More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0345 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  100 
 
 		 239 aa  490  9.999999999999999e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  52.94 
 
 		 238 aa  275  4e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  57.5 
 
 		 241 aa  272  3e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826958  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  52.5 
 
 		 237 aa  257  9e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  51.88 
 
 		 239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  51.88 
 
 		 239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  52.3 
 
 		 239 aa  253  3e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  52.3 
 
 		 239 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  52.3 
 
 		 239 aa  253  3e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  52.3 
 
 		 239 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  52.3 
 
 		 239 aa  253  3e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  52.3 
 
 		 239 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  51.88 
 
 		 239 aa  250  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5275  16S rRNA methyltransferase GidB  51.05 
 
 		 239 aa  247  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1744  16S rRNA methyltransferase GidB  51.46 
 
 		 239 aa  244  9.999999999999999e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000198478  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1629  16S rRNA methyltransferase GidB  52.1 
 
 		 237 aa  240  1e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0438642  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  49.37 
 
 		 238 aa  237  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  51.88 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3555  16S rRNA methyltransferase GidB  49.37 
 
 		 238 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  49.37 
 
 		 239 aa  230  1e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  48.95 
 
 		 239 aa  230  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  48.95 
 
 		 239 aa  230  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0112  cell division SAM-dependent methyltransferase  45.8 
 
 		 242 aa  226  4e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  46.61 
 
 		 240 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  44.68 
 
 		 242 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  46.58 
 
 		 241 aa  218  7.999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  47.56 
 
 		 239 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  47.68 
 
 		 242 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_682  methyltransferase  46.38 
 
 		 235 aa  211  7e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  45.98 
 
 		 240 aa  208  6e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  43.83 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0702  16S rRNA methyltransferase GidB  42.68 
 
 		 256 aa  200  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  40.93 
 
 		 238 aa  199  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  42.67 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3195  methyltransferase GidB  43.24 
 
 		 244 aa  193  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  43.61 
 
 		 236 aa  192  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  42.24 
 
 		 239 aa  192  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0776  16S rRNA methyltransferase GidB  44.75 
 
 		 253 aa  191  7e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.115198  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  41.33 
 
 		 234 aa  190  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  40.26 
 
 		 240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2231  methyltransferase GidB  40.61 
 
 		 240 aa  189  4e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1555  methyltransferase GidB  40.52 
 
 		 240 aa  181  6e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126282  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2147  methyltransferase GidB  38.1 
 
 		 241 aa  181  8.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2335  16S rRNA methyltransferase GidB  40.64 
 
 		 245 aa  179  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2517  methyltransferase GidB  42.04 
 
 		 240 aa  178  4.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00460923  hitchhiker  0.00173513 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3051  methyltransferase GidB  41.47 
 
 		 242 aa  175  4e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.014233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1851  methyltransferase GidB  37.61 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3880  16S rRNA methyltransferase GidB  39.73 
 
 		 245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.480171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  35.98 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  42.13 
 
 		 210 aa  170  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2084  methyltransferase GidB  37.78 
 
 		 240 aa  168  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1084  methyltransferase GidB  40.25 
 
 		 231 aa  167  2e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0878  methyltransferase GidB  39.19 
 
 		 243 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2128  methyltransferase GidB  37.33 
 
 		 240 aa  164  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.792782 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0752  methyltransferase GidB  39.07 
 
 		 251 aa  163  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0267  16S rRNA methyltransferase GidB  37.04 
 
 		 242 aa  161  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3772  16S rRNA methyltransferase GidB  38.05 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494361  normal  0.0574079 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_12955  predicted protein  38.73 
 
 		 205 aa  160  2e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2943  methyltransferase GidB  39.33 
 
 		 239 aa  158  7e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1005  16S rRNA methyltransferase GidB  39.11 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2756  methyltransferase GidB  37.85 
 
 		 238 aa  155  7e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0251  methyltransferase GidB  36.32 
 
 		 231 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18741  16S rRNA methyltransferase GidB  39.11 
 
 		 248 aa  151  7e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.947759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2928  methyltransferase GidB  34.3 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0221  methyltransferase GidB  37.33 
 
 		 228 aa  142  4e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  38.64 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0223  methyltransferase GidB  36.44 
 
 		 228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15951  16S rRNA methyltransferase GidB  36.54 
 
 		 236 aa  138  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4426  methyltransferase GidB  37.86 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3211  methyltransferase GidB  35.47 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4009  methyltransferase GidB  38.34 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00213525  hitchhiker  0.00000000363002 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4056  methyltransferase GidB  36.89 
 
 		 217 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4146  methyltransferase GidB  36.41 
 
 		 217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1364  methyltransferase GidB  37.07 
 
 		 252 aa  132  5e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.571153  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl662  16S rRNA methyltransferase GidB  36.54 
 
 		 237 aa  132  5e-30  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16651  putative glucose inhibited division protein B  28.57 
 
 		 237 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16771  putative glucose inhibited division protein B  29.02 
 
 		 237 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3620  methyltransferase GidB  36.84 
 
 		 221 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3558  glucose inhibited division protein  29.36 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1778  methyltransferase GidB  33.64 
 
 		 213 aa  119  4.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3639  methyltransferase GidB  33.98 
 
 		 215 aa  116  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2570  methyltransferase GidB  33.65 
 
 		 214 aa  116  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000427006  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0327  methyltransferase GidB  32.74 
 
 		 225 aa  116  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31930  glucose-inhibited division protein B  36.17 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26990  glucose-inhibited division protein B  32.65 
 
 		 241 aa  112  7.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04501  16S rRNA methyltransferase GidB  33.05 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0044  16S rRNA methyltransferase GidB  32.51 
 
 		 236 aa  108  6e-23  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1568  methyltransferase GidB  27.23 
 
 		 237 aa  108  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.975144  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16551  putative glucose inhibited division protein B  29.27 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3985  methyltransferase GidB  37.5 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3590  methyltransferase GidB  34.91 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7334  16S rRNA methyltransferase GidB  35.98 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3140  methyltransferase GidB  32.27 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0154  methyltransferase GidB  29.91 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0574713  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9385  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell division-like protein  36.36 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0617  16S rRNA methyltransferase GidB  31.76 
 
 		 243 aa  106  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1192  methyltransferase GidB  33.63 
 
 		 246 aa  106  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0331382  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9051  16S rRNA methyltransferase GidB  34.52 
 
 		 245 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0166723  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3463  glucose-inhibited division protein B  31.73 
 
 		 217 aa  105  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  35.63 
 
 		 210 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>