107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0379 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0379  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  100 
 
 
201 aa  398  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00104836  normal  0.131748 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2500  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.22 
 
 
190 aa  145  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.59246 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0340  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.15 
 
 
196 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000331543  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2498  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.84 
 
 
197 aa  137  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2842  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  42.93 
 
 
194 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2685  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.21 
 
 
190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.109845  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0660  cytosine/adenosine deaminase  39.27 
 
 
193 aa  132  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0072  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.84 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1808  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.42 
 
 
191 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.607751  normal  0.0647304 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04619  cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region  38.73 
 
 
186 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0679  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.57 
 
 
186 aa  116  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.602428 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0239  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  37.31 
 
 
186 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000722464  hitchhiker  0.0000000000000386131 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0160  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.23 
 
 
112 aa  80.1  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1498  zinc-binding domain-containing protein  31.79 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.92 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.724864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2805  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  32.88 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0860  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  24.67 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.97 
 
 
183 aa  64.3  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285833  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0857  Guanine deaminase  30.66 
 
 
163 aa  62.8  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  28.87 
 
 
150 aa  62.8  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_7208  predicted protein  32.26 
 
 
123 aa  62  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.472899  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1461  hypothetical protein  29.17 
 
 
159 aa  62  0.000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.252188  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2902  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.77 
 
 
157 aa  62  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000164713  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1532  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  29.17 
 
 
159 aa  62  0.000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00420564  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0107  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.86 
 
 
163 aa  61.2  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0710056 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  27.66 
 
 
157 aa  58.2  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4793  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.1 
 
 
160 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.758133  normal  0.45937 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4602  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein; guanine deaminase  31.43 
 
 
153 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.09 
 
 
155 aa  57.8  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1831  guanine deaminase  24.24 
 
 
149 aa  57  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.358543  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0215  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.37 
 
 
159 aa  57  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2515  guanine deaminase  24.64 
 
 
154 aa  56.6  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479995  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0576  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.68 
 
 
161 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0120  cytosine/adenosine deaminase-like  29.41 
 
 
161 aa  55.8  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.585423  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1066  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.35 
 
 
188 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  31.5 
 
 
156 aa  54.7  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2297  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  32.14 
 
 
155 aa  55.1  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000194857  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4251  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.58 
 
 
157 aa  53.1  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1303  cytosine/adenosine deaminase  24.38 
 
 
148 aa  52.8  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.21 
 
 
160 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3001  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.37 
 
 
145 aa  52  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.341603 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1166  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  29.25 
 
 
190 aa  51.6  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4941  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  34.31 
 
 
168 aa  51.6  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0289  zinc-binding domain-containing protein  32.06 
 
 
137 aa  50.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3424  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.4 
 
 
164 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628106  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2127  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.88 
 
 
168 aa  50.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.31 
 
 
164 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  27.21 
 
 
211 aa  49.7  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2061  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.16 
 
 
158 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448071  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4004  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.41 
 
 
159 aa  49.3  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0207982  hitchhiker  0.00540331 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2923  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.58 
 
 
163 aa  48.5  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3440  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.97 
 
 
152 aa  48.5  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3292  Guanine deaminase  27.12 
 
 
188 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.650383  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1731  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  27.14 
 
 
157 aa  47.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120946  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2788  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.85 
 
 
158 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0654304  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.79 
 
 
161 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37349  predicted protein  30.09 
 
 
170 aa  47  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00419932  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3254  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.81 
 
 
214 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00940  cytosine/adenosine deaminase  32.82 
 
 
175 aa  46.2  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0944  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  29.25 
 
 
160 aa  46.2  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.91853  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1451  putative hydrolase protein  37.5 
 
 
183 aa  45.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.849244 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2814  twin-arginine translocation pathway signal  25.55 
 
 
176 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338742  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  32.61 
 
 
148 aa  45.8  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  32.61 
 
 
148 aa  45.8  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8163  guanine deaminase  36.63 
 
 
157 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.241917 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  35.23 
 
 
163 aa  45.4  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0136  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  34.48 
 
 
157 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1603  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.02 
 
 
161 aa  45.4  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0633824  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4636  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.82 
 
 
146 aa  45.4  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0797  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.58 
 
 
158 aa  45.1  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2814  cytidine/deoxycytidylate deaminase  33.01 
 
 
155 aa  44.7  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1482  cytosine/adenosine deaminase  32.73 
 
 
149 aa  44.7  0.0009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5383  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  32.41 
 
 
152 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2730  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  30.37 
 
 
169 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0144  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  37.11 
 
 
147 aa  44.3  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.263375  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0839  tRNA-adenosine deaminase  37.93 
 
 
151 aa  44.3  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0141  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.87 
 
 
157 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4829  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  41.98 
 
 
160 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1340  cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region  35.8 
 
 
153 aa  43.9  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.296989 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0619  tRNA-adenosine deaminase  27.61 
 
 
174 aa  43.5  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0703101 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1744  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.6 
 
 
186 aa  43.5  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2704  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.3 
 
 
158 aa  43.5  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426066  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0700  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.58 
 
 
157 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192591  normal  0.865877 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.84 
 
 
158 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3479  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.05 
 
 
223 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0019  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  32.95 
 
 
166 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0510921  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0483  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  35.11 
 
 
176 aa  42.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.705581 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1282  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.38 
 
 
156 aa  43.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16352  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2056  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.43 
 
 
169 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0971976  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0024  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  32.95 
 
 
166 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000145543  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4858  cytidine/deoxycytidylate deaminase  32.95 
 
 
167 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5296  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  32.95 
 
 
166 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000172102  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1846  tRNA-adenosine deaminase  33.33 
 
 
177 aa  42.4  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.916039  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.82 
 
 
461 aa  42.4  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0608  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30 
 
 
154 aa  42.4  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.740984  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0022  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  32.95 
 
 
166 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.015213  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1413  tRNA-adenosine deaminase  25 
 
 
156 aa  42  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1331  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.23 
 
 
182 aa  42  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1396  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.23 
 
 
182 aa  42  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.355926  normal  0.109007 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5437  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.3 
 
 
152 aa  41.6  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  normal  0.506194 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>