222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3774 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3774  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  383  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3882  protein of unknown function DUF179  56.76 
 
 		 191 aa  201  8e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1710  hypothetical protein  57.53 
 
 		 192 aa  194  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0924  hypothetical protein  55.91 
 
 		 193 aa  194  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.127262  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1179  protein of unknown function DUF179  53.76 
 
 		 184 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0188247  normal  0.235234 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2389  hypothetical protein  49.74 
 
 		 198 aa  168  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.468382  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1289  hypothetical protein  53.44 
 
 		 191 aa  166  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1471  hypothetical protein  53.65 
 
 		 205 aa  166  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0367  protein of unknown function DUF179  48.15 
 
 		 192 aa  166  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.584645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7076  hypothetical protein  48.39 
 
 		 193 aa  159  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0987  hypothetical protein  46.56 
 
 		 196 aa  160  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1704  hypothetical protein  47.37 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.77077  hitchhiker  0.00529814 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0923  hypothetical protein  45.5 
 
 		 196 aa  156  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39570  hypothetical protein  46.03 
 
 		 198 aa  154  8e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.336935 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0723  hypothetical protein  45.23 
 
 		 196 aa  153  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5076  protein of unknown function DUF179  46.03 
 
 		 187 aa  145  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10037  hypothetical protein  43.3 
 
 		 202 aa  142  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.739012 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6057  hypothetical protein  41.26 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.229198  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5392  hypothetical protein  43.3 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.891404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5481  hypothetical protein  43.3 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.478764  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5768  hypothetical protein  43.3 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0850  hypothetical protein  41.54 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4219  protein of unknown function DUF179  41.8 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.231215  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5395  hypothetical protein  42.86 
 
 		 190 aa  128  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4833  protein of unknown function DUF179  40.54 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0922435  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0090  protein of unknown function DUF179  42.25 
 
 		 182 aa  119  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0197  protein of unknown function DUF179  42.25 
 
 		 183 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0776  protein of unknown function DUF179  34.59 
 
 		 187 aa  111  7.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2142  protein of unknown function DUF179  35.56 
 
 		 187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1601  hypothetical protein  34.59 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0943857  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0777  protein of unknown function DUF179  33.52 
 
 		 187 aa  105  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1773  transcriptional regulator  32.26 
 
 		 182 aa  104  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.728608  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0885  hypothetical protein  34.78 
 
 		 187 aa  104  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0637  hypothetical protein  32.97 
 
 		 189 aa  99.8  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.500132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1688  protein of unknown function DUF179  32.61 
 
 		 187 aa  94  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7071  protein of unknown function DUF179  30.5 
 
 		 184 aa  90.5  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3631  hypothetical protein  35.98 
 
 		 184 aa  90.1  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  31.69 
 
 		 216 aa  89.7  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  33.16 
 
 		 186 aa  89  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3626  protein of unknown function DUF179  31.44 
 
 		 186 aa  89  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1896  protein of unknown function DUF179  30.41 
 
 		 187 aa  89  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.56007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1237  hypothetical protein  32.28 
 
 		 186 aa  87.8  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_002620  TC0483  hypothetical protein  31.09 
 
 		 190 aa  87.4  1e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.195339  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0413  hypothetical protein  33.68 
 
 		 182 aa  87.4  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4074  protein of unknown function DUF179  30.3 
 
 		 186 aa  87.8  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499752  hitchhiker  0.00807045 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  32.5 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1337  hypothetical protein  30.89 
 
 		 186 aa  85.9  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0174957  hitchhiker  0.000402511 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  30.93 
 
 		 187 aa  85.5  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0140  hypothetical protein  25.79 
 
 		 209 aa  85.5  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2681  hypothetical protein  33.87 
 
 		 187 aa  85.1  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0732107  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  32 
 
 		 193 aa  84.7  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3893  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  84.7  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2850  hypothetical protein  28.87 
 
 		 186 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0726  hypothetical protein  32.31 
 
 		 186 aa  84.3  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  35.23 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3695  protein of unknown function DUF179  30.3 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  29.47 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0331  protein of unknown function DUF179  34.39 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502019  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  28.65 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1432  protein of unknown function DUF179  32.75 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.914919  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1199  hypothetical protein  31.72 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1270  hypothetical protein  31.72 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1200  hypothetical protein  31.72 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0314769  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0940  hypothetical protein  32.85 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.335136  normal  0.481513 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3712  hypothetical protein  31.66 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.081023  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  31.16 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1144  hypothetical protein  28.04 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.496045  normal  0.0336297 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4995  hypothetical protein  32.08 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4869  hypothetical protein  32.08 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147719 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  30.53 
 
 		 190 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2099  hypothetical protein  34.84 
 
 		 189 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.772524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  28.65 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3346  hypothetical protein  33.33 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5045  hypothetical protein  32.08 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5037  hypothetical protein  30.57 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0544  hypothetical protein  26.92 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0299176  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3348  hypothetical protein  31.11 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.142843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0400  hypothetical protein  31.94 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  31 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3034  hypothetical protein  30.46 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000468613  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0505  hypothetical protein  30.23 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1142  hypothetical protein  32.76 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.873097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3019  hypothetical protein  30.46 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00383877  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2674  hypothetical protein  28.65 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000779921  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09628  putative transcriptional regulator  27.37 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.770481  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  31.02 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0501  hypothetical protein  30.1 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.232417  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3910  hypothetical protein  29.47 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0230557  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1132  hypothetical protein  28.18 
 
 		 190 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0485  hypothetical protein  31.63 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1286  hypothetical protein  27.12 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1344  protein of unknown function DUF179  31.18 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0111665  hitchhiker  0.000000000584431 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2524  hypothetical protein  32.02 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.811534  normal  0.166085 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0382  hypothetical protein  32.02 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0864  hypothetical protein  32.02 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0835  hypothetical protein  32.02 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186487  hitchhiker  0.000370502 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3177  hypothetical protein  31.18 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000779638  hitchhiker  0.00595197 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3962  hypothetical protein  31.46 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1361  hypothetical protein  32.65 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4617  protein of unknown function DUF179  30.64 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>