.16 
 
 		 237 aa  88.2  9e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  29.58 
 
 		 211 aa  88.2  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0664  hypothetical protein  28.5 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  27.94 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  28.78 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1229  hypothetical protein  26.24 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.119294  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0446  hypothetical protein  27.89 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101815  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  31.48 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  29.17 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  28.12 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  28.65 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  26.85 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0565  SNARE associated Golgi protein  28 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000222667  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  25.58 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  28.12 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  27.75 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  28.57 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  28.57 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.57 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  28.57 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  28.57 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  28.57 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  26.83 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  26.83 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  26.83 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  26.83 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  27.7 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  28.57 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  28.12 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0994  DedA family protein  28.92 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0484  hypothetical protein  30.32 
 
 		 215 aa  74.7  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.849747  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  30.19 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  26.63 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  26.63 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  26.63 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  31.95 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  27.6 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4444  SNARE associated Golgi protein  27.84 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  27.56 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0687  DedA family protein, putative  27.89 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00613405  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  30.91 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  26.98 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  28.26 
 
 		 224 aa  72  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  32.1 
 
 		 244 aa  71.6  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  30.41 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.37 
 
 		 209 aa  71.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  27.32 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1159  dedA protein  27.71 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000684044  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1922  hypothetical protein  28.57 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000155723  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  31.5 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  28.98 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  31.77 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  29.41 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  33.13 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3305  DedA protein (DSG-1 protein)  27.94 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25714  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  27.75 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  29.32 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  26.35 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02320  uncharacterized membrane-associated protein  32.03 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.631494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35260  uncharacterized membrane-associated protein  29.06 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27115  predicted protein  26.92 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000197052  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  29.76 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  30.68 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  27.06 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2425  hypothetical protein  30.57 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0706  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.63 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.240923  normal  0.524025 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  27.06 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0210  hypothetical protein  26.63 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0557  DedA family protein  31.21 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.565091  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1626  SNARE associated Golgi protein  27.18 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  27.11 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0086  SNARE associated Golgi protein  31.06 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.862215  hitchhiker  0.00916794 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  29.56 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0602  SNARE associated Golgi protein  28.86 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.688276 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3600  SNARE associated Golgi protein  24.59 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4182  SNARE associated Golgi protein  24.37 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.989097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  29.31 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  25.71 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5157  SNARE associated Golgi protein  30.05 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  27.65 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  28.74 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1299  hypothetical protein  28.93 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.724707  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  26.97 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  27.64 
 
 		 363 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0751  SNARE associated Golgi protein  29.44 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3388  SNARE associated Golgi protein  28.73 
 
 		 224 aa  62  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3208  DedA protein (DSG-1 protein)  27.7 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.043821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0743  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.38 
 
 		 227 aa  62  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  25.84 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0244  SNARE associated Golgi protein  29.27 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.052895  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  27.62 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.01 
 
 		 286 aa  61.6  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3417  inner membrane protein YqjA  29.51 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3487  inner membrane protein YqjA  29.51 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4325  SNARE associated Golgi protein  28.74 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.329585 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3583  inner membrane protein YqjA  29.51 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0452465  normal  0.251546 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2349  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.44 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.913999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01570  uncharacterized membrane-associated protein  29.75 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>