More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_08580 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_08580  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  100 
 
 
467 aa  935    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.745964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2050  mycothione reductase  48.28 
 
 
470 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2067  mycothione reductase  48.28 
 
 
470 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.159989  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4054  mycothione reductase  48.49 
 
 
470 aa  410  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.703366  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2113  mycothione reductase  48.28 
 
 
470 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207955  normal  0.0141084 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2298  mycothione reductase  46.38 
 
 
469 aa  411  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.270268 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2130  mycothione reductase  46.98 
 
 
464 aa  397  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.503615  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12870  mycothione reductase  47.3 
 
 
459 aa  395  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.135712  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10080  mycothione reductase  45.44 
 
 
466 aa  376  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0975361  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09170  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  44.09 
 
 
475 aa  372  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283418  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05900  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.97 
 
 
477 aa  374  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.257436 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2195  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  45.57 
 
 
469 aa  375  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000774241  hitchhiker  0.00141169 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5878  mycothione reductase  45.92 
 
 
460 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5390  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  45.49 
 
 
465 aa  366  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.685666 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1696  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  44.26 
 
 
469 aa  362  9e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142602  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1643  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  45.36 
 
 
474 aa  347  2e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000472029 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13800  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  42.83 
 
 
487 aa  328  1.0000000000000001e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.162356  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3488  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.49 
 
 
478 aa  327  4.0000000000000003e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.531012  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0265  mycothione reductase  41.7 
 
 
468 aa  324  3e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1256  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.9 
 
 
487 aa  251  2e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2738  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  36.92 
 
 
488 aa  249  5e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3630  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36.81 
 
 
536 aa  239  1e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.353308  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0256  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  34.45 
 
 
484 aa  237  3e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0903  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.12 
 
 
462 aa  232  1e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0842  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.42 
 
 
457 aa  226  9e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.754028  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  30.7 
 
 
460 aa  224  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.7 
 
 
463 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2928  glutathione reductase  34.93 
 
 
452 aa  220  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00793619  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.19 
 
 
459 aa  219  7.999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3819  glutathione reductase  34.94 
 
 
451 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218299  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3535  glutathione reductase  34.7 
 
 
451 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0669246 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3188  glutathione reductase  34.02 
 
 
451 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1950  glutathione reductase  35.17 
 
 
451 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.447652  normal  0.37845 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.94 
 
 
459 aa  214  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4254  glutathione reductase  33.72 
 
 
466 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25010  glutathione reductase  35.39 
 
 
452 aa  213  5.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1783  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.62 
 
 
475 aa  211  3e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38330  glutathione reductase  33.71 
 
 
451 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0328915 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  30.74 
 
 
460 aa  210  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2351  glutathione reductase  33.26 
 
 
452 aa  209  6e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150308  normal  0.0125633 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5056  mercuric reductase  31.05 
 
 
459 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135768 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3263  glutathione reductase  33.72 
 
 
451 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02078  mercuric reductase  31.83 
 
 
459 aa  206  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01408  putative mercuric reductase  31.17 
 
 
479 aa  206  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3112  glutathione reductase  33.49 
 
 
452 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.091737  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3551  mercuric reductase  32.83 
 
 
458 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  normal  0.343975 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1608  glutathione reductase  32.11 
 
 
452 aa  204  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128494  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5390  mercuric reductase  32.83 
 
 
458 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2516  glutathione-disulfide reductase  33.79 
 
 
446 aa  204  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2696  glutathione-disulfide reductase  32.64 
 
 
460 aa  203  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719185  normal  0.0349203 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1496  mercuric reductase  32.04 
 
 
467 aa  203  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.7 
 
 
475 aa  203  6e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14591  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.04 
 
 
479 aa  203  6e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.024787  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0314  hypothetical protein  30.72 
 
 
464 aa  202  9e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0507  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.34 
 
 
464 aa  202  9e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.82 
 
 
458 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4715  mercuric reductase  31.97 
 
 
459 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3648  mercuric reductase  31.97 
 
 
459 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.948829 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0283  mercuric reductase  31.83 
 
 
590 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0194  mercuric reductase  31.97 
 
 
459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.67 
 
 
458 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1652  mercuric reductase  31.97 
 
 
459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0298  hypothetical protein  30.65 
 
 
464 aa  201  3e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3872  mercuric reductase  31.76 
 
 
459 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.429317 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1198  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.37 
 
 
479 aa  201  3e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217034  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0385  mercuric reductase  30.47 
 
 
459 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.76 
 
 
616 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1824  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.08 
 
 
469 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.372731  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1394  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.26 
 
 
479 aa  199  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14971  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.04 
 
 
479 aa  199  7.999999999999999e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.223464  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2979  glutathione reductase  33.03 
 
 
452 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0361278  normal  0.327486 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2463  mercuric reductase  30.19 
 
 
459 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.736078 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1095  glutathione-disulfide reductase  30.43 
 
 
460 aa  199  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.223789  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5011  mercuric reductase  31.76 
 
 
459 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1035  normal  0.205591 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2696  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.25 
 
 
476 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.303551  normal  0.202311 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14831  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.26 
 
 
479 aa  197  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.509805  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1496  mercuric reductase  32.12 
 
 
466 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.32667 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.95 
 
 
463 aa  196  7e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1359  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.79 
 
 
453 aa  194  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.485419  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3468  mercuric reductase  32.19 
 
 
457 aa  194  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211907  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0168  putative mercuric reductase  31.04 
 
 
550 aa  193  5e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  27.18 
 
 
457 aa  193  6e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00285558  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1509  mercuric reductase  31.49 
 
 
461 aa  192  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344309  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4011  mercuric reductase  31.57 
 
 
459 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0854657  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.65 
 
 
465 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3897  mercuric reductase  31.57 
 
 
459 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.423332 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2347  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.62 
 
 
475 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.51 
 
 
492 aa  191  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2301  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.83 
 
 
466 aa  190  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0108496  hitchhiker  0.00487639 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.93 
 
 
478 aa  190  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.93 
 
 
478 aa  190  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4666  glutathione-disulfide reductase  31.62 
 
 
466 aa  190  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2363  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.57 
 
 
457 aa  190  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.651152  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2630  mercuric reductase  31.69 
 
 
466 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4955  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.33 
 
 
452 aa  190  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.94 
 
 
465 aa  188  1e-46  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19781  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.02 
 
 
489 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0364363 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06120  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.19 
 
 
464 aa  188  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140424  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.74 
 
 
468 aa  188  2e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2576  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.84 
 
 
461 aa  187  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.213625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>