More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_12850 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  100 
 
 		 618 aa  1225    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.479998  normal  0.0267692 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1158  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  54.92 
 
 		 614 aa  654    Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0064562  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3183  ABC transporter related protein  55.34 
 
 		 615 aa  630  1e-179  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0496576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2882  ABC transporter related protein  55.52 
 
 		 600 aa  619  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00823072  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3033  ABC transporter related  56.63 
 
 		 602 aa  608  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20800  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  54.1 
 
 		 635 aa  599  1e-170  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.464481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3978  ABC transporter related protein  55.19 
 
 		 590 aa  597  1e-169  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2230  ABC transporter related  55.84 
 
 		 593 aa  592  1e-168  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1445  ABC transporter-like protein  55.88 
 
 		 609 aa  585  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5717  ABC transporter related  52.28 
 
 		 620 aa  575  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1494  ABC transporter related protein  55.65 
 
 		 595 aa  568  1e-160  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.648483  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2929  ABC transporter related protein  55.56 
 
 		 590 aa  561  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  0.358264 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4361  ABC transporter related  56.12 
 
 		 581 aa  557  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3406  ABC transporter related  53.02 
 
 		 593 aa  544  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169933  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27250  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  48.15 
 
 		 626 aa  530  1e-149  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3180  ABC transporter related  51.8 
 
 		 589 aa  526  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3227  ABC transporter related protein  52.22 
 
 		 609 aa  525  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.393011  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1210  ABC transporter related  49.58 
 
 		 615 aa  521  1e-146  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.269733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1926  ABC transporter related  52.57 
 
 		 588 aa  520  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1994  ABC transporter related protein  53.69 
 
 		 616 aa  510  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0769116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  36.23 
 
 		 1218 aa  299  8e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3763  ABC transporter related  39.79 
 
 		 984 aa  298  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.849502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  35.66 
 
 		 614 aa  294  3e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  34.23 
 
 		 610 aa  293  7e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  34.05 
 
 		 610 aa  291  3e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  34.05 
 
 		 610 aa  291  3e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  31.41 
 
 		 587 aa  290  4e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  35.91 
 
 		 614 aa  288  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  29.81 
 
 		 598 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  31.48 
 
 		 607 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  31.53 
 
 		 605 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  30.49 
 
 		 597 aa  283  8.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  32.38 
 
 		 600 aa  279  9e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  34.17 
 
 		 622 aa  278  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  33.6 
 
 		 636 aa  278  3e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.13 
 
 		 598 aa  277  4e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.66 
 
 		 1257 aa  277  4e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  36.61 
 
 		 608 aa  277  5e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  31.37 
 
 		 598 aa  277  5e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  35.44 
 
 		 605 aa  277  5e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  33.99 
 
 		 617 aa  276  7e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.78 
 
 		 598 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.16 
 
 		 598 aa  275  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  32.62 
 
 		 591 aa  274  3e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  31.69 
 
 		 671 aa  275  3e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  34.88 
 
 		 619 aa  274  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  31.37 
 
 		 598 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.37 
 
 		 598 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0949  ABC transporter related  32.61 
 
 		 625 aa  274  4.0000000000000004e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.37 
 
 		 598 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1554  ABC transporter related  33.94 
 
 		 612 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.138935  hitchhiker  0.00285078 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.37 
 
 		 598 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  36.57 
 
 		 1436 aa  273  5.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.16 
 
 		 598 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1275  ABC transporter related protein  34.74 
 
 		 576 aa  271  2.9999999999999997e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2029  ABC transporter related  36.4 
 
 		 1230 aa  271  2.9999999999999997e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12051  multidrug ABC transporter  31.61 
 
 		 590 aa  270  4e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.18 
 
 		 598 aa  270  5e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  31.48 
 
 		 590 aa  270  5e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.54 
 
 		 589 aa  270  8e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  32.95 
 
 		 764 aa  270  8e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  30.05 
 
 		 617 aa  269  1e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  29.91 
 
 		 572 aa  269  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0828  ABC transporter related  30.51 
 
 		 596 aa  268  2e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  30.54 
 
 		 582 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1110  ATPase  30.99 
 
 		 590 aa  267  4e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.551514  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  33.7 
 
 		 606 aa  267  4e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  36.35 
 
 		 620 aa  267  4e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0658  ABC transporter related  35.22 
 
 		 750 aa  267  5e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  29.63 
 
 		 587 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  32.74 
 
 		 628 aa  266  1e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0637  ABC transporter related  35.02 
 
 		 770 aa  266  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57887  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  34.3 
 
 		 625 aa  265  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  32.74 
 
 		 596 aa  265  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  30.07 
 
 		 572 aa  265  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.09 
 
 		 618 aa  265  2e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  30.84 
 
 		 618 aa  265  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.64 
 
 		 572 aa  264  4e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  33.16 
 
 		 602 aa  264  4e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  29.27 
 
 		 572 aa  264  4.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  32.84 
 
 		 1284 aa  264  4.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  27.94 
 
 		 597 aa  263  8e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  30.88 
 
 		 600 aa  263  8e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12061  multidrug ABC transporter  30.99 
 
 		 590 aa  263  8e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  29.27 
 
 		 572 aa  263  8.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  31.62 
 
 		 1522 aa  262  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  35.5 
 
 		 595 aa  262  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3955  ABC transporter, transmembrane region  36.08 
 
 		 631 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375009  decreased coverage  0.0046772 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  32.04 
 
 		 620 aa  262  2e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  33.39 
 
 		 606 aa  261  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  28.99 
 
 		 584 aa  261  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1432  ABC transporter related protein  35.24 
 
 		 661 aa  260  4e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.590543  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  32.06 
 
 		 607 aa  261  4e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3979  ABC transporter-related protein  33.13 
 
 		 773 aa  260  5.0000000000000005e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1143  ABC transporter related  32.5 
 
 		 565 aa  260  6e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.4551 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  31.48 
 
 		 601 aa  259  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1402  ATPase  32.34 
 
 		 619 aa  259  1e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.387875  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3941  ABC transporter, transmembrane region  35.69 
 
 		 631 aa  259  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  31.48 
 
 		 601 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  31.15 
 
 		 597 aa  259  1e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>