159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0377 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0377  protein translocase subunit yajC  100 
 
 
120 aa  243  9e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.26742  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1288  protein translocase subunit yajC  48.86 
 
 
120 aa  90.1  9e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1917  preprotein translocase subunit YajC  46.88 
 
 
113 aa  89  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000185631  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0530  protein translocase subunit yajC  43.42 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0416  preprotein translocase subunit YajC  38.83 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  46.84 
 
 
91 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2436  hypothetical protein  44.71 
 
 
110 aa  72  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000321077  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  44.3 
 
 
90 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3175  preprotein translocase, YajC subunit  38.1 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0243  preprotein translocase, YajC subunit, putative  37.6 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000181073  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  46.03 
 
 
102 aa  61.6  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  38.71 
 
 
117 aa  60.8  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  37.63 
 
 
118 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  36.71 
 
 
118 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1202  preprotein translocase, YajC subunit  27.85 
 
 
86 aa  57.4  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.36693  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  32.94 
 
 
137 aa  57  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  37.97 
 
 
117 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3825  preprotein translocase YajC subunit  40.26 
 
 
123 aa  57  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0618005  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  35.44 
 
 
118 aa  57  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1695  preprotein translocase, YajC subunit  31.33 
 
 
86 aa  57  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1728  preprotein translocase, YajC subunit  31.33 
 
 
86 aa  57  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136772  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3133  preprotein translocase subunit YajC  37.04 
 
 
86 aa  57  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15090  preprotein translocase, YajC subunit  35.85 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0219  preprotein translocase, YajC subunit  39.24 
 
 
118 aa  56.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.780199  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  48.33 
 
 
118 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0275  preprotein translocase, YajC subunit  43.84 
 
 
110 aa  55.1  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000715247  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4550  preprotein translocase subunit YajC  37.04 
 
 
86 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000437166  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4501  preprotein translocase subunit YajC  37.04 
 
 
86 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906179  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4311  preprotein translocase subunit YajC  37.04 
 
 
86 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000102118  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4149  preprotein translocase subunit YajC  37.04 
 
 
86 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000425836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4646  preprotein translocase subunit YajC  37.04 
 
 
86 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00688005  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4496  preprotein translocase subunit YajC  37.04 
 
 
86 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000482906 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  44.16 
 
 
111 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4263  preprotein translocase subunit YajC  38.27 
 
 
86 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4160  preprotein translocase subunit YajC  37.04 
 
 
86 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152675  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0700  preprotein translocase subunit YajC  35.8 
 
 
86 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000310911  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4535  preprotein translocase subunit YajC  37.04 
 
 
86 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000852882  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  51.02 
 
 
91 aa  53.5  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1694  preprotein translocase, YajC subunit  39.29 
 
 
133 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0727  preprotein translocase subunit YajC  38.81 
 
 
93 aa  52.8  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0798345  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6327  preprotein translocase, YajC subunit  40.51 
 
 
108 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  39.02 
 
 
108 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  34.82 
 
 
112 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1622  preprotein translocase, YajC subunit  42.67 
 
 
91 aa  51.2  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  37.8 
 
 
108 aa  50.8  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  37.8 
 
 
108 aa  50.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  39.66 
 
 
106 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  37.8 
 
 
108 aa  50.8  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  37.8 
 
 
108 aa  50.8  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  37.8 
 
 
108 aa  50.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  37.8 
 
 
108 aa  50.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  37.8 
 
 
108 aa  50.8  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4927  preprotein translocase, YajC subunit  41.18 
 
 
84 aa  50.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.354289  normal  0.425395 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0513  protein translocase subunit yajC  38.81 
 
 
106 aa  50.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2443  protein translocase subunit yajC  32.05 
 
 
101 aa  50.8  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0348045  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2582  preprotein translocase subunit YajC  39.02 
 
 
115 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162406  normal  0.640606 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12608  preprotein translocase subunit YajC  31.67 
 
 
115 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0597309  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  39.13 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1165  preprotein translocase subunit  29.89 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000132016  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1194  protein translocase subunit yajC  28.74 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00219424  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12870  preprotein translocase, YajC subunit  26.83 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.195332  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1237  preprotein translocase subunit YajC  47.92 
 
 
90 aa  49.3  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.371648  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  36.59 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  36.59 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  36.07 
 
 
119 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1576  preprotein translocase subunit YajC  33.73 
 
 
88 aa  48.9  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  30.77 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  36.59 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  36.59 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  36.59 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  36.59 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1112  preprotein translocase subunit YajC  47.92 
 
 
90 aa  49.3  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.217114  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0629  preprotein translocase subunit YajC  47.92 
 
 
90 aa  49.3  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  36.59 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  36.36 
 
 
105 aa  48.9  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  39.13 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0454  preprotein translocase subunit  32.2 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00883496  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  34.62 
 
 
106 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  35.37 
 
 
109 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  33.75 
 
 
107 aa  47.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3817  preprotein translocase subunit YajC  33.33 
 
 
110 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0436653  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  39.29 
 
 
112 aa  47.4  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2275  preprotein translocase subunit YajC  33.33 
 
 
117 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2322  preprotein translocase subunit YajC  33.33 
 
 
117 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.90527  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2314  preprotein translocase subunit YajC  33.33 
 
 
117 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19372  normal  0.374026 
 
 
-
 
NC_002936  DET1384  preprotein translocase, YajC subunit  28.74 
 
 
92 aa  46.2  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000396106  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  31.86 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0420  hypothetical protein  30.51 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  34.78 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  34.38 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  30.23 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0147  preprotein translocase, YajC subunit  34.72 
 
 
101 aa  45.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000391893  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0542  preprotein translocase, YajC subunit  36.07 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0292946 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  30 
 
 
108 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6110  preprotein translocase subunit YajC, putative  31.33 
 
 
121 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.249779 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0070  preprotein translocase subunit YajC  42.59 
 
 
90 aa  45.4  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0682  preprotein translocase YajC subunit  37.5 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1348  preprotein translocase, YajC subunit  29.63 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1372  protein translocase subunit yajC  30.12 
 
 
155 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0477  preprotein translocase subunit YajC  36.84 
 
 
90 aa  45.4  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>