More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0456 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0456  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 462 aa  905    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.21 
 
 		 485 aa  270  4e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1853  major facilitator superfamily permease  34.64 
 
 		 471 aa  259  7e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0360  major facilitator transporter  35.26 
 
 		 461 aa  247  3e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1423  major facilitator superfamily permease  33.41 
 
 		 464 aa  246  6.999999999999999e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.904673  hitchhiker  0.0000661431 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0049  sugar efflux permease  32.47 
 
 		 485 aa  218  1e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0290  major facilitator superfamily permease  28.13 
 
 		 463 aa  216  9e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.146864  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1628  major facilitator superfamily permease  31.92 
 
 		 457 aa  209  7e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0280  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 466 aa  202  9.999999999999999e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040332  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1088  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.7 
 
 		 446 aa  201  3e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1471  major facilitator superfamily permease  34.53 
 
 		 454 aa  199  6e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00462633  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0937  major facilitator superfamily permease  31.22 
 
 		 463 aa  199  7e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.343736  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0963  major facilitator superfamily permease  28.33 
 
 		 449 aa  197  3e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.337437  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1318  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.82 
 
 		 465 aa  195  2e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1003  lincomycin resistance protein LmrB  29.95 
 
 		 480 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.2001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0734  lincomycin resistance protein  29.71 
 
 		 480 aa  183  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.498733  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1468  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.44 
 
 		 491 aa  179  7e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.986472  normal  0.151461 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1519  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.56 
 
 		 502 aa  179  1e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2014  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.81 
 
 		 513 aa  178  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3232  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.84 
 
 		 513 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3251  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.58 
 
 		 492 aa  176  7e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.87 
 
 		 492 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2922  multidrug resistance protein B  29.11 
 
 		 492 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2937  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.11 
 
 		 492 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2982  multidrug resistance protein B  28.87 
 
 		 492 aa  172  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.13 
 
 		 492 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.13 
 
 		 492 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0356226  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3230  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.64 
 
 		 492 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2440  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.8 
 
 		 479 aa  169  7e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2488  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.8 
 
 		 479 aa  169  7e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.82 
 
 		 635 aa  168  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0959  permease, general substrate transporter  29.85 
 
 		 482 aa  168  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0281229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0949  permease, general substrate transporter  29.61 
 
 		 482 aa  168  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000025972  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0971  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.85 
 
 		 482 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1038  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.85 
 
 		 482 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1833  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.34 
 
 		 564 aa  166  8e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0281974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1116  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.61 
 
 		 482 aa  166  8e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000271146 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22510  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.65 
 
 		 494 aa  162  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.319093  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0877  major facilitator superfamily permease  27.71 
 
 		 496 aa  160  3e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.192576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0888  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.93 
 
 		 486 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.93 
 
 		 486 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0725  major facilitator superfamily permease  28.88 
 
 		 490 aa  156  8e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.29773 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.25 
 
 		 491 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1028  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.02 
 
 		 491 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10576e-22 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1863  major facilitator superfamily permease  27.88 
 
 		 465 aa  155  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0147099  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.47 
 
 		 561 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0683901  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2448  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.91 
 
 		 570 aa  154  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1459  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.22 
 
 		 483 aa  154  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.257317  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4325  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.02 
 
 		 491 aa  153  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0988  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.7 
 
 		 491 aa  153  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.55 
 
 		 579 aa  153  7e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1115  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.57 
 
 		 491 aa  153  8e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.02 
 
 		 479 aa  152  8.999999999999999e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.239731  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06270  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.27 
 
 		 490 aa  152  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05820  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.69 
 
 		 510 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.835158  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2340  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.04 
 
 		 472 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4699  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.61 
 
 		 599 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.98 
 
 		 657 aa  148  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0561  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.61 
 
 		 599 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000151463  hitchhiker  0.00000000000000678179 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2424  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.16 
 
 		 496 aa  147  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.153591 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.22 
 
 		 658 aa  146  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0659  permease of the major facilitator superfamily  28.13 
 
 		 683 aa  146  8.000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4676  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.98 
 
 		 599 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00195609  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4692  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.98 
 
 		 599 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000143582  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2739  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.85 
 
 		 482 aa  144  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000169232  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4399  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.41 
 
 		 597 aa  143  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00696651  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4464  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.73 
 
 		 599 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.737474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4299  multidrug resistance protein B  30.49 
 
 		 599 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.649426  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4310  multidrug resistance protein B  30.73 
 
 		 599 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4812  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.73 
 
 		 599 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.127812  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3194  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.31 
 
 		 484 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.794509  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.88 
 
 		 579 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4683  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.49 
 
 		 599 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.74665e-44 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02600  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.62 
 
 		 505 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1238  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.45 
 
 		 485 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0268  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.41 
 
 		 500 aa  140  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0312698  decreased coverage  0.00157172 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.97 
 
 		 490 aa  139  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.12 
 
 		 492 aa  139  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1304  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.83 
 
 		 485 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.153867 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0845  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.02 
 
 		 489 aa  136  7.000000000000001e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222515  normal  0.167552 
 
 
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NC_003295  RSc1365  putative multidrug resistance-like efflux transmembrane protein  28.82 
 
 		 487 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.816308  normal  1 
 
 
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NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.42 
 
 		 524 aa  136  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_30030  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.01 
 
 		 487 aa  134  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00171806  normal  1 
 
 
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NC_011830  Dhaf_1686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.5 
 
 		 620 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.892029  n/a   
 
 
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NC_013170  Ccur_08630  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.13 
 
 		 509 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.315329 
 
 
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NC_008541  Arth_0161  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.47 
 
 		 494 aa  134  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.53 
 
 		 514 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009632  SaurJH1_2236  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.13 
 
 		 481 aa  130  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.126562  n/a   
 
 
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NC_009487  SaurJH9_2198  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.13 
 
 		 481 aa  130  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0460557  n/a   
 
 
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NC_009632  SaurJH1_2422  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.34 
 
 		 643 aa  130  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.845412  n/a   
 
 
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NC_009487  SaurJH9_2376  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.34 
 
 		 643 aa  130  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.17 
 
 		 477 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.59 
 
 		 534 aa  130  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
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NC_009727  CBUD_0782  multidrug resistance protein B  28.04 
 
 		 520 aa  129  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_0617  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.06 
 
 		 543 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004116  SAG1707  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.38 
 
 		 499 aa  127  5e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00395265  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I0752  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.49 
 
 		 508 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_3099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.5 
 
 		 491 aa  125  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013204  Elen_2667  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.14 
 
 		 485 aa  125  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0905281  normal  0.424193 
 
 
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NC_013947  Snas_5520  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.4 
 
 		 502 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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